重慶ATAC測序數(shù)據(jù)分析

來源: 發(fā)布時間:2022-06-04

單細胞測序技術(Single Cell Sequencing)從一種新興的研究角度,借助已有的高通量測序手段,幫助研究者在疾病樣本的異質性、樣本微環(huán)境、發(fā)育學、免疫學以及其他領域中進行單細胞層面的數(shù)據(jù)解析,解決了Bulk Population Sequencing所無法解決的問題。這樣一個新的研究領域必然也需要足夠可靠的實驗手段來支撐。BD Rhapsody單細胞分選系統(tǒng)為此提供了完善的硬件設備,保證了從單細胞懸液質量評估到單細胞分選標記過程中每一個實驗步驟的完善質控。NovelBio單細胞實驗團隊借助BD Rhapsody單細胞分選系統(tǒng),在實驗實施層面對單細胞測序結果的可靠性提供了強有力的保證。繼單細胞懸液制備之后,又在另一道關鍵關卡提供了可靠的支持,幫助研究者在單細胞測序領域收獲更多的成果。深度的單細胞測序數(shù)據(jù)解讀助力生物健康醫(yī)療時代。重慶ATAC測序數(shù)據(jù)分析

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Fluidigm C1平臺基于富魯達(Fluidigm?)的微流控技術應用于單細胞測序(Single Cell RNA Sequencing)領域的商業(yè)化中,該技術大約在幾個小時中可以捕獲96個左右的細胞,進行各類的Single-Cell測序建庫。當然,通量還是比較小。但不可否認的是,現(xiàn)在很多非RNA類Single Cell測序,仍然在采用這樣的技術,如Single Cell DNA-Seq,Single Cell ATAC-Seq等,都是采用此技術進行單細胞分選后再分別用不同試劑盒建庫。所以可以說,至少在10X Genomics、BD或者其他企業(yè)推出有效的Single DNA測序技術之前,C1仍然會是市場上的重要組成部分。

烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺,針對龐大的單細胞測序數(shù)據(jù),能夠實現(xiàn)細胞類型鑒定的快、精、準:一鍵導入gene list構建個性化基因列表;輕松一點即可展示Marker基因的Feature plot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調用和一站式全流程自動化分析,節(jié)省您的工作時間并提升整體工作效率。烈冰實驗室包含從樣本處理到測序下機的全套實驗平臺。

所謂的高通量測序技術,又名大規(guī)模平行測序,是將 DNA(或者 cDNA)隨機片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數(shù)以萬計的克隆(colony)進行延伸反應,檢測對應的信號并獲取序列信息。與 傳統(tǒng)測序法相比,高通量測序技術在處理大規(guī)模樣品時具有強大的優(yōu)勢,又快(兩天)又多(數(shù)百萬克隆),成為目前組學研究的主要技術。單細胞測序是一個系統(tǒng)的工程,開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實驗過程如何規(guī)劃,實驗平臺如何選擇,樣本如何制備,數(shù)據(jù)如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務就已經(jīng)開始了,從銷售到實驗到專業(yè)技術支持,我們開通全線對接渠道,幫助您快速定位項目訴求,提供從實驗設計到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學合作伙伴。單細胞測序機構,請認準上海烈冰生物科技。重慶RNA測序多重熒光免疫組化

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當下,單細胞測序已經(jīng)廣泛應用于多種疾病發(fā)展過程中的關鍵過程和事件,如疾病從輕癥病變向惡性的轉化、惡性向轉移病變的發(fā)展,以及疾病對多種藥物的反應等等。單細胞測序技術作為一個需要將組織解離成為單細胞懸液,或者是采用細胞核捕獲的策略捕獲單細胞核,進而對于每一個單細胞或者細胞核進行測序得到結果的技術,其空間定位信息是丟失的。這就衍生出了一個問題就是如果單細胞A與B并不出現(xiàn)在一個組織區(qū)域中他們會互相影響或者轉化么?免疫研究中,兩個具有非常強的PDL1-PD1的配對關系的細胞在組織切片上風馬牛不相及,這樣PDL1-PD1的關系會生效么?重慶ATAC測序數(shù)據(jù)分析

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