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來源: 發(fā)布時間:2025-08-30

3)基因/蛋白質(zhì)表達定性或定量檢測在進行分子檢測的過程中,保持核酸和蛋白質(zhì)的完整性至關(guān)重要,因此在取樣過程中,應盡量避免核酸及蛋白質(zhì)的降解。如不注意采樣過程,將會導致樣本中的核酸及蛋白質(zhì)的無差別降解,嚴重影響后續(xù)分子檢測結(jié)果。在條件允許的情況下,樣本在離體后應立刻裝入凍存管內(nèi),并立即放入液氮中進行冷凍。在RNA提取樣本的保存過程中,可以選擇非冷凍型RNA保存液或Trizol試劑進行RNA酶的。針對蛋白質(zhì)提取樣本的保存,我們同樣可以使用商品化的蛋白酶劑進行短期處理。聚合酶鏈式反應(PolymeraseChnReaction,PCR)及免印跡(Westernblotting,WB),這兩種實驗手段是分子學檢測中不可或缺的一部分,也是發(fā)表至關(guān)重要的分子檢測數(shù)據(jù)。PCR主要用來對基因在基因組層面或轉(zhuǎn)錄層面的變化進行定性或定量檢測,而WB則主要用來對某一蛋白質(zhì)的表達進行定量檢測。(4)轉(zhuǎn)錄組學、蛋白質(zhì)組學及代謝組學檢測隨著檢測水平及相關(guān)產(chǎn)業(yè)的不斷發(fā)展,各類組學檢測的價格降低,實驗設(shè)計中也常常運用組學檢測來提升實驗設(shè)計的檔次。在我們進行轉(zhuǎn)錄組學及蛋白質(zhì)組學的檢測過程中,同樣是要首先確保目標RNA或蛋白質(zhì)的片段完整性。常用實驗動物模型按產(chǎn)生原因分為以下5類:自發(fā)性動物模型、誘發(fā)型模型、遺傳工程模型、醫(yī)學模型陰性模型。天津小鼠科研技術(shù)服務服務

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制作該模型的方法為大鼠腹腔麻醉消毒后選取腹部正中切口打開腹腔長約2cm,尋找盲腸,小心分離其遠端與大腸的系膜,在盲腸遠端1/2處用無菌4號絲線緊緊結(jié)扎,并用無菌7號針頭在已結(jié)扎盲腸遠端處貫通穿刺,然后把盲腸推回腹腔,關(guān)閉腹腔。影響因素多數(shù)研究一致認為盲腸結(jié)扎位置是CLP模型中死亡率和疾病嚴重程度的主要決定因素。結(jié)論為:①結(jié)扎25%或以下的盲腸死亡率幾乎為零,為輕度膿毒癥;②結(jié)扎50%~60%的盲腸導致術(shù)后死亡率為60%,為中度膿毒癥;③結(jié)扎75%或以上的盲腸導致小鼠在術(shù)后2~3d內(nèi)全部死亡,為重度膿毒癥。而在不同程度膿毒癥中,死亡主要集中在初的48h內(nèi)。有研究通過改變盲腸結(jié)扎位置和穿刺針直徑來調(diào)節(jié)膿毒癥的嚴重程度,其中提到與結(jié)扎長度小于1cm的小鼠相比,結(jié)扎長度超過1cm的小鼠死亡率增加至100%;增加穿刺針的直徑也使得存活率從100%(22G針)降低至55%(19G針)。結(jié)論為:在上述兩個因素中,盲腸結(jié)扎位置比針頭大小影響更為。CLP誘導的膿毒癥術(shù)后6h即可出現(xiàn)菌血癥,術(shù)后約12h出現(xiàn)膿毒癥相關(guān)臨床癥狀,包括發(fā)熱、寒戰(zhàn)、毛發(fā)豎立、全身無力和活動減少等,術(shù)后18h開始死亡??傊?,在制作CLP模型時。江蘇大鼠科研技術(shù)服務實驗室干貨分享 | TUNEL法檢測細胞凋亡原理和經(jīng)驗.

