非標定量法(Label-free)是通過比較質譜分析次數或質譜峰強度，分析不同來源樣品蛋白的數量變化，認為肽段在質譜中被捕獲檢測的頻率與其在混合物中的豐度成正相關，因此蛋白質被質譜檢測的計數反映了蛋白質的豐度，通過適當的數學公式可以將質譜檢測計數與蛋白質的量聯系起來,從而對蛋白質進行定量。按照其原理主要分為兩種，第1種spectrumcounts類的非標記方法，發(fā)展比較早，已經形成多種定量算法，但是主要的原理都是以MS2的鑒定結果為定量基礎，各種方法的差別在于后期算法在大規(guī)模數據上的修正。第二種非標記定量的原理是以MS1為基礎，計算每個肽段的信號強度在LC-MS上的積分。蛋白質組研究技術涉及到各種重要的生物學現象，如信號轉導、細胞分化、蛋白質折疊等等。濟南PRM定量蛋白質組學項目
蛋白質組學，指對某一基因組所表達的所有蛋白質及其特征進行大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究，以期望在蛋白質水平上解釋控制復雜的生命活動的分子網絡。研究的內容主要包括：組成蛋白質一級結構氨基酸的序列特征、蛋白質的豐度、蛋白質活性、蛋白質的修飾、亞細胞定位和三維結構、蛋白質之間的相互作用以及對蛋白質的高階復合物結構。質譜技術的發(fā)展為這些研究提供了有力的技術支撐，使得許多有實際應用的蛋白質組功能研究成為可能，包括翻譯后修飾的整體分析，蛋白質相互作用網絡的重建和模式生物蛋白表達譜的定量研究；在臨床醫(yī)學和轉化醫(yī)學研究中也越來越多地應用到蛋白質組學技術。貴州定量蛋白組學費用目前國際上許多大型藥物公司正投入大量的人力和物力進行蛋白質組學方面的應用性研究。
蛋白質組學在醫(yī)學的研究應用：蛋白質組學(Proteomics)是研究細胞、組織或生物體中蛋白質組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學，包括對蛋白質表達模式和蛋白質組功能模式的研究。蛋白質組學的發(fā)展對尋找疾病的診斷標志、篩選藥物靶點、毒理學研究等有重要意義，也因此被普遍應用于醫(yī)學研究。蛋白質組學研究，總體可分為一下幾個步驟：（1）差異篩選（Discovery）（2）初步驗證（Verification）（3）然后確診（Validation）。基于質譜的蛋白質組學是目前比較主流的高通量蛋白質研究手段，當前在醫(yī)療健康方面的應用主要集中于基礎研究和轉化醫(yī)學。
蛋白質組學技術：生物質譜：生物質譜技術是蛋白質組學研究中比較重要的鑒定技術，其基本原理是樣品分子離子化后，根據不同離子之間的荷質比（M/E）的差異來分離并確定分子量。對于經過雙向電泳分離的目標蛋白質用胰蛋白酶酶解（水解Lys或Arg的-C端形成的肽鍵）成肽段，對這些肽段用質譜進行鑒定與分析。目前常用的質譜包括兩種：基質輔助激光解吸電離-飛行時間質譜（MALDI-TOF-MS）和電噴霧質譜（ESI-MS）。蛋白質組的研究不但能為生命活動規(guī)律提供物質基礎，也能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據和解決途徑。蛋白質組的概念指由一個基因組，或一個細胞、組織表達的所有蛋白質。
定量蛋白質組學方法學介紹：iTRAQ：iTRAQ定量是目前定量蛋白質組學應用比較普遍的技術，該技術的關鍵原理是多肽標記和定量，將多肽的含量轉化為114、115、116和117同位素的含量(或113、114、115、116、117、118、119和121的8標記)，從而簡化了定量的復雜性，然后通過多肽定量值回歸到蛋白的定量值，從而測定出不同樣本之間蛋白質的差異。iTRAQ定量不依賴樣本，可檢測出較低豐度蛋白，胞漿蛋白、膜蛋白、胞外蛋白等，且定量準確，可同時對8個樣本進行分析，并可同時得出鑒定和定量的結果，特別適用于采用多種處理方式或來自多個處理時間的樣本的差異蛋白分析。在當前的生物醫(yī)學研究和臨床診斷中，蛋白質組學相關技術有非常多的應用。廣東DIA定量蛋白質組學一般流程
蛋白質組學技術的本質（從分析化學角度來看），就是對蛋白質的定性定量分析。濟南PRM定量蛋白質組學項目
蛋白質組學技術：飛行時間質譜：MALDI的基本原理是將分析物分散在基質分子（尼古丁酸及其同系物）中并形成晶體，當用激光（337nm的氮激光）照射晶體時，基質分子吸收激光能量，樣品解吸附，基質-樣品之間發(fā)生電荷轉移使樣品分子電離。它從固相標本中產生離子，并在飛行管中測定其分子量，MALDI-TOF-MS一般用于肽質量指紋圖譜，非常快速（每次分析只需3~5min），靈敏（達到fmol水平），可以精確測量肽段質量，但是如果在分析前不修飾肽段，MALDI-TOF-MS不能給出肽片段的序列。濟南PRM定量蛋白質組學項目
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