四川DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定

定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法學(xué)介紹：iTRAQ：iTRAQ定量是目前定量蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用比較普遍的技術(shù)，該技術(shù)的關(guān)鍵原理是多肽標(biāo)記和定量，將多肽的含量轉(zhuǎn)化為114、115、116和117同位素的含量(或113、114、115、116、117、118、119和121的8標(biāo)記)，從而簡(jiǎn)化了定量的復(fù)雜性，然后通過(guò)多肽定量值回歸到蛋白的定量值，從而測(cè)定出不同樣本之間蛋白質(zhì)的差異。iTRAQ定量不依賴樣本，可檢測(cè)出較低豐度蛋白，胞漿蛋白、膜蛋白、胞外蛋白等，且定量準(zhǔn)確，可同時(shí)對(duì)8個(gè)樣本進(jìn)行分析，并可同時(shí)得出鑒定和定量的結(jié)果，特別適用于采用多種處理方式或來(lái)自多個(gè)處理時(shí)間的樣本的差異蛋白分析。蛋白質(zhì)組研究技術(shù)涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象，如信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞分化、蛋白質(zhì)折疊等等。四川DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定

定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法學(xué)介紹：Label-free：Label-free定量，即非標(biāo)記的定量蛋白質(zhì)組學(xué)，不需要對(duì)比較樣本做特定標(biāo)記處理，只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質(zhì)譜響應(yīng)信號(hào)便可得到樣品間蛋白表達(dá)量的變化，通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時(shí)所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。Label-free定量不需要標(biāo)記處理，操作簡(jiǎn)單，可以做任意樣本的總蛋白質(zhì)差異定量，但對(duì)實(shí)驗(yàn)操作的穩(wěn)定性、重復(fù)性要求較高，準(zhǔn)確性也較標(biāo)記定量差。因此，Label-free技術(shù)適合于大樣本量的定量比較，以及對(duì)無(wú)法用標(biāo)記定量實(shí)現(xiàn)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。南京修飾蛋白組學(xué)技術(shù)服務(wù)蛋白質(zhì)組與基因組相對(duì)應(yīng)，也是一個(gè)整體的概念。

蛋白組學(xué)技術(shù)：蛋白質(zhì)組學(xué)研究的首要任務(wù)是建立獲取和分析蛋白質(zhì)的常規(guī)、可靠、有效的技術(shù)。為達(dá)到這一要求，就需要樣品準(zhǔn)備、數(shù)據(jù)獲取標(biāo)準(zhǔn)化及自動(dòng)化，也就是要有可重復(fù)的高通量的技術(shù)。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)手段在不斷完善，其工作流程，包括蛋白質(zhì)樣本的制備、分離、定量及鑒定。由雙向凝膠電泳、質(zhì)譜技術(shù)、酵母雙雜交系統(tǒng)、蛋白質(zhì)微陣列技術(shù)、能進(jìn)行大規(guī)模數(shù)據(jù)處理的計(jì)算機(jī)系統(tǒng)和軟件、軟電離技術(shù)及生物信息學(xué)技術(shù)構(gòu)成了蛋白質(zhì)組學(xué)研究的主要技術(shù)體系。其中蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)中的質(zhì)譜技術(shù)是現(xiàn)在比較常用的一種蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)。

蛋白質(zhì)組學(xué)在生物學(xué)領(lǐng)域的研究中的應(yīng)用是怎樣的？研究對(duì)象涉及到生物體且生物體內(nèi)表達(dá)蛋白，理論上都可以應(yīng)用蛋白質(zhì)組學(xué)。蛋白質(zhì)組學(xué)是以研究生物體蛋白組成及其變化規(guī)律為目的的應(yīng)用科學(xué)。主要使用的儀器為液質(zhì)聯(lián)用高分辨率質(zhì)譜儀。詳細(xì)來(lái)說(shuō)，蛋白質(zhì)組學(xué)包含許多分支：非標(biāo)定量蛋白質(zhì)組學(xué)（定性研究生物體的蛋白組成），定量蛋白質(zhì)組學(xué)（對(duì)生物體蛋白表達(dá)含量進(jìn)行測(cè)定），修飾蛋白質(zhì)組學(xué)（對(duì)蛋白質(zhì)翻譯后修飾進(jìn)行檢測(cè)）及相互作用蛋白質(zhì)組研究（蛋白質(zhì)直接相互作用機(jī)制解析）等。蛋白質(zhì)組學(xué)屬于后基因組時(shí)代的科學(xué)研究，針對(duì)基因表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè)與定量。因此更能反應(yīng)出生物體生理?xiàng)l件下的水平與狀態(tài)。蛋白質(zhì)組學(xué)在應(yīng)用中，更多地用于提供高通量蛋白質(zhì)定性定量信息。

定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)：定量蛋白質(zhì)組學(xué)是蛋白質(zhì)組研究的重要內(nèi)容，通過(guò)對(duì)基因表達(dá)產(chǎn)物——蛋白質(zhì)的定量分析，以了解基因在不同的生理、病理和逆境條件下的表達(dá)情況。近年來(lái)，隨著非凝膠技術(shù)的發(fā)展，蛋白質(zhì)組學(xué)（“Shotgun”proteomics）技術(shù)，特別是多維蛋白質(zhì)鑒定（MultidimensionalProteinIdentification，MudPIT）已成為研究復(fù)雜生物樣本中大規(guī)模蛋白質(zhì)表達(dá)和定性和定量分析的強(qiáng)有力工具。蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)學(xué)的研究應(yīng)用：蛋白質(zhì)組學(xué)是研究細(xì)胞、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學(xué)。蛋白質(zhì)組的研究能為生命活動(dòng)規(guī)律提供物質(zhì)基礎(chǔ)。深圳蛋白質(zhì)定量組學(xué)方法

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)有生物質(zhì)譜。四川DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定

蛋白質(zhì)組學(xué)概念：蛋白質(zhì)組學(xué)（英語(yǔ)：proteomics，又譯作蛋白質(zhì)體學(xué)），是以蛋白質(zhì)組為研究對(duì)象，研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。蛋白質(zhì)組（Proteome）一詞，源于蛋白質(zhì)（protein）與基因組（genome）兩個(gè)詞的組合，意指“一種基因組所表達(dá)的全套蛋白質(zhì)”，即包括一種細(xì)胞乃至一種生物所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)組學(xué)本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征，包括蛋白質(zhì)的表達(dá)水平，翻譯后的修飾，蛋白與蛋白相互作用等，由此獲得蛋白質(zhì)水平上的關(guān)于疾病發(fā)生，細(xì)胞代謝等過(guò)程的整體而全方面的認(rèn)識(shí)。四川DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定

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