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是整體甲基化進程所必須的[2]。FTO是ALKB家族的成員,作為個被發(fā)現(xiàn)的去甲基酶,可影響剪切因子SRSF2的RNA結(jié)合能力,進而調(diào)控pre-mRNA的剪切加工過程[3]。目前已發(fā)現(xiàn)FTO調(diào)節(jié)異常與肥胖、大腦畸形和生長遲緩相關(guān),揭示m6A可能對這些疾病具有重要的調(diào)節(jié)功能[4-6]。ALKBH5是ALKB家族中被發(fā)現(xiàn)具有去甲基作用的另一個成員,以RNaseA敏感的方式與核小斑共定位,它可直接催化m6A-甲基化腺苷去除甲基而不同于FTO的氧化去甲基化[7].此外,ALKBH5和它的去甲基化活性影響新生mRNA合的成和剪切效率[7],且ALKBH5敲除雄性小鼠表現(xiàn)出精子發(fā)生異常,這可能是精子發(fā)生相關(guān)基因表達改變的結(jié)果[7]。m6AmRNA修飾執(zhí)行其功能主要通過兩個途徑:精細調(diào)控甲基化轉(zhuǎn)錄本的結(jié)構(gòu),以阻止或誘使蛋白-RNA相互作用;或被直接由m6A結(jié)合蛋白識別,誘發(fā)續(xù)反應。目前一類含有YTH功能結(jié)構(gòu)域的蛋白被鑒定為m6A修飾的結(jié)合蛋白。其中YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3,YTHDC1和YTHDC2己被證實是m6A的結(jié)合蛋白.YTHDF1主要影響m6A修飾基因的翻譯,YTHDF2主要影響m6A修飾基因的降解,而YTHDC1結(jié)合m6A修飾的基因影響其剪接。HNRNPC是一種豐富的核RNA結(jié)合蛋白,參與pre-mRNA的加工[8]。

采用opti-MEM和Lipo3000分別轉(zhuǎn)染含有目的基因的pMSCV-eGFP、VSV、GAG質(zhì)粒及對照載體,每皿加入脂質(zhì)體-質(zhì)粒轉(zhuǎn)染混懸液按購買脂質(zhì)體相關(guān)說明書操作定量。繼續(xù)培養(yǎng)24h。2)24小時后,將培養(yǎng)基更換為新鮮的DMEM完全培養(yǎng)基,放進細胞培養(yǎng)箱繼續(xù)培養(yǎng)48~72h。3)48~72h后收集上層培養(yǎng)液,并過μm濾膜,采用ELISA法對所獲得的慢載體進行滴度測定。如不及時使用可以凍存于-80℃。3、慢轉(zhuǎn)染1)轉(zhuǎn)染前1天將細胞接種6孔培養(yǎng)板,時細胞的融合率約為50%,前需換液,加入1mLDMEM完全培養(yǎng)基。2)冰浴融化后加入相應體積的液及聚凝胺(Polybrene),混勻后放入37℃孵箱中繼續(xù)培養(yǎng)3)4h后補充1mL培養(yǎng)基,14h后換液(24h內(nèi)換液即可)。4)72h后用倒置顯微鏡觀察熒光,監(jiān)測效率,出現(xiàn)較多熒光時將等量的轉(zhuǎn)染細胞和未轉(zhuǎn)染細胞分別加入等濃度Puromycin(Puromycin或其他篩選濃度需要事先摸索)。5)待未轉(zhuǎn)染細胞全部死亡并且可觀察到滿意熒光量時,降低Puromycin濃度培養(yǎng)。也可以挑去單克隆細胞株進行進一步培養(yǎng),以得到滿意的穩(wěn)定表達目的基因的細胞株。6)使用qRT-PCR和Westernblot的方法檢測目的基因的表達量和蛋白水平是否顯著提高。7)由此可得三組細胞株:a.正常細胞株;b.空載載體的細胞株。常用于研究細胞的成瘤能力、細胞的轉(zhuǎn)移、細胞的耐藥和靶分子對腫瘤細胞的發(fā)展的影響等等。

