蛋白質(zhì)組學,指對某一基因組所表達的所有蛋白質(zhì)及其特征進行大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究,以期望在蛋白質(zhì)水平上解釋控制復雜的生命活動的分子網(wǎng)絡(luò)。研究的內(nèi)容主要包括:組成蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)氨基酸的序列特征、蛋白質(zhì)的豐度、蛋白質(zhì)活性、蛋白質(zhì)的修飾、亞細胞定位和三維結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)之間的相互作用以及對蛋白質(zhì)的高階復合物結(jié)構(gòu)。質(zhì)譜技術(shù)的發(fā)展為這些研究提供了有力的技術(shù)支撐,使得許多有實際應(yīng)用的蛋白質(zhì)組功能研究成為可能,包括翻譯后修飾的整體分析,蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的重建和模式生物蛋白表達譜的定量研究;在臨床醫(yī)學和轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究中也越來越多地應(yīng)用到蛋白質(zhì)組學技術(shù)。iTRAQ定量是目前定量蛋白質(zhì)組學應(yīng)用比較普遍的技術(shù)。濟南Label free非標記定量蛋白質(zhì)組學研究內(nèi)容
定量蛋白質(zhì)組學方法學介紹:iTRAQ:iTRAQ定量是目前定量蛋白質(zhì)組學應(yīng)用比較普遍的技術(shù),該技術(shù)的關(guān)鍵原理是多肽標記和定量,將多肽的含量轉(zhuǎn)化為114、115、116和117同位素的含量(或113、114、115、116、117、118、119和121的8標記),從而簡化了定量的復雜性,然后通過多肽定量值回歸到蛋白的定量值,從而測定出不同樣本之間蛋白質(zhì)的差異。iTRAQ定量不依賴樣本,可檢測出較低豐度蛋白,胞漿蛋白、膜蛋白、胞外蛋白等,且定量準確,可同時對8個樣本進行分析,并可同時得出鑒定和定量的結(jié)果,特別適用于采用多種處理方式或來自多個處理時間的樣本的差異蛋白分析。蛋白質(zhì)組學檢測多少錢蛋白質(zhì)組學本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征。
蛋白組學技術(shù):質(zhì)譜技術(shù)相較于傳統(tǒng)蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)而言,擁有靈敏、準確、高通量、自動化等特點。質(zhì)譜鑒定蛋白質(zhì)的基本原理是先將樣品分子離子化,然后根據(jù)不同離子之間的質(zhì)荷比差異來分離并確定蛋白質(zhì)的相對分子質(zhì)量。根據(jù)蛋白質(zhì)酶解后所得到的肽質(zhì)量指紋圖譜、肽序列標簽、和肽階梯序列去檢索蛋白質(zhì)或核酸序列數(shù)據(jù)庫,質(zhì)譜技術(shù)可達到對蛋白質(zhì)的快速鑒定和高通量篩選。因產(chǎn)生離子的方法不同而發(fā)展起來的質(zhì)譜包括基質(zhì)輔助激光解吸離子化質(zhì)譜、電噴霧離子化質(zhì)譜、表面增強激光解吸離子化質(zhì)譜等。
蛋白質(zhì)組學發(fā)展趨勢:1、基礎(chǔ)研究方面:近兩年來蛋白質(zhì)組研究技術(shù)已被應(yīng)用到各種生命科學領(lǐng)域,如細胞生物學、神經(jīng)生物學等。在研究對象上,覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍,涉及到各種重要的生物學現(xiàn)象,如信號轉(zhuǎn)導、細胞分化、蛋白質(zhì)折疊等等。在未來的發(fā)展中,蛋白質(zhì)組學的研究領(lǐng)域?qū)⒏悠毡椤?、應(yīng)用研究方面:蛋白質(zhì)組學將成為尋找疾病分子標記和藥物靶標比較有效的方法之一。在對早老性癡呆等人類重大疾病的臨床診斷和治理方面蛋白質(zhì)組技術(shù)也有十分誘人的前景,目前國際上許多大型藥物公司正投入大量的人力和物力進行蛋白質(zhì)組學方面的應(yīng)用性研究。有很多蛋白質(zhì)組學的研究者在工業(yè)界和醫(yī)院進行相關(guān)研究和日常工作。
蛋白組究竟研究的是什么呢?第1,蛋白質(zhì)定性,或者說大規(guī)模檢測某些蛋白質(zhì)是否存在于樣品當中;第2,蛋白質(zhì)定量,也就是大規(guī)模檢測某些蛋白質(zhì)的含量(包括一定含量與相對含量);第3,蛋白質(zhì)翻譯后修飾,這些修飾主要包括磷酸化,泛素化,糖基化,乙?;鹊?,也包括對這些翻譯后修飾的定量研究。這三大塊中所提到的大規(guī)模,既可以是樣品數(shù)量的大規(guī)模高通量,也可以是少量樣本中蛋白數(shù)量的大規(guī)模高通量。研究原因:首先,由于翻譯調(diào)控和翻譯后調(diào)控的存在,RNA的表達量與實際對應(yīng)蛋白質(zhì)的含量相關(guān)性并不高,就簡單地測試了酵母中mRNA和對應(yīng)蛋白質(zhì)的定量相關(guān)性,結(jié)果是,低豐度蛋白與mRNA的相關(guān)性尤其低,而高豐度蛋白和其mRNA的相關(guān)性則高,經(jīng)過平均后r值只為0.4。目前國際上許多大型藥物公司正投入大量的人力和物力進行蛋白質(zhì)組學方面的應(yīng)用性研究。山東蛋白質(zhì)組學一般流程
蛋白質(zhì)組學技術(shù)有生物質(zhì)譜。濟南Label free非標記定量蛋白質(zhì)組學研究內(nèi)容
PRM靶向蛋白質(zhì)組學:產(chǎn)品分類:a.相對定量(目的同WB)。b.一定定量(目的同Elisa)。技術(shù)優(yōu)勢:(1)無需抗體,可直接對樣本中目標蛋白質(zhì)進行定量分析。(2)高特異性、準確度和靈敏度,靶向檢測目標蛋白對應(yīng)的多個unique肽段。(3)通量高,可以同時實現(xiàn)幾十個蛋白的定量檢測。樣本要求:動物及臨床組織標本100mg/sample,血清、血漿200μL/sample,細胞、微生物1×107cells/sample。應(yīng)用方向:驗證修飾和非修飾定量蛋白組學結(jié)果;目標蛋白相對定量和一定定量分析。蛋白質(zhì)組學屬于后基因組時代的科學研究,針對基因表達產(chǎn)物進行檢測與定量。濟南Label free非標記定量蛋白質(zhì)組學研究內(nèi)容
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