數(shù)字PCR的引物和探針設(shè)計(jì)規(guī)則同熒光定量PCR是類似的,具體規(guī)則如下:1、查找和選擇目標(biāo)序列設(shè)計(jì)引物和探針的第一步是得到感興趣基因的核酸序列。找到基因保守區(qū)域:基因的保守區(qū)域是指來自同一屬/種/亞型的、在某個(gè)基因上堿基序列差別很小或沒有差別的區(qū)域。根據(jù)需要,使用ClustalX或ClustalW等軟件對齊屬于同一屬/種/亞型的基因的一組序列,在對齊序列的保守區(qū)域設(shè)計(jì)引物,并確保引物結(jié)合位點(diǎn)處的保守序列與其它非待檢測的屬/種/亞型的堿基序列具有較大的差異。擴(kuò)增產(chǎn)物長度(AmpliconLength):可在75-200bp之間(產(chǎn)物長度=下游引物位置-上游引物位置+1)。數(shù)字PCR是通過將一個(gè)樣本分成幾十到幾萬份,分配到不同的反應(yīng)單元,每個(gè)單元至少包含一個(gè)拷貝的目標(biāo)分子 。珠三角微滴式數(shù)字PCR生命科學(xué)用品
PCR已成為分子診斷領(lǐng)域重要的技術(shù)手段之一,占據(jù)分子診斷市場的半壁江山。數(shù)字PCR是一代PCR技術(shù),也是當(dāng)前靈敏度和定量精度比較高的分子檢測技術(shù)。但數(shù)字PCR使用成本仍然相對較高,檢測靶點(diǎn)數(shù)少(一般≤6靶點(diǎn)/反應(yīng)),阻礙了其在臨床中的大規(guī)模應(yīng)用,提高數(shù)字PCR的多重檢測能力迫在眉睫?;跓晒馔ǖ罃?shù)的增加和基于探針濃度梯度增加,均可以在一定程度上提高數(shù)字PCR檢測重?cái)?shù),然而只能達(dá)到"線性"增加的目的?;谔结槤舛忍荻鹊亩嘀貦z測技術(shù)雖然光'f明顯增加多重能力,但由于無法避免交叉反應(yīng)現(xiàn)象,不能確保獲得位點(diǎn)特異性的分簇,因此穩(wěn)定性不足、靈敏度較差,難以滿足臨床級別的數(shù)據(jù)要求。而基于創(chuàng)新的且數(shù)字PCR獨(dú)特適用的熒光編碼技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)“指數(shù)”級的多重檢測,顛覆性的提高數(shù)字PCR檢測重?cái)?shù),覆蓋臨床應(yīng)用多場景需求。深圳一體化數(shù)字PCR市場前景在使用dPCR進(jìn)行轉(zhuǎn)基因檢測時(shí),通常直接參照qPCR的方法。
由于現(xiàn)有的商業(yè)化數(shù)字PCR設(shè)備在物理上只設(shè)置了2個(gè)檢測通道,所以存在一個(gè)明顯的短板:不能同時(shí)進(jìn)行多個(gè)位點(diǎn)的檢測。在樣品多位點(diǎn)的檢測中,就需要更多的起始樣品,但臨床上組織的樣品非常有限。相比之下熒光定量PCR儀上就很容易實(shí)現(xiàn)多重檢測。為了考察利用數(shù)字PCR實(shí)現(xiàn)多重檢測的可能性,英國TheInstituteofCancerResearch的研究人員以非小細(xì)胞肺相關(guān)的KRAS基因?yàn)闄z測對象,在Bio-Rad的數(shù)字PCR系統(tǒng)上通過3個(gè)三重ddPCR檢測體系來實(shí)現(xiàn)9個(gè)KRAS突變位點(diǎn)的檢測。
對于檢測需要高靈敏度以及技術(shù)確認(rèn)的情況下,數(shù)字PCR技術(shù)也可以發(fā)揮重要作用。技術(shù)數(shù)據(jù)表明,數(shù)字PCR技術(shù)對的比較低檢測下限可到2copies/ml,比qPCR靈敏度提升了100倍。經(jīng)測試,數(shù)字PCR在檢測和診斷的某些方面優(yōu)于金標(biāo)準(zhǔn)qPCR,尤其是在低病毒載量樣本中,相比起qPCR,數(shù)字PCR特異性、靈敏度、重現(xiàn)性和檢測限受影響更小。因此,未來預(yù)計(jì)數(shù)字PCR技術(shù)也將在類疾病中得到更加廣的應(yīng)用。數(shù)字PCR的應(yīng)用甚廣,除了可應(yīng)用于進(jìn)行突變的檢測以外,也可運(yùn)用于基因擴(kuò)增的檢測。通過數(shù)字PCR技術(shù)可建立多重?zé)晒怏w系,用于同時(shí)檢測比如非小細(xì)胞肺中常見的MET和HER2耐藥擴(kuò)增。有研究報(bào)道,使用數(shù)字PCR技術(shù)對436例非小細(xì)胞肺樣品進(jìn)行檢測,并挑選樣本驗(yàn)證了數(shù)字PCR與RNA fish的檢測一致性。結(jié)果表明,該數(shù)字PCR技術(shù)在保證了基因擴(kuò)增檢測準(zhǔn)確性的同時(shí),還節(jié)約了檢測時(shí)間。dPCR可直接溯源SI國際單位制摩爾,適合單一、雙重及多重轉(zhuǎn)基因標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)研究,一次可識(shí)別不同的轉(zhuǎn)基因區(qū)域。
