為了更好地了解DON對C2C12細胞分化的影響，作者進行了轉錄組學和蛋白質組學的整合分析。共鑒定了149個共同的***差異基因（co-DEG），其中91%被共下調（圖3A）。15%的co-DEG屬于真核細胞骨架，其中大部分屬于肌動蛋白絲，少數(shù)是中間絲和微管的成分。對co-DEG進行GO分析，生物學過程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“快肌纖維收縮的正向調節(jié)”條目。細胞組分中富集的**個條目是“纖維蛋白原復合物”、“細胞外空間”、“細胞外基質”、“細胞外區(qū)域”和“蛋白質細胞外基質”，這些都是細胞外成分（圖3B）。結果表明，DON主要影響肌肉成分的組成和功能以及多種細胞外成分的表達。通路富集分析富集到了“ECM-受體相互作用”、“蛋白質消化和吸收”、“人**瘤病毒***”和“粘著斑”等通路。蛋白組學技術對腎錯構瘤尿液差異蛋白的研究。安徽國內蛋白組學公司排名
本文為了探究其潛在的分子機制，作者運用RNA測序（RNA-seq）和iTRAQ標記定量蛋白組學，對不同成熟度水平的油脂種子進行了研究。不僅揭示了關鍵候選基因和蛋白質的時間特異性表達，而且為該樹種的遺傳改良提供了科學依據(jù)。中文標題：基于iTRAQ蛋白質組學和轉錄組學聯(lián)合分析揭示油茶種子成熟過程中油質相關的關鍵代謝產(chǎn)物的積累研究對象：油茶種子發(fā)表期刊：HorticultureResearch影響因子：6.793發(fā)表時間：2021.07.01發(fā)表單位：海南大學園藝園林學院運用生物技術：RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標記定量蛋白組學、轉錄組學、蛋白組學文章中iTRAQ標記定量蛋白組學由歐易/鹿明生物提供技術支持內蒙古蛋白組學tmt報告解讀研究機構,提供蛋白組學聯(lián)合分析,技術咨詢服務。
蛋白質組數(shù)據(jù)分析鑒定出了幾種參與肝葡萄糖脂代謝的蛋白質（ACC、FASN、SCD1、CPT1A、GLUT2、GK、GS、G6Pase、PEPCK）。此外，AC顯示出抑制脂肪生成酶（ACC，F(xiàn)ASN和SCD1）表達的趨勢，同時***上調了GLUT2。與對照組相比，AC***增加了PEPCK的表達，兩種化學物質對G6Pase均無***影響（圖4A）。PRM蛋白靶向驗證測定結果與蛋白質組變化相一致，這進一步證實了蛋白質組學數(shù)據(jù)中蛋白質的表達（圖4B）。轉錄組學和蛋白質組學聯(lián)合分析結果顯示AC和AL***改善了線粒體功能。GSEA分析顯示，處理組的氧化磷酸化（OXPHOS）通路***上調，AC組和AL組的富集得分分別為0.826和0.535。
本研究采用串聯(lián)質量標簽（TMT）標記的蛋白質組學和平行反應監(jiān)測（PRM）技術，對蓮子脫水過程中的生理調控網(wǎng)絡進行了深入研究表明，碳水化合物代謝（包括糖酵解/糖異成、半乳糖代謝、淀粉和蔗糖代謝、磷酸戊糖途徑和細胞壁組織）、ER中的蛋白質加工、DNA修復和抗氧化事件對蓮種胎脫水有積極的反應。在蓮種胚脫水過程中，非酶促抗氧化劑和戊糖磷酸和維生素E作為主要的抗氧化劑，在脫水過程中維持荷花胚胎的REDOX平衡。這些結果為揭示荷花胚胎脫水保護機制的生理學調控網(wǎng)絡提供了酶途徑在抗氧化保護中起著主要作用。應激生理學檢測表明，H2O2是誘發(fā)氧化應激損傷的主要活性氧（ROS）成分，谷胱甘肽新的見解。蛋白質組學測序 蛋白組學技術缺點。
蛋白組學研究案例：2022年1月，歐易/鹿明生物合作客戶北京中醫(yī)藥大學教育部中醫(yī)養(yǎng)生學重點實驗室劉銅華教授課題組在Frontiers in Nutrition期刊發(fā)表了題為 “Mechanisms for Improving Hepatic Glucolipid Metabolism by Cinnamic Acid and Cinnamic Aldehyde: An Insight Provided by Multi-Omics ”的研究成果，通過轉錄組學和蛋白質組學研究方法，發(fā)現(xiàn)了肉桂酸（AC）和肉桂醛（AL）在改善葡萄糖脂代謝中的特征，探究了其代謝作用機理。為預防和***代謝紊亂等疾病提供了理論依據(jù)。蛋白組學常見研究模式,蛋白樣本準備注意事項以及經(jīng)典案例解讀。福建植物蛋白組學sci
蛋白質組學,蛋白質組分析,專業(yè)的多組學聯(lián)合分析。安徽國內蛋白組學公司排名
定量蛋白質組學研究：2022年2月，上海市農(nóng)業(yè)科學院食用菌研究所鮑大鵬研究員課題組在《FrontiersinMicrobiology》期刊發(fā)表的題為“OxidativeStressandAutophagyAreImportantProcessesinPostRipenessandBrownFilmFormationinMyceliumofLentinulaedodes”的研究成果，通過iTRAQ標記定量蛋白組學、GC-MS非靶向代謝組學等技術對香菇菌絲進行定量蛋白質組學和代謝組學分析，發(fā)現(xiàn)氧化應激和自噬是香菇菌絲后熟轉色重要過程，并對其在蛋白質組和代謝組水平上的分子機制有了新的認識。涉及的歐易/鹿明生物服務產(chǎn)品：iTRAQ標記定量蛋白組學、GC-MS非靶向代謝組學安徽國內蛋白組學公司排名
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