病毒（Virus）由一種核酸分子（DNA或RNA）與蛋白質(zhì)（Protein）構(gòu)成或由蛋白質(zhì)構(gòu)成（如朊病毒）。根據(jù)遺傳物質(zhì)的組成，可分為單鏈DNA病毒（ssDNA）、雙鏈DNA病毒（dsDNA）、單鏈RNA病毒（ssRNA）、雙鏈RNA病毒（dsRNA）和蛋白質(zhì)病毒（如朊病毒）。根據(jù)宿主類型的不同，可以分為噬菌體（細菌病毒）、植物病毒（煙花葉病毒）和動物病毒（如禽流感病毒、天花病毒和HIV等）。病毒全基因組測序（VirusWholeGenomeSequencing，VWGS），是指基于第二代高通量測序技術(shù)，對病毒全基因組進行測序，利用生物信息分析手段，得到病毒的全基因組序列，解析編碼信息，并獲得相應(yīng)的變異信息。Sanger測序準確度高，讀長很長。國內(nèi)病毒序列測序分析方法
對病毒的全基因組進行測序：對病毒的全基因組進行測序主要是通過非特異性擴增+克隆結(jié)合sanger測序來完成的。當物種有了參考的序列之后，可以通過特異性擴增+sanger測序獲得全基因組序列。Sanger測序準確度高，讀長很長，但與此同時，擴增和克隆工作費時費力，由于流程繁瑣，加上快速變異導(dǎo)致引物無法通用，該方法對于大量基因組的測序工作而言，可操作性不強，這對于研究者一直是一個困擾。高通量測序技術(shù)正式啟用之后，研究者可以將樣品處理至標準濃度和體積后進行測序和分析，減少了工作量，增加了成功率。探普生物進行了大量有針對性的研發(fā)和測試，開發(fā)了全套的實驗和分析流程用于對病毒的全基因組進行測序，該流程自運行以來廣受研究者們好評。廣州全基因組病毒測序檢測在探普生物進行病毒基因組測序是比較簡單的。
DNA病毒基因組測序：動物、人、植物被特定病毒株侵染、分離到病毒株、連續(xù)傳代的病毒株往往都需要獲得盡量完整的基因組序列來指導(dǎo)下一步的研究，傳統(tǒng)的sanger測序需要了解序列、設(shè)計引物、做很多PCR，往往效率很低，而NGS作為一種無需特異性引物擴增的測序方式，可以直接從DNA中獲得序列。DNA病毒基因組測序：如果，1，您的目的是：獲得一種指定DNA病毒盡量完整的序列；2，您可以提供該病毒的中英文名稱；3，您了解樣本中病毒的載量情況、培養(yǎng)狀況、ct值等任一信息。那么，探普為你準備了完整的下單、樣本準備方法，經(jīng)過探普的實驗，測序、分析，你將獲得：1，1-5Gb測序數(shù)據(jù)量rawdata；2，一般可獲得95%以上的拼接序列，100kb以上大基因組病毒除外；其他特殊要求如：突變分析、進化分析都可直接與技術(shù)支持聯(lián)系。
在探普生物進行病毒基因組測序的流程是怎么樣的？在探普生物進行病毒基因組測序非常簡單，簡而言之，客戶只需要說清楚樣品情況，準備樣品即可，其他事宜都由探普來進行安排。大致流程如下：1)與銷售人員溝通項目需求和樣本情況；2)探普生物工作人員擬定項目合同，雙方協(xié)商合同內(nèi)容后簽字蓋章；3)按樣本準備指南準備好樣本，填寫信息單后通知銷售人員預(yù)訂干冰，安排樣本寄運輸；4)客戶支付項目啟動款，探普生物啟動項目實驗和分析并提供測序報告；5)客戶支付項目尾款，探普生物提交測序數(shù)據(jù)和分析結(jié)果；6)售后問題處理，項目結(jié)題。病毒全基因組測序具有的特點：專業(yè)化服務(wù)。
二代測序可以用于對病毒的全基因組進行測序有哪些挑戰(zhàn)？二代測序相較sanger測序，差異主要就是單次運行可以獲得海量的數(shù)據(jù)量，因此也稱為高通量測序。想要通過高通量測序獲得病毒全序列，需要經(jīng)歷：核酸純化-文庫構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這三大基本流程。而高通量測序技術(shù)本身并不是以病毒為目標開發(fā)的，因此每個環(huán)節(jié)都是挑戰(zhàn)。核酸純化步驟決定了Input核酸的起始濃度和總量，從而決定了文庫構(gòu)建的成敗、質(zhì)量和產(chǎn)量；文庫的好壞決定了數(shù)據(jù)的質(zhì)量和產(chǎn)出；而數(shù)據(jù)的質(zhì)量產(chǎn)出直接影響分析結(jié)果。樣品一般核酸濃度很低，且?guī)в写罅克拗魑廴荆虼藢嶒灢糠趾头治霾糠侄急容^困難。探普生物基于這些困難點，進行了大量有針對性的研發(fā)和測試，開發(fā)了全套的實驗和分析流程用于對病毒的全基因組進行測序，該流程自運行以來廣受研究者們好評。想要通過高通量測序獲得病毒全序列，需要經(jīng)歷：核酸純化-文庫構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這三大基本流程。廣州全基因組病毒測序檢測
對病毒的全基因組進行測序主要是通過非特異性擴增+克隆結(jié)合sanger測序來完成。國內(nèi)病毒序列測序分析方法
哪些應(yīng)用場景需要對病毒的全基因組進行測序？在探普生物長時間運行過程中，我們接觸到的對病毒的全基因組進行測序項目有比較豐富的應(yīng)用場景。先，從事基因進化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會用到測序。這種場景一般是用密集的sanger測序監(jiān)測某幾個關(guān)鍵基因，搭載一定頻率的全基因組測序。這樣的組合省時省力省經(jīng)費，同時能達到研究目的。此外，有的單位需要對傳染病的病原進行流行病學(xué)監(jiān)測和研究，如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應(yīng)課題組，可能需要對病毒的全基因組進行測序以后，結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù)，達到研究或者監(jiān)測疫病的目的。國內(nèi)病毒序列測序分析方法
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