非靶向代謝組學(xué)研究:對于代謝物分析,作者對非靶代謝組學(xué)測定,共檢測到4,346種代謝物。根據(jù)所有檢測到的代謝物的投影中變量重要性(VIP)>1和p<0.05的篩選標(biāo)準(zhǔn),在不同的比較組***研究了961種差異累積代謝物(DAM)(表1)。在A果實(shí)(AF)與B果實(shí)(BF)的相同成熟階段,發(fā)現(xiàn)S3的DAM比S1和S2更豐富,這意味著DAM的主要變化發(fā)生在S3。隨后,利用京都基因和基因組百科全書(KEGG)富集分析進(jìn)一步了解與兩個(gè)東方甜瓜品種相關(guān)的生物學(xué)機(jī)制。其中,參與蔗糖和有機(jī)酸代謝的代謝物在果實(shí)中的積累差異更大,包括“半乳糖代謝”、“磷酸戊糖途徑”、“果糖和甘露糖代謝”、“亞油酸代謝”和“花生四烯酸”。代謝組學(xué),代謝組數(shù)據(jù)庫,代謝組分析,利用非靶檢測尋找差異代謝物。北京外泌體 代謝組學(xué)
LC-MS靶向代謝組+16S微生物多樣性檢測研究。題目:糞便微生物可以區(qū)分酒精性肝炎引起的酒精攝入量,但不能區(qū)分疾病的嚴(yán)重程度期刊:HepatologyIF=17.425研究思路:*樣本類型:人糞便*檢測平臺(tái):LC-MS靶向代謝組、16S微生物多樣性檢測為了表征酒精性肝炎有關(guān)的糞便微生物生態(tài)學(xué),考察微生物組變化和疾病嚴(yán)重程度的關(guān)系,推斷微生物生態(tài)學(xué)變化的功能相關(guān)性,本文作者將中度或重度酒精性肝炎患者(MAH和SAH)的糞便微生物組與健康(HC)和重度飲酒對照組(HDC)進(jìn)行比較,通過16SrRNA基因測序鑒定微生物群分類,使用LC/MS平臺(tái)測量糞便短鏈脂肪酸(SCFA)含量。重度飲酒患者與健康對照組相比、重度飲酒組與酒精性肝炎相比,均可以發(fā)現(xiàn)明顯的微生物組特征分布。但微生物分類不能區(qū)分中度和重度酒精性肝炎。在酒精性肝炎患者中,糞便中短鏈脂肪酸與產(chǎn)生SCFA的微生物菌群均減少,可以推斷出,酒精性肝炎患者的糞便微生物組有明顯的變化,與酒精性肝炎的嚴(yán)重程度無關(guān)。北京外泌體 代謝組學(xué)非靶向代謝組學(xué) 土壤非靶代謝學(xué) 非靶脂質(zhì)組學(xué)研究。
LC-MS非靶向代謝技術(shù)發(fā)現(xiàn)了糞便移植(FMT)對血液代謝的影響。標(biāo)題:藻酸鹽寡糖化小鼠的微生物群成功減輕了小腸粘膜炎期刊:MicrobiomeIF=14.650研究思路:*樣本類型:小鼠小腸、腸道內(nèi)容物、血漿*檢測平臺(tái):LC-MS非靶向代謝組、轉(zhuǎn)錄組、16S微生物多樣性檢測等本研究發(fā)現(xiàn)藻酸鹽寡糖(AOS)可以減輕***藥物白消安誘導(dǎo)的小腸細(xì)胞膜的損傷,特別是細(xì)胞連接和微絨毛;并有利于腸道菌群變化進(jìn)而改善小腸功能,提高腸道的免疫功能。LC-MS非靶向代謝技術(shù)發(fā)現(xiàn)了糞便移植(FMT)對血液代謝的影響,并分析了血液代謝物與腸道菌群之間的相關(guān)性,發(fā)現(xiàn)不同劑量的糞便移植對血液代謝組均產(chǎn)生了***影響,其中大部分是在小腸功能中起著重要作用的脂質(zhì)代謝物,表明FMT可以在血液中恢復(fù)被白消安擾亂的代謝物。相關(guān)性分析表明,“有益菌”乳酸桿菌有助于血液代謝產(chǎn)物的恢復(fù),“有害菌群”則不能協(xié)助血液代謝物的回收,揭示了FMT可改善小腸功能和腸道菌群,恢復(fù)血液代謝的原因。
