細胞經(jīng)基因修飾后會改變其生物學(xué)特性,同時也會帶來新的安全性風(fēng)險,如基因編輯脫靶風(fēng)險、載體插入突變風(fēng)險、載體重組風(fēng)險、表達的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物的風(fēng)險等。細胞經(jīng)基因修飾后會改變其生物學(xué)特性,同時也會帶來新的安全性風(fēng)險,如基因編輯脫靶風(fēng)險、載體插入突變風(fēng)險、載體重組風(fēng)險、表達的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物的風(fēng)險等?;诨蛐揎椉毎漠a(chǎn)品種類繁多、各有特點,除上述一般技術(shù)要求外,還應(yīng)基于產(chǎn)品的性進行相應(yīng)的特殊考慮。本指導(dǎo)原則列舉了以下三種情形的特殊考慮?;蚓庉嬛委熯^程中安全性評價,即脫靶效應(yīng)的檢測。武漢種子脫靶檢測政策
基因zhiliao產(chǎn)品特有的可能會引起遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險因素包括:基因組整合活性基因zhiliao產(chǎn)品可能會采用修飾宿主基因組的技術(shù),并有可能在宿主細胞或組織中持續(xù)存在。很多基因zhiliao載體的基因整合不會指向基因組的特定位點,可能在整合位點處產(chǎn)生插入突變、或jihuo整合位點附近的原基因等,進而破壞重要基因功能或增加惡性liu的風(fēng)險,例如,國外已有多項研究報告在接受了使用γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒載體轉(zhuǎn)導(dǎo)的基因修飾細胞zhiliao的受試者中發(fā)生白血病。因此,對于存在此類風(fēng)險的產(chǎn)品,有必要進行長期隨訪臨床研究以評估出現(xiàn)遲發(fā)不良反應(yīng)的風(fēng)險。北京高精度脫靶檢測企業(yè)如何降低脫靶效應(yīng)?選擇特異的gRNA; 使用RNP; 使用eSpCas9的質(zhì)粒; 使用Nickase Cas9。
基于已有科學(xué)經(jīng)驗和既往非臨床/臨床研究結(jié)果,如果認為基因修飾細胞所采用的載體系統(tǒng)可將外源基因整合到細胞基因組中并可在體內(nèi)長期存續(xù),需綜合分析以上風(fēng)險因素,評估潛在的插入突變、致瘤/致性風(fēng)險。非臨床研究,應(yīng)采用具有代表性的基因轉(zhuǎn)導(dǎo)細胞進行基因整合位點分析,分析細胞的克隆組成以及在關(guān)注基因(如liu相關(guān)調(diào)控基因)附近有無優(yōu)先整合跡象,含有關(guān)注整合位點的細胞有無優(yōu)先異常增殖。對于嵌合抗原受體(Chimericantigenreceptor,CAR)或T細胞受體(Tcellreceptor,TCR)修飾的免疫細胞,應(yīng)盡可能采用多種方法評估其靶點相關(guān)毒性和脫靶毒性風(fēng)險。
R-loop seq雖然不是一種真正意義上的脫靶位點檢測方法,但能為堿基編輯脫氨酶的脫靶提供一種度量方法,以便于之后的脫氨酶點突變優(yōu)化,來降低脫靶的發(fā)生幾率。2) Detect-seqCRISPR衍生技術(shù)由于其復(fù)雜性,檢測其脫靶位點的hexin思路是捕獲實驗過程中的關(guān)鍵中間產(chǎn)物或者終產(chǎn)物。這種設(shè)計思路下,目前較為成功的是檢測堿基編輯CBE脫靶位點的Detect-seq[13]。CBE的原理是將dC脫氨變?yōu)閐U,迫使其對側(cè)的dG變?yōu)閐A,較終將堿基對從C-G轉(zhuǎn)變?yōu)門-A。Detect-seq便是針對中間態(tài)的dU,使用Uracil DNA Glycosylase (UDG),去除U堿基后,替換為帶Biotin的U堿基,捕獲堿基編輯的脫靶位點,并且sgRNA依賴和sgRNA不依賴的脫靶位點都能找到。該方法類似檢測DNA甲基化的重亞硫酸鹽測序法,通過處理特定的堿基,可以捕獲全基因組上的CBE脫靶位點。脫靶檢測企業(yè),推薦唯可生物,實驗實力強,專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準確率高。
國內(nèi)外基因zhiliao產(chǎn)品開展的非臨床研究、長期隨訪獲得的臨床經(jīng)驗以及基因組整合位點分析方法的明顯改進,都有助于更好地理解整合性基因zhiliao載體相關(guān)風(fēng)險。通常認為,很多能夠介導(dǎo)外源基因轉(zhuǎn)入細胞核的載體(如逆轉(zhuǎn)錄病毒載體、轉(zhuǎn)座子元件和基因編輯產(chǎn)品等)有基因組整合潛力,需要通過長期隨訪觀察遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險;根據(jù)目前的認識和研究數(shù)據(jù),質(zhì)粒、痘病毒、腺病毒和腺相關(guān)病毒(AAV)等載體的基因zhiliao產(chǎn)品整合風(fēng)險較低,國際上開展的臨床試驗中也表現(xiàn)出較低的遲發(fā)性不良反應(yīng)風(fēng)險。當載體或基因zhiliao產(chǎn)品原有的風(fēng)險特征增加時,例如經(jīng)過修飾以攜帶基因組編輯成分的質(zhì)?;蚋淖兘oyaofang式以提高整合能力等,需要提高對長期隨訪觀察的要求;反之,也可以對目前認為存在遲發(fā)風(fēng)險的基因zhiliao載體進行修飾,以降低這些風(fēng)險。根據(jù)選擇的sgRNA,通過生物信息學(xué)方法,對sgRNA進行脫靶分析。溫州基因編輯技術(shù)脫靶檢測分析
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對于基因修飾細胞zhiliao產(chǎn)品,充分的非臨床研究是為了:(1)闡明基因修飾的目的、功能以及產(chǎn)品的作用機制,明確其在擬定患者人群中使用的生物學(xué)合理性;(2)為臨床試驗的給藥途徑、給藥程序、給藥劑量的選擇提供支持性依據(jù);(3)根據(jù)潛在風(fēng)險因素,闡明毒性反應(yīng)特征,預(yù)測人體可能出現(xiàn)的不良反應(yīng),確定不良反應(yīng)的臨床監(jiān)測指標,為制定臨床風(fēng)險控制措施提供參考依據(jù)。因此,應(yīng)充分開展非臨床研究,收集用于風(fēng)險獲益評估的信息,以確立擬開發(fā)產(chǎn)品在目標患者人群中預(yù)期具有合理的、可接受的獲益風(fēng)險比,同時為臨床試驗的設(shè)計和風(fēng)險控制策略的制定提供支持性依據(jù)。武漢種子脫靶檢測政策