PCR常使用目標序列的拷貝數(shù)或某一給定樣品中轉(zhuǎn)基因的百分比來體現(xiàn)方法靈敏度。由于qPCR和dPCR實驗過程所用試劑的兼容性較好,在使用dPCR進行轉(zhuǎn)基因檢測時,通常直接參照qPCR的方法。使用不同技術(shù)對相同樣品檢測時,兩種方法的靈敏度是否具有可比性成為關(guān)注的問題。Burns等21]使用Fluidigm公司的12.765(12板,每板765個微單元)芯片數(shù)字PCR分析儀測定標準物質(zhì)ERM-AD413檢測轉(zhuǎn)基因玉米MON810。該小組應(yīng)用dPCR技術(shù)評估在qPCR定義下的靈敏度數(shù)值,在拷貝數(shù)200-700之間,dPCR與qPCR的測量結(jié)果具有一致性。但與qPCR的靈敏度相比,dPCR在低于拷貝數(shù)200時有被低估的風險,在高于拷貝數(shù)1000時有被高估的風險。dPCR在同一陣列上同時測量轉(zhuǎn)基因和內(nèi)源性靶點時,需要稀釋內(nèi)源性靶點和轉(zhuǎn)基因靶點在合理拷貝數(shù)范圍內(nèi)以保證dPCR測量結(jié)果的準確性。國產(chǎn)dPCR企業(yè)在上述應(yīng)用領(lǐng)域不斷與伯樂、賽默飛、羅氏、凱杰、因美納等頭部企業(yè)展開競爭,搶占市場份額。上海數(shù)字PCR價格
dPCR在使用過程中需要特別注意體積誤差造成的結(jié)果偏差。體積誤差對于測量拷貝數(shù)濃度會產(chǎn)生偏差。目前dPCR中體積優(yōu)化方法以光學顯微鏡觀測為主。分散體積的差異會增加拷貝數(shù)結(jié)果的不確定性,Emslie等使用光學顯微鏡縱向拍照比較圖片邊緣的微小差異,考察了數(shù)字PCR系統(tǒng)中每個微孔內(nèi)和孔與孔間的體積差異對實驗結(jié)果的影響程度。Corbisier等使用微滴數(shù)字PCR對6種不同質(zhì)量分數(shù)棉籽粉質(zhì)粒DNA標準物質(zhì)[ERM-AD623a-f,濃度范圍(10~10)copies/ul]進行分析,優(yōu)化了液滴體積得到相應(yīng)校正因子,并使用該校正因子發(fā)現(xiàn)并校準了運行軟件中液滴體積不變的假設(shè)而引起的數(shù)據(jù)偏離,數(shù)據(jù)結(jié)果的一致性有明顯提高。廣東國產(chǎn)數(shù)字PCR樣品回收dPCR儀器在操作中集成了前處理以減少手工移液和樣品轉(zhuǎn)移的操作,增加了通量,并在價格上具有優(yōu)勢。
在熒光定量PCR應(yīng)用已經(jīng)如此的情況下,緣何數(shù)字PCR仍然能橫空出世?中心點在于熒光定量PCR盡管為科研和臨床市場應(yīng)用提供了非常重要的檢測工具支撐,但仍然有尚未被滿足的客戶需求。熒光定量PCR需要基于標準品制作的標準曲線進行定量,屬于相對定量,操作較為復雜,且終端用戶對其結(jié)果的重復性、靈敏性、精密度、分辨率、對PCR反應(yīng)抑制劑的耐受性等方面有更高的期待。數(shù)字PCR通過將反應(yīng)體系進行有限稀釋至成千上萬的反應(yīng)單元中,實現(xiàn)了核酸靶標的單分子擴增。PCR擴增結(jié)束后,基于終點法對陽性液滴數(shù)和總液滴數(shù)進行計數(shù),結(jié)合泊松分布原理,從而實現(xiàn)對起始樣本的定量。其極大地簡化了操作步驟,并且大幅提高了檢測性能,尤其在低豐度或較低豐度的核酸檢測上(靈敏性可達0.001-0.0001%),其優(yōu)異的性能得到了終端用戶的認可。
本次推出的全自動數(shù)字PCR一體機可以適用于包括醫(yī)療檢測領(lǐng)域在內(nèi)的多種應(yīng)用場景。對于可以實現(xiàn)早期篩查、早期診斷、用藥指導以及監(jiān)測的復發(fā)。對于病原體可以實現(xiàn)超多重檢測,以利于快速診斷。在優(yōu)生優(yōu)育領(lǐng)域也可以實現(xiàn)更多遺傳性疾病的診斷和檢測。對于臨床應(yīng)用具有極大的潛力和價值。通過線上+線下的方式舉行了數(shù)字PCR2.0技術(shù)方案研討會,來自醫(yī)療界的**學者共聚一堂,圍繞PCR技術(shù)的發(fā)展和應(yīng)用進行交流和討論。歡迎咨詢廣州雙螺旋科學儀器有限公司。三重ddPCR檢測體系存在的問題:不同位點檢測體系之間的cross-reactivity。