GC-MS非靶向代謝組:隨著納米材料的產(chǎn)業(yè)化,各種形式的納米材料將以不同途徑進(jìn)入人們的生活,納米材料的生物安全性問題正受到世界各國科學(xué)家的***關(guān)注,本篇為2020年2月,南京大學(xué)環(huán)境學(xué)院課題組在Environmental Science & Technology雜志(IF=9.028)發(fā)表題為“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究論文。該研究運(yùn)用16S rRNA基因測序、GC-MS非靶向代謝組技術(shù)對土壤微生物組和代謝組學(xué)分析技術(shù)的獨(dú)特結(jié)合,提供了對AgNPs生態(tài)影響的全新視角,***了解了AgNPs暴露對土壤微生物的影響。標(biāo)題:銀納米顆粒改變種植和未種植黃瓜土壤中的微生物群落組成和代謝物譜期刊:EnvironmentalScience&Technology影響因子:9.028發(fā)表時(shí)間:2020年2月合作單位:南京大學(xué)環(huán)境學(xué)院運(yùn)用生物技術(shù):16SrRNA基因測序、GC-MS非靶向代謝組(由鹿明生物提供技術(shù)支持)。代謝組學(xué)四大公司 代謝組學(xué)一般研究方法及步驟代謝組學(xué)分析流程。
GC-MS非靶向代謝組學(xué)研究,中文標(biāo)題:代謝組學(xué)分析和氧化應(yīng)激反應(yīng)揭示了有機(jī)磷類阻燃劑磷酸三(2-氯乙基)和磷酸三苯基對大腸桿菌的毒性研究對象:大腸桿菌發(fā)表期刊:Chemosphere影響因子:7.086作者單位:廣東石油化工大學(xué)環(huán)境科學(xué)與工程學(xué)院涉及的歐易/鹿明生物服務(wù)產(chǎn)品:GC-MS非靶向代謝組學(xué)(由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)以往有關(guān)嘔吐***的研究多集中在免疫毒性、神經(jīng)毒性、生殖毒性、遺傳毒性等方面,而關(guān)于生長發(fā)育影響的研究較少。該研究是一篇通過大腸桿菌作為研究對象利用非靶向代謝組學(xué)來探究有機(jī)磷阻燃劑影響生物的發(fā)育和功能的高質(zhì)量的、創(chuàng)新性的的研究文章,值得學(xué)習(xí)與借鑒。歐易生物/鹿明生物提供專業(yè)的靶向代謝組學(xué)服務(wù)。江蘇代謝組學(xué)細(xì)菌
代謝組學(xué),代謝組數(shù)據(jù)庫,代謝組分析,基因檢測。北京外泌體 代謝組學(xué)
非靶向代謝組學(xué)研究:利用番茄的自然變異確定番茄復(fù)合體中果實(shí)多酚的途徑結(jié)構(gòu)和代謝調(diào)控ExploitingNaturalVariationinTomatotoDefinePathwayStructureandMetabolicRegulationofFruitPolyphenolicsintheLycopersicumComplex研究對象:番茄組織發(fā)表期刊:MolecularPlant影響因子:13.164組學(xué)技術(shù):LC-MS靶向代謝組學(xué)、GC-MS非靶代謝組(雙平臺(tái)代謝組學(xué)),本研究通過表征構(gòu)成八種不同番茄多酚代謝網(wǎng)絡(luò)的潛在生物合成和修飾反應(yīng),闡明了八種番茄復(fù)合體多酚生物合成的整個(gè)生物合成框架,并對相關(guān)代謝物和結(jié)構(gòu)基因進(jìn)行了詳細(xì)注釋,并運(yùn)用LC-MS/GC-MS雙平臺(tái)代謝組學(xué)方法為輔助育種提供幫助。此外,番茄果實(shí)成熟過程中的代謝變化為今后基于遺傳的代謝工程設(shè)計(jì)提供了研究方向,并為研究其他重要植物物種中特定的代謝物的功能提供了理論依據(jù)。北京外泌體 代謝組學(xué)
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