浙江糖基化修飾蛋白質組學分析

蛋白質糖基化修飾組學技術：糖基化是在酶的控制下,蛋白質或脂質附加上糖類的過程,發(fā)生于內(nèi)質網(wǎng)和高爾基體等部位。在糖基轉移酶作用下將糖轉移至蛋白質,和蛋白質上的氨基酸殘基共價結合。蛋白質經(jīng)過糖基化作用,形成糖蛋白。糖基化是對蛋白的重要的修飾作用,有調節(jié)蛋白質功能作用。凝素親和法是目前糖蛋白質組學中應用普遍的分離富集方法。凝集素（lectin）是一類糖結合蛋白質，能專一識別某一特殊結構的單糖或聚糖中特定的糖基序列而與之結合，它們與糖鏈可逆非共價結合，糖蛋白或糖肽被凝集素捕獲之后，通常用特定的單糖通過競爭結合凝集素將糖蛋白或糖肽洗脫下來。蛋白質經(jīng)過酶解后利用凝集素（lectin）富集N-糖基化肽段，然后用N-糖酰胺酶（PNGase）在H218O中切除連接在天冬酰胺殘基（Asn）上的糖鏈。常見的蛋白質翻譯后修飾包括糖基化。浙江糖基化修飾蛋白質組學分析

蛋白質乙?；揎椊M學技術：乙?；揎検求w內(nèi)保守的可逆轉的蛋白修飾，對細胞核內(nèi)轉錄調控因子的刺激有著重要的作用。此外，還存在的非組蛋白乙?；揎梾⑴c了代謝通路及代謝酶活性的調節(jié)。采用肽段預分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙?；b定的影響，再結合免疫共沉淀通過抗體富集乙?；碾亩?，從而實現(xiàn)乙?；蔫b定及定量。樣品要求：1、SDS-PAGE條帶：5個以上可見考染條帶。2、溶液（目標蛋白質）：目標蛋白總量>50μg，目標蛋白濃度>80%。3、溶液（大規(guī)模混合蛋白質）：蛋白總量>1mg，蛋白濃度>1μg/μl。濟南乙?；揎椀鞍踪|組學服務蛋白質翻譯后修飾在蛋白質中磷酸化位點分析時應該注意些什么問題？

蛋白質學組翻譯后修飾自下而上分析策略：常用的糖蛋白分離和富集技術有：a. 凝集素親和技術；b. 肼化學富集；c. 親水性相互作用色譜法；d. β-消除/邁克爾加成反應?；谫|譜的糖蛋白鑒定和糖基化位點測定方法有：a. PNGase F酶法；b. Endo H酶法；c. 三氟甲烷磺酸(TFMS)法。泛素化：泛素是一種由76個氨基酸組成的多肽，在真核生物中高度保守，可通過異肽鍵與目標蛋白賴氨酸殘基的氨基進行共價連接。泛素化蛋白的富集主要基于標記，泛素用親和標簽（通常為6xHis）進行標記，并通過鎳螯合色譜親和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端為Arg-Gly-Gly結構，經(jīng)胰蛋白酶水解后，Gly-Gly保留在修飾蛋白的肽鏈上，使肽的質量增加114，因此可作為泛素定位位點的質量標記。用HPLC對樣品進行預分離，使用針對特定殘留結構的抗體富集泛素化肽，可很大程度上提高泛素化蛋白的濃度。串聯(lián)質譜可以鑒定泛素化位點。

蛋白磷酸化修飾過程：蛋白磷酸化修飾這一過程是通過蛋白激酶催化，將磷酸基團從ATP轉移到多肽底物的絲氨酸、蘇氨酸，或酪氨酸殘基上。并且磷酸化修飾的過程是可逆的，去磷酸化反應由蛋白磷酸酶催化完成。蛋白磷酸化檢測方法：Western Blot檢測方法：Western Blot是檢測蛋白磷酸化水平的常用方法，主要過程為先利用SDS-PAGE分離蛋白質，隨后將蛋白質轉移到PVDF膜上，然后使用特異性識別磷酸化蛋白的抗體來鑒定目標蛋白的磷酸化水平。只有被磷酸化修飾的蛋白才會在相應分子質量的地方顯現(xiàn)特異性蛋白條帶。質譜可以用于已知和未知的翻譯后修飾檢測。

蛋白質乙?；揎楄b定流程：1. 組織/細胞破碎，提取、提純目的蛋白質。2. 使用胰蛋白酶將目的蛋白酶解成多肽片段。3. 使用高效特異性乙?；贵w對乙?；揎楇亩芜M行免疫富集。4. 使用LC-MS/MS對富集的乙?；亩芜M行鑒定分析。5. 數(shù)據(jù)分析，并對鑒定的乙?；稽c的生物學功能進行解釋預測。隨著蛋白質組研究的發(fā)展，我們越來越深刻地意識到，對于生物體生命活動的管理和調控過程，密切相關的不只是單個蛋白質層面的修飾狀態(tài)，更重要的是研究蛋白質組學水平研究在翻譯后修飾的動態(tài)變化。高質、高效的蛋白質翻譯后修飾富集技術和豐富的、準確的定量手段使得研究蛋白質水平的翻譯后修飾組學成為現(xiàn)實，借助這些組學研究手段能夠實現(xiàn)不同生理病理狀態(tài)下生物樣本在翻譯后修飾水平上的定量比較，深入地揭示翻譯后修飾水平的波動與生物生命活動的密切聯(lián)系。常見的蛋白質翻譯后修飾包括泛素化。武漢蛋白質丙二?；揎椊M學質譜鑒定

蛋白質磷酸化修飾組學具有探索性。浙江糖基化修飾蛋白質組學分析

蛋白質翻譯后修飾組學：翻譯后修飾自下而上分析策略：自下而上蛋白質組學是一種基于肽段分析的技術。對于不同類型的翻譯后修飾，具體的分析策略存在差異。蛋白質的糖基化具有異質性。不同的糖鏈可以連接到同一位點上，不同位點可以連接到同一蛋白質上的不同糖鏈上。糖基化的異質性嚴重阻礙了糖蛋白的分離和分析。不同糖類型的相同蛋白質，在電泳上會出現(xiàn)分散的條帶，導致信號分散。此外，對低豐度蛋白質的識別性差導致糖蛋白在色譜圖中分離不佳，質譜中有一簇分子量不準確的分辨不清的峰。目前，蛋白糖基化研究的主要策略是利用現(xiàn)有的技術體系對糖基化蛋白的糖基化肽段進行分離和富集，消除糖基化的異質性及其對質譜的影響，標記糖基化位點。浙江糖基化修飾蛋白質組學分析

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