引物設(shè)計(DesignPrimers):引物長度(PrimerLength):18-25個堿基之間。短的引物更易于同靶序列結(jié)合,但過短的引物也更可能同基因組上的多個區(qū)域相結(jié)合而產(chǎn)生非特異性擴增產(chǎn)物。更長的引物會提高同靶序列結(jié)合的特異性,但過長的引物(>30bp)同靶序列結(jié)合速度變慢,降低結(jié)合率。引物長度和組成直接影響引物Tm值(PrimerMeltingTemperature)和退火溫度(AnnealingTemperatures)。引物的組成——GC%含量(GCContent):指引物總堿基中G和C堿基數(shù)量的百分比,該值應(yīng)在40-60%之間。如果模板序列的GC含量較高,推薦使用較高Tm值的引物。數(shù)字以靈敏度和準確度測量突變的變異程度、檢測稀有的DNA靶拷貝以及解析拷貝數(shù)變?異狀態(tài)。廣東國產(chǎn)數(shù)字PCR性能特點
臻準推出新款數(shù)字PCR產(chǎn)品:AccuONE2.0數(shù)字PCR系統(tǒng)。上海數(shù)字PCR價格
對于檢測需要高靈敏度以及技術(shù)確認的情況下,數(shù)字PCR技術(shù)也可以發(fā)揮重要作用。技術(shù)數(shù)據(jù)表明,數(shù)字PCR技術(shù)對的比較低檢測下限可到2copies/ml,比qPCR靈敏度提升了100倍。經(jīng)測試,數(shù)字PCR在檢測和診斷的某些方面優(yōu)于金標準qPCR,尤其是在低病毒載量樣本中,相比起qPCR,數(shù)字PCR特異性、靈敏度、重現(xiàn)性和檢測限受影響更小。因此,未來預計數(shù)字PCR技術(shù)也將在類疾病中得到更加廣的應(yīng)用。數(shù)字PCR的應(yīng)用甚廣,除了可應(yīng)用于進行突變的檢測以外,也可運用于基因擴增的檢測。通過數(shù)字PCR技術(shù)可建立多重熒光體系,用于同時檢測比如非小細胞肺中常見的MET和HER2耐藥擴增。有研究報道,使用數(shù)字PCR技術(shù)對436例非小細胞肺樣品進行檢測,并挑選樣本驗證了數(shù)字PCR與RNA fish的檢測一致性。結(jié)果表明,該數(shù)字PCR技術(shù)在保證了基因擴增檢測準確性的同時,還節(jié)約了檢測時間。上海數(shù)字PCR價格
廣州雙螺旋科學儀器有限公司成立于2015-04-17,位于廣州市黃埔區(qū)銳豐三街4號617房,公司自成立以來通過規(guī)范化運營和高質(zhì)量服務(wù),贏得了客戶及社會的一致認可和好評。公司主要經(jīng)營數(shù)字PCR,純水機,病理切片機,倍性分析儀等,我們始終堅持以可靠的產(chǎn)品質(zhì)量,良好的服務(wù)理念,優(yōu)惠的服務(wù)價格誠信和讓利于客戶,堅持用自己的服務(wù)去打動客戶。臻準,美國艾科浦,銳訊生物,Sysmex,Eprerdia致力于開拓國內(nèi)市場,與精細化學品行業(yè)內(nèi)企業(yè)建立長期穩(wěn)定的伙伴關(guān)系,公司以產(chǎn)品質(zhì)量及良好的售后服務(wù),獲得客戶及業(yè)內(nèi)的一致好評。廣州雙螺旋科學儀器有限公司以先進工藝為基礎(chǔ)、以產(chǎn)品質(zhì)量為根本、以技術(shù)創(chuàng)新為動力,開發(fā)并推出多項具有競爭力的數(shù)字PCR,純水機,病理切片機,倍性分析儀產(chǎn)品,確保了在數(shù)字PCR,純水機,病理切片機,倍性分析儀市場的優(yōu)勢。