廣東宏基因?qū)W分析找哪家

來源: 發(fā)布時(shí)間:2024-05-29

隨著測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,對(duì)微生物群(微生物組)的研究逐漸加深,研究熱點(diǎn)越來越多集中于環(huán)境和生物體相互作用的微生物群。加之測(cè)序成本降低,分析技術(shù)不斷提升,都使得宏基因組測(cè)序技術(shù)得到普遍應(yīng)用。為什么要做宏基因組:宏基因組相對(duì)16S來說其物種分辨率會(huì)更高,隨著物種測(cè)序完成越來越多,數(shù)據(jù)庫更加完善,在腸道菌群方面基本能實(shí)現(xiàn)97%以上的菌都能鑒定到種,90%以上到菌株層面。而且可以同時(shí)獲得除RNA病毒外的所有物種的分布。此外包括菌基因組CNV等方法的出現(xiàn),可以直接通過大規(guī)模宏基因組測(cè)序不只找到可能的菌,進(jìn)一步還能鑒定出特定候選基因區(qū)段。可利用不同底物產(chǎn)生的不同代謝產(chǎn)物來間接檢測(cè)該微生物內(nèi)酶的有無,來達(dá)到檢測(cè)特定微生物的目的。廣東宏基因?qū)W分析找哪家

宏基因組概念:宏基因組有廣義和狹義兩種概念。廣義的概念是指所有可能與人的生活密切相關(guān)的微生物的基因組,包括長(zhǎng)期共生在體內(nèi)的微生物,也包括可以進(jìn)入體內(nèi),對(duì)人類的生活造成不同形式的影響的微生物。而狹義的宏基因組是只指長(zhǎng)期共生在體內(nèi)的微生物。宏基因組測(cè)序分析技術(shù):?jiǎn)问枪采谌梭w內(nèi)的微生物就有1000多種,特別是胃腸道內(nèi)的微生物為豐富。宏基因組除了這些微生物外,也包括以其他方式偶爾進(jìn)入人體內(nèi)的微生物,這些微生物可能形成病源體,影響我們的健康?,F(xiàn)在科學(xué)家可以分析和發(fā)現(xiàn)引起疾病的異常微生物存在與活動(dòng),從而保護(hù)人體的健康。杭州腸道微生物多樣性分析微生物鑒定可以采用不同微生物對(duì)周圍環(huán)境的資源的利用度有所不同的特性來區(qū)別。

病毒宏基因組學(xué)是在宏基因組學(xué)理論的基礎(chǔ)上,結(jié)合現(xiàn)有的病毒分子生物學(xué)檢測(cè)技術(shù)而興起的一個(gè)新的學(xué)科分支,是某類樣本中所有病毒(virus)或病毒類似物(virus-like-particle)及其所攜帶遺傳信息的總稱。宏病毒組直接以環(huán)境中所有病毒的遺傳物質(zhì)為研究對(duì)象,能夠快速準(zhǔn)確的鑒定出環(huán)境中所有的病毒組成,在病毒發(fā)現(xiàn)、病毒溯源、微生物預(yù)警等研究方面具有重要作用。宏病毒研究可應(yīng)用于人或動(dòng)物腸道或者血液樣本、海洋、土壤等的研究,用以挖掘潛在的對(duì)人類和環(huán)境的危害。

病毒宏基因組測(cè)序:在運(yùn)用宏基因組測(cè)序方法檢測(cè)的樣本量位居全球前列,樣本總數(shù)居國內(nèi)第二,其中腦脊液檢測(cè)量位列全球前二強(qiáng)。除了傳染病的應(yīng)用場(chǎng)景之外,利用mNGS還可以對(duì)菌群進(jìn)行菌株鑒定分型、耐藥基因與毒力基因的檢測(cè),適用于抗傳染院內(nèi)傳染管理的評(píng)估。在越來越多的證據(jù)表明微生物對(duì)人體免疫系統(tǒng)能夠產(chǎn)生影響,以及微生物菌群會(huì)參與到神經(jīng)退行性疾病、糖尿病等疾病的發(fā)生和發(fā)展當(dāng)中,微生物療法獲得了越來越多的關(guān)注,而mNGS未來也可以為人們深入分析人體菌群微生態(tài)、研究微生物療法提供一種可靠的技術(shù)手段。醫(yī)療保?。簻?zhǔn)確、快速地鑒定細(xì)菌和寄生蟲,以進(jìn)行正確和及時(shí)的疾病診斷。

病原宏基因組測(cè)序可與實(shí)時(shí)熒光定量PCR(RT-PCR)技術(shù)聯(lián)合使用,實(shí)現(xiàn)優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)?!癛T-PCR由于其檢測(cè)速度快、操作流程簡(jiǎn)單、成本較低的原因,更適用于大規(guī)模的篩查中,以便快速獲得是否為冠狀病毒核酸陽性的初步證據(jù),而對(duì)于RT-PCR檢測(cè)陰性、但臨床表型高度疑似的患者,利用mNGS進(jìn)一步確認(rèn)可有效提高檢測(cè)結(jié)果的可靠性,并獲得是否有其他病原體傳染的信息?!睂?duì)于RT-PCR檢測(cè)陽性的樣本,也可以進(jìn)一步利用mNGS進(jìn)行病毒全序列的分析,從而幫助獲得病毒是否發(fā)生變異的信息,為疫苗、藥物研發(fā)等方面提供可靠證據(jù)。傳統(tǒng)Sanger測(cè)序相比,NGS技術(shù)的發(fā)展使得一個(gè)小的研究小組可以擁有大量病毒株的全基因組序列.浙江微生物群體多樣性測(cè)序分析公司

未知病原微生物樣本需要經(jīng)歷:核酸純化-文庫構(gòu)建-以及生物信息學(xué)分析這三大基本流程才能完成鑒定。廣東宏基因?qū)W分析找哪家

探普生物的病毒測(cè)序:由于探普生物具備處理大量多樣的病毒樣本的經(jīng)驗(yàn),熟知各類病毒樣本的特性,因此對(duì)于樣本準(zhǔn)備有獨(dú)特的方法指南,這就為后續(xù)的分析結(jié)果打下了牢固的基礎(chǔ),減少了客戶和公司之間的摩擦,也幾乎沒有售后問題。獨(dú)有的實(shí)驗(yàn)和分析流程可兼容高復(fù)雜度低濃度的病毒核酸。因此探普生物的病毒測(cè)序結(jié)果質(zhì)量有保障外還具備:樣本準(zhǔn)備簡(jiǎn)單,商務(wù)流程通暢,回復(fù)消息及時(shí),反饋處理迅速等優(yōu)點(diǎn)。我國經(jīng)濟(jì)進(jìn)入“新常態(tài)”,總體上推動(dòng)["病毒測(cè)序","病毒全基因組測(cè)序","病毒宏基因組測(cè)序","未知病原鑒定"]從粗放式增長(zhǎng)向注重質(zhì)量、效率方向轉(zhuǎn)變。廣東宏基因?qū)W分析找哪家