上海單細胞BCR測序

來源: 發(fā)布時間:2022-06-04

基于10X Next GEM技術(shù),單細胞免疫組庫測序一次實驗可以同時檢測近萬個細胞,可在一個樣本中同時獲5'端mRNA表達譜、TCR和BCR的信息,結(jié)合基因的表達譜和V(D)J數(shù)據(jù)進行復(fù)雜組織樣本的是影響免疫應(yīng)答分析,監(jiān)測免疫療法的效果,研究疾病發(fā)生、發(fā)展的分子機制。 烈冰平臺 1/ 1000+ TCR/BCR項目經(jīng)驗,一次實驗可同時獲取1000-10000個細胞的文庫構(gòu)建,獲得轉(zhuǎn)錄組和免疫組數(shù)據(jù)。 2/ 具備完善的免疫組庫測序和實驗質(zhì)控流程,獲取V(D)J全長序列的配對信息 3/ 豐富的免疫組庫測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗,實現(xiàn)專屬個性化數(shù)據(jù)分析服務(wù),搭配單細胞分析云平臺,一鍵導(dǎo)出交互性的動態(tài)結(jié)果報告。單細胞測序技術(shù)遍地開花,烈冰服務(wù)讓您的生物醫(yī)學(xué)研究如虎添翼。上海單細胞BCR測序

不同類型的細胞或者在不同的條件下,活細胞中染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)是在不斷變化的,比如說各種應(yīng)激反應(yīng)(stimulus response)和抗逆反應(yīng)(stress response)等,也就是說染色質(zhì)的可及性是會隨細胞類型和外界刺激的改變而發(fā)生變化,而染色質(zhì)開放區(qū)域的定向測序可以幫助我們了解細胞的轉(zhuǎn)錄調(diào)控過程,確定開放染色質(zhì)的位置、轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控差異、核小體的調(diào)控區(qū)域和染色質(zhì)狀態(tài)等信息,確定哪些基因在細胞中具有轉(zhuǎn)錄活性。單細胞多組學(xué)測序是一種比較強大的表觀遺傳學(xué)研究工具,在開放染色質(zhì)圖譜繪制,細胞分化發(fā)育,疾病的致病機制,樣本微環(huán)境等方面具有極大的應(yīng)用前景。溫州RNA測序服務(wù)烈冰一站式多平臺測序服務(wù):立足科學(xué)研究,解碼生命本質(zhì)。

免疫組庫測序有必要做嗎? 對于十的十二次方個以上的抗原識別基數(shù)來說,群體和個體間的免疫組庫的豐富程度能夠直接反應(yīng)機體免疫系統(tǒng)情況,通常TCR/BCR的亞型越多,機體識別病原的能力越強,越不容易患病,但超過一定限度,也容易引發(fā)自身免疫性疾病。且機體的免疫組庫也不是一成不變的,會隨著年齡,環(huán)境,藥物,患病等等因素,免疫組庫多樣性也時刻處于動態(tài)變化當(dāng)中。由此,將免疫組庫測序用于臨床診斷和診療上,有助于對群體或個體間進行免疫監(jiān)測,探究相關(guān)疾病和免疫應(yīng)答的關(guān)系,監(jiān)測免疫療法的效果,研究疾病發(fā)生、發(fā)展的分子機制。

單細胞測序結(jié)果動輒上百G數(shù)據(jù)量,龐大的數(shù)據(jù)對于分析平臺和分析能力有著很高的要求,首先針對下機數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié):單細胞測序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列,不可避免的會出現(xiàn)低質(zhì)量的測序結(jié)果,存在各種情況的序列污染。因此序列過濾及質(zhì)量評估就會變得極為重要。序列質(zhì)量主要通過測序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來表征,即堿基測序結(jié)果的錯誤率在1% / 0.1%以下的比例。理想的測序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30。保證數(shù)據(jù)獲得后第一步的處理結(jié)果的準確性,為后續(xù)細胞類型鑒定準確和功能分析打下堅實基礎(chǔ)。搭建多種測序數(shù)據(jù)的生物信息分析平臺,5000+項目檢驗,真實可信賴。

BD Rhapsody單細胞分選系統(tǒng)集成了熒光顯微成像系統(tǒng),可以對不同熒光標(biāo)記的細胞進行檢測并計數(shù)。在進行質(zhì)量評估之前,首先要將細胞的培養(yǎng)體系更換成上機所需的Buffer。在這個過程中,需要進行多次離心、重懸操作,烈冰Novelbio單細胞實驗團隊推薦采用水平轉(zhuǎn)子離心機來進行這步操作。這種離心機可以有效減少細胞在多次更換Buffer過程中的損失,尤其是對于細胞量較少的樣本來說,顯得非常有必要。更換完Buffer之后,還需要將細胞進行過篩操作,去除較大的細胞團,獲得較為純凈的單細胞懸液。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務(wù)。常州PanoCell單細胞測序數(shù)據(jù)分析

十二年測序經(jīng)驗,烈冰生物單細胞多組學(xué)領(lǐng)域的佼佼者。上海單細胞BCR測序

其實,空間轉(zhuǎn)錄組的概念早就已經(jīng)存在了,目前已經(jīng)發(fā)表的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)有 Slide-seq , LCM-seq , seqFISH, MERFISH , Liver single cell zonation , Geo-seq and Tomo-seq。但是這些方法存在操作復(fù)雜、檢測精度不準確、基因和細胞檢測量的限制等問題。10x Genomics公司升級spatial Transcriptomic后推出的Visium空間基因表達解決方案是一款商業(yè)化的高精度、高通量空間轉(zhuǎn)錄組測序方案。烈冰科技自2020年起,國內(nèi)率先搭建空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)平臺,聯(lián)合上線單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序、AbSeq、單細胞TCR-Seq、單細胞ATAC-Seq(ARCHR測序)、空間轉(zhuǎn)錄組測序產(chǎn)品結(jié)合scRNA-Seq服務(wù),多組學(xué)聯(lián)合助力科研人員探索時空等多維度、多角度的動態(tài)變化的生物學(xué)信息。烈冰生物為您提供貼心的單細胞研究完整解決方案!上海單細胞BCR測序

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