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|基因組DNA擴增|RNA擴增|克隆與表達克隆基因|克隆試劑盒|克隆篩選|感受態(tài)細胞|突變轉(zhuǎn)染|轉(zhuǎn)化|體外轉(zhuǎn)錄/翻譯|其它表達分析Northern印跡分析|分支DNA和mRNA定量|差別基因表達|反義寡核苷酸|RACE試劑盒|SAGE試劑盒|其它抗體蛋白A,GPLUS|抑制/凋亡抗體|信號分子抗體結(jié)構(gòu)蛋白抗體|磷酸化特異抗體|融合蛋白tag抗體非哺乳動物蛋白抗體|細胞周期蛋白抗體|轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白抗體|抗體制備佐劑|抗體片段|抗體同種型|抗體純化|抗體制備試劑盒|其它第二抗體westernblot二抗|免疫組化二抗|其它試劑盒ELISA試劑盒|免疫組化試劑盒|放射免疫試劑盒|westernblot試劑盒|流式細胞試劑盒|其它抗體相關(guān)siRNA|重組蛋白|白蛋白|試劑|其它分子生物學服務DNA提取/純化|DNA測序|第二代高通量測序|DNA保存和活化|基因合成|基因步行|基因組分析生物信息學|SNP檢測|實時定量PCR服務|文庫/載體構(gòu)建|寡核苷酸合成Oligo合成|實時PCROligo合成|其它細胞生物學服務細胞培養(yǎng)|流式細胞檢測|細胞毒性測試|細胞因子生物檢測|影像服務|篩選/發(fā)育服務|其它干細胞技術(shù)服務干細胞提取|干細胞鑒定|干細胞誘導分化|干細胞常規(guī)檢測|干細胞擴增|干細胞轉(zhuǎn)基因|干細胞其他相關(guān)實驗|微生物學服務微生物鑒定|抑菌作用測試|內(nèi)測試|內(nèi)。腫瘤細胞侵襲能力檢測在學(遷移、侵襲)和免疫學(遷移、趨化)中是常規(guī)實驗。上??蒲屑夹g(shù)服務實驗室

免疫系統(tǒng),人體的免疫系統(tǒng)由免疫細胞、免疫分子構(gòu)成。天津小鼠科研技術(shù)服務服務

m6A修飾圖譜構(gòu)建及作用機制:通過m6A甲基化測序(MeRIP-Seq,miCLIP)構(gòu)建疾病細胞模型或者發(fā)病組織的m6A修飾譜,分析m6A的motif,peaks數(shù)量及分布,Peak關(guān)聯(lián)基因的特征,聯(lián)合RNA-seq研究m6A甲基化與表達的關(guān)系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機制,作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質(zhì)瘤增殖相關(guān)的FOXM1,通過qPCR、WB、免疫熒光、核質(zhì)分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實驗證明ALKBH5通過去甲基化調(diào)節(jié)FOXM1在GSCs中的表達。為研究ALKBH5對FOXM1的作用是否受其他因子的調(diào)節(jié),作者研究了FOXM1的鄰近基因,發(fā)現(xiàn)lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補,且共表達、共定位,進一步通過RIP,RNApulldown等實驗證明lncRNAFOXM1-AS促進ALKBH5和FOXM1初級轉(zhuǎn)錄本的相互作用。通過細胞實驗進一步驗證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達和細胞增殖,從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細胞中m6A修飾的特征和基因表達的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進了人類癥的發(fā)生。傳統(tǒng)的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化,組蛋白修飾和染色質(zhì)重構(gòu)。近。天津小鼠科研技術(shù)服務服務