盡管我國dPCR行業(yè)起步較晚,但在國家鼓勵醫(yī)療器械創(chuàng)新的大背景下,以及精細醫(yī)療和個性化用藥等需求推動下,dPCR成為了近年廣受關注的熱點領域,保持著穩(wěn)定快速的增長。近年來國內誕生了如領航基因、新羿生物、銳訊生物、科維思、永諾生物、泛生子、思納福醫(yī)療等企業(yè),開始與國外企業(yè)同臺競技。從市場角度看,北美依然是dPCR比較大的主導市場,其次是亞洲和歐洲。由于性疾病和的高發(fā)病率以及患者對這些疾病的早期診斷意識的提高,亞太地區(qū)將成為dPCR增長速度快的市場。伯樂、凱杰、賽默飛、羅氏、因美納等公司紛紛通過收購、投資等方式布局dPCR業(yè)務。dPCR的結果統(tǒng)計方式有2種,一種是采用標記多種顏色,另一種采用概率統(tǒng)計的數據處理方法。上海數字PCR解決方案
數字PCR實驗步驟包括:1)試劑配制:將10xdPCRBuffer、dPCR酶、引物和探針、無核酸酶水混合成dPCR預混液,并分裝到8聯排管中或96孔板中;將各待測樣本的核酸模板、陽性對照、陰性對照分別加入相應的8聯排管中或96孔板中;2)芯片進樣:在小海龜BioDigital·青全自動樣品處理系統(tǒng)上進行芯片上反應液進樣和液滴生成;3)芯片擴增:在小海龜BioDigital·青PCR擴增儀上進行芯片上PCR擴增反應;4)芯片閱讀:在小海龜BioDigital·青生物芯片閱讀儀上進行芯片上熒光信號閱讀;5)數據分析:使用生物芯片數據分析·青軟件進行數據分析和報告導出;珠三角國產數字PCR樣品回收經過PCR循環(huán)之后,有一個核酸分子模板的反應器就會給出熒光信號,沒有模板的反應器就沒有熒光信號。
二項式分布是一個離散概率分布,它給出了m次試驗中k次成功的可能性,每次試驗的概率為p,例如當擲骰子時,二項分布給出了在10次試驗中恰好有7次擲出4的概率。在數字PCR的情況中,投擲骰子類似于將一個目標實體隨機“投擲”到一組分區(qū)中,當目標落在選定的分區(qū)中時,就是成功。如果有n個分區(qū),并且分區(qū)過程是完全隨機的,則目標出現在所選分區(qū)中的概率為1/n。該試驗重復m次,樣品中的每個分子一次。更多關于PCR的相關信息,歡迎咨詢廣州雙螺旋科學儀器有限公司。
基于微滴的QX100dPCR儀,利用油包水技術,將樣品平均分配到20000個微滴油包水中,利用微滴分析儀對微滴進行分析。2012年RainDance公司推出了RainDropdPCR儀,在高壓氣體驅動下,將每個標準反應體系分割成包含100萬至1000萬個皮升級別微滴的反應乳液。數字PCR就形成了2大派別,芯片式和微滴式。不論是哪種數字PCR,其原理都是有限稀釋,終點PCR和泊松分布。將含有核酸模板的標準PCR反應體系,平均分配成幾萬個PCR反應,分配到芯片或微滴中,使每個反應中盡可能含有一個模板分子,進行單分子模板PCR反應,通過讀取熒光信號的有或無進行計數,經過統(tǒng)計學泊松分布的校準進行定量。分散方式與數量由數字PCR系統(tǒng)決定,分散體積和結果表達方式需要實驗人員在實驗過程中優(yōu)化得到。
根據泊松分布的定義和適用條件可知,如果我們設微液滴總數為N,投入的靶序列拷貝數為M,那么“每個微液滴中的靶序列拷貝數”的概率分布是近似滿足泊松分布的。理解之前,首先要明確一點,在檢測的過程中,并不是說一個樣本中檢測到了幾個亮點,這個反應當中就有幾個目標基因的拷貝。因為目標基因的片段,在微滴當中的分布,是符合泊松分布的(也就是說進不進的概率相等,并且相互獨立)。所以,一個發(fā)光的微滴中,可能有一個或者三個四個,甚至更多個目標基因的拷貝。因此,發(fā)光的微滴數與原始的基因拷貝數并不是一對一的對應關系。數字PCR是直接數出DNA分子的個數,是對起始樣品的定量。上海數字PCR解決方案
數字PCR即Digital PCR(dPCR),它是一種核酸分子定量技術。上海數字PCR解決方案
naica®六通道微滴芯片數字PCR系統(tǒng),源于crystal微滴芯片數字PCR技術,自動化微滴生成和擴增,每個樣本孔可實現6熒光通道的檢測,智能化識別微滴并進行質控,3小時內即可獲得至少6個靶標基因的一定程度上拷貝數濃度,融合傳統(tǒng)微滴式和芯片式優(yōu)勢,被稱為下一代數字PCR技術。只需一步移液操作,將PCR反應液加載于創(chuàng)新型微流控芯片,naica®六通道微滴芯片數字PCR系統(tǒng)即可自動生成單層平鋪的2D微滴陣列,隨后對每個微滴進行溫度均勻一致的PCR擴增后,進行六通道熒光信號采集,計數陰陽性微滴,通過泊松分布計算獲得靶標基因一定程度上拷貝數濃度。上海數字PCR解決方案
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