深度測序技術對科學研究范式的影響:個性化醫(yī)學、P4醫(yī)學和準確醫(yī)學等研究范式都是在近幾年深度測序技術迅猛發(fā)展的基礎上提出的。個人基因組測定的可行性,使得大眾有可能測定和分析自己的基因組、尋找到個人健康相關的基因風險因素,從而可以在生活習慣、飲食等方面提早進行個性化預測和預防。由于互聯(lián)網(wǎng)的發(fā)展和即時檢驗技術(point-of-care-testing,POCT)的應用,人們可以通過網(wǎng)絡進行交流和參與到整個診療過程,這便是P4醫(yī)學的概念:預測性(predictive)、預防性(preventive)、個性化(personalized)及參與性(participatory)。測序的完成程度,決定著基因組的下游應用。河北病毒二代測序排行
一直以來,病毒基因組測序都是疾病診斷、流行病學調(diào)查和宿主-病原關系研究的重要手段。病毒的全基因組測序以及對應的生物信息學分析方法是研究病毒進化、毒力因子變異、疫病爆發(fā)之間的關系、疫病傳播途徑、不同遺傳變異的分布模式、疫病發(fā)生地理區(qū)域的基礎。與傳統(tǒng)Sanger測序相比,NGS技術的發(fā)展使得一個小的研究小組可以擁有大量病毒株的全基因組序列,測序成本也在逐步降低。由于NGS產(chǎn)生的數(shù)據(jù)量非常龐大,其序列拼接難度也隨之增加。而且對于低濃度高復雜度的樣本,研究者除了PCR外別無他法。而PCR方法往往具有偏好性,丟失的片段將為序列組裝帶來非常高的失敗率。對于完全未知的樣本,無法通過PCR進行富集,要鑒定其種類需要調(diào)用各種方法,逐個嘗試工作量之大,其效率之低,使得一個新的研究方法的出現(xiàn)及其必要。四川高通量測序方法全基因組測序通過運用新一代高通量DNA測序儀,進行10到20倍覆蓋率的個人全基因組測序。
病毒全基因組測序,基因測序技術能鎖定個人病變基因,提前預防和調(diào)整。自上世紀90年代初,學界開始涉足“人類基因組計劃”。而傳統(tǒng)的測序方式是利用光學測序技術。用不同顏色的熒光標記四種不同的堿基,然后用激光光源去捕捉熒光信號從而獲得待測基因的序列信息。雖然這種方法檢測可靠,但是價格不菲也是有目共睹的,一臺儀器的價格大約在50萬到75萬美元,而檢測一次的費用也高達5千到1萬美元。新的基因測序儀中,芯片代替了傳統(tǒng)激光鏡頭、熒光染色劑等,芯片就是測序儀。
哪些應用場景需要對病毒的全基因組進行測序?在探普生物長時間運行過程中,我們接觸到的對病毒的全基因組進行測序項目有比較豐富的應用場景。先,從事基因進化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會用到測序。這種場景一般是用密集的sanger測序監(jiān)測某幾個關鍵基因,搭載一定頻率的全基因組測序。這樣的組合省時省力省經(jīng)費,同時能達到研究目的。此外,有的單位需要對傳染病的病原進行流行病學監(jiān)測和研究,如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應課題組,可能需要對病毒的全基因組進行測序以后,結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù),達到研究或者監(jiān)測疫病的目的。對病毒全基因組進行測序,利用生物信息分析手段,得到病毒的全基因組序列。
深度測序技術之所以稱為深度測序(deepsequencing),是因為它是對傳統(tǒng)測序技術的一次性改變,它通過一次性對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定(之前只是幾十至多幾千個堿基),同時,如此的高通量測序使得對一個物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進行細致全方面的分析成為可能。你以為深度測序只是一種“養(yǎng)”在實驗室“深閨”中摸不著、看不透的高精尖技術?錯!錯!錯!深度測序技術的巨大發(fā)展,與計算機的發(fā)展歷程有著類似之處,它將對人類的科學、經(jīng)濟和社會三個方面產(chǎn)生深遠的影響。病毒全基因組測序要注意什么事項?國內(nèi)病毒測序突變分析價格
病毒全基因組測序具有的特點:無需培養(yǎng)和特異性擴增,對采集臨床樣本直接檢測。河北病毒二代測序排行
病毒全基因組測序定:上海探普生物科技有限公司的對病毒的全基因組進行測序有什么優(yōu)勢?全國開設病毒相關測序的公司不超過5家,只有探普生物是專門為病毒研究者服務的,探普生物的研發(fā)團隊和實驗團隊都來自全國各地病毒學、微生物學專業(yè)的高校,碩士及以上學歷成員超過60%,團隊具備普通測序?qū)嶒灪头治龌A之外,同時具備病毒學及微生物學的學術背景,相當了解病毒相關樣本情況、研究方向等。研究者在項目咨詢的時候就可以明顯感覺到探普生物的專業(yè)性,溝通順暢,省時省力。河北病毒二代測序排行
上海探普生物科技有限公司坐落在放鶴路1088號6號樓307,是一家專業(yè)的從事生物科技專業(yè)領域內(nèi)技術開發(fā)、技術轉(zhuǎn)讓、技術咨詢、技術服務,化工原料及產(chǎn)品(除危險化學品、監(jiān)控化學品、煙花爆竹、易制毒化學品),實驗室設備,計算機、軟件及輔助設備,電子產(chǎn)品銷售,計算機軟件開發(fā)及維護,計算機信息系統(tǒng)集成服務等。公司。目前我公司在職員工以90后為主,是一個有活力有能力有創(chuàng)新精神的團隊。上海探普生物科技有限公司主營業(yè)務涵蓋病毒測序,病毒全基因組測序,病毒宏基因組測序,未知病原鑒定,堅持“質(zhì)量保證、良好服務、顧客滿意”的質(zhì)量方針,贏得廣大客戶的支持和信賴。一直以來公司堅持以客戶為中心、病毒測序,病毒全基因組測序,病毒宏基因組測序,未知病原鑒定市場為導向,重信譽,保質(zhì)量,想客戶之所想,急用戶之所急,全力以赴滿足客戶的一切需要。