基于數(shù)字PCR技術(shù)平臺(tái),塔歌生物成功地開發(fā)了胎兒染色體非整倍體(T21,T18和T13)無創(chuàng)產(chǎn)前篩查試劑盒(數(shù)字PCR-NIPT),并已完成數(shù)百例臨床樣本驗(yàn)證。數(shù)字PCR-NIPT的陽性檢出率和NGS相似,且成本接近血清學(xué),可以在上述應(yīng)急策略中取代血清學(xué)作為靈敏度和特異性更高的初篩方法,以有效提高陽性檢出率,降低需要復(fù)篩的假陽性樣本數(shù)和節(jié)省總的篩查成本。數(shù)字PCR應(yīng)用前景廣闊,可用于病原微生物檢測、基因檢測、無創(chuàng)產(chǎn)前篩查、測序結(jié)果驗(yàn)證等領(lǐng)域。但目前,大多數(shù)醫(yī)院采購的數(shù)字PCR儀器是用于科研層面,在臨床應(yīng)用上仍處于起步階段,未得到普遍應(yīng)用。數(shù)字PCR的應(yīng)用甚廣,除了可應(yīng)用于進(jìn)行突變的檢測以外,也可運(yùn)用于基因擴(kuò)增的檢測。珠三角全自動(dòng)多重?cái)?shù)字PCR油滴制造
國產(chǎn)dPCR企業(yè)在上述應(yīng)用領(lǐng)域不斷與伯樂、賽默飛、羅氏、凱杰、因美納等頭部企業(yè)展開競爭,搶占市場份額。珠三角微滴式數(shù)字PCR生命科學(xué)用品
數(shù)字聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(digitalpolymerchainreaction,dPCR)技術(shù)因具有高靈敏度、受基質(zhì)干擾少等優(yōu)勢而被廣用于轉(zhuǎn)基因食品檢測。本研究綜述了數(shù)字PCR技術(shù)的原理、系統(tǒng)各部件的優(yōu)劣勢,梳理了數(shù)字PCR技術(shù)在轉(zhuǎn)基因檢測與溯源技術(shù)(標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì))方面的進(jìn)展和發(fā)展趨勢,以期為轉(zhuǎn)基因食品檢測領(lǐng)域提供參考依據(jù)。dPCR的擴(kuò)增過程大致上可以分為3步:樣品的分散、樣品的熱循環(huán)擴(kuò)增和樣品的檢測。對于數(shù)字PCR儀器系統(tǒng),各個(gè)部件之間仍然有較大的改進(jìn)空間,要發(fā)揮部件之間的協(xié)同作用是很重要的,而且有持續(xù)研究的價(jià)值。表1中總結(jié)了部分常見的數(shù)字PCR系統(tǒng)的類型,以及相對在硬件、便攜性、性價(jià)比和自動(dòng)化程度上的比較。珠三角微滴式數(shù)字PCR生命科學(xué)用品
雙螺旋科學(xué)儀器,2015-04-17正式啟動(dòng),成立了數(shù)字PCR,純水機(jī),病理切片機(jī),倍性分析儀等幾大市場布局,應(yīng)對行業(yè)變化,順應(yīng)市場趨勢發(fā)展,在創(chuàng)新中尋求突破,進(jìn)而提升臻準(zhǔn),美國艾科浦,銳訊生物,Sysmex,Eprerdia的市場競爭力,把握市場機(jī)遇,推動(dòng)精細(xì)化學(xué)品產(chǎn)業(yè)的進(jìn)步。業(yè)務(wù)涵蓋了數(shù)字PCR,純水機(jī),病理切片機(jī),倍性分析儀等諸多領(lǐng)域,尤其數(shù)字PCR,純水機(jī),病理切片機(jī),倍性分析儀中具有強(qiáng)勁優(yōu)勢,完成了一大批具特色和時(shí)代特征的精細(xì)化學(xué)品項(xiàng)目;同時(shí)在設(shè)計(jì)原創(chuàng)、科技創(chuàng)新、標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范等方面推動(dòng)行業(yè)發(fā)展。我們在發(fā)展業(yè)務(wù)的同時(shí),進(jìn)一步推動(dòng)了品牌價(jià)值完善。隨著業(yè)務(wù)能力的增長,以及品牌價(jià)值的提升,也逐漸形成精細(xì)化學(xué)品綜合一體化能力。公司坐落于廣州市黃埔區(qū)銳豐三街4號(hào)617房,業(yè)務(wù)覆蓋于全國多個(gè)省市和地區(qū)。持續(xù)多年業(yè)務(wù)創(chuàng)收,進(jìn)一步為當(dāng)?shù)亟?jīng)濟(jì)、社會(huì)協(xié)調(diào)發(fā)展做出了貢獻(xiàn)。