廣州高通量轉(zhuǎn)錄組學應(yīng)用

來源: 發(fā)布時間:2021-12-26

轉(zhuǎn)錄組是特定發(fā)育階段或生理條件下細胞內(nèi)的完整轉(zhuǎn)錄信息的匯合,表示了基因表達的中間狀態(tài)。轉(zhuǎn)錄組測序可以對所有轉(zhuǎn)錄物進行分類、確定基因的轉(zhuǎn)錄結(jié)構(gòu)、量化轉(zhuǎn)錄物的表達水平。蛋白質(zhì)是生命功能的直接執(zhí)行者,蛋白組是一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質(zhì)。整合轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學的表達數(shù)據(jù)對生物樣本進行研究,可以從整體上解釋生物學問題,探究生物體生理和疾病機理等。轉(zhuǎn)錄組學應(yīng)用于胃腸瘤發(fā)生機制研究:利用轉(zhuǎn)錄組學可檢測瘤細胞惡化過程中的RNA(編碼RNA及非編碼RNA)的變化,有助于更好地理解胃腸瘤的發(fā)生機制。轉(zhuǎn)錄組學無需了解物種基因信息,能夠直接對任何物種進行轉(zhuǎn)錄組分析。廣州高通量轉(zhuǎn)錄組學應(yīng)用

RNA-seq轉(zhuǎn)錄組學技術(shù)優(yōu)勢有:1、可以直接測定每個轉(zhuǎn)錄本片段序列、單核苷酸分辨率的準確度;2、靈敏度高,可以檢測細胞中少至幾個拷貝的稀有轉(zhuǎn)錄本;3、可以對任意物種進行全基因組分析,能夠檢測未知基因,發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本,并準確地識別可變剪切位點及cSNP,UTR區(qū)域;4、檢測范圍廣,能夠同時鑒定和定量稀有轉(zhuǎn)錄本和正常轉(zhuǎn)錄本。RNA-seq轉(zhuǎn)錄組學是需要生物學重復(fù)的,至少需要兩次生物學重復(fù),3次以上的生物學重復(fù)更好。以3個重復(fù)為例,加上對照的三個生物學重復(fù),一次RNA-seq需要6個樣本。湖北轉(zhuǎn)錄組學服務(wù)RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學即對轉(zhuǎn)錄組進行測序和分析。

轉(zhuǎn)錄組及轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq):轉(zhuǎn)錄組即特定細胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA。轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)主要通過高通量測序研究特定組織或細胞在某個時期轉(zhuǎn)錄出來的mRNA的表達量,進而對相關(guān)基因和表型的關(guān)系進行分析。本質(zhì)上講RNA-seq就是在用一種新的方法實現(xiàn)“基因決定性狀”的經(jīng)典思路。在RNA-seq之前用于研究基因組表達分析的主要技術(shù)是基因芯片,不過由于高通量測序成本的下降,RNA-seq的運用愈來愈普遍。

轉(zhuǎn)錄組學應(yīng)用領(lǐng)域:農(nóng)林領(lǐng)域:生長發(fā)育機制,抗逆脅迫機制,育種,物種保護研究等;畜牧業(yè):生長發(fā)育機制,致病機理研究,肉類及乳制品品質(zhì)研究等;海洋水產(chǎn):生長發(fā)育機制,漁業(yè)資源,漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等;微生物:致病機理,耐藥機制,病原體-宿主相互作用研究等;生物醫(yī)藥:生物標志物,疾病機理機制,疾病分型,藥物開發(fā),個性化醫(yī)治等;環(huán)境科學:發(fā)酵過程優(yōu)化,生物燃料生產(chǎn),環(huán)境危害風險評估研究等;食品科學:食品儲藏及加工條件優(yōu)化,食品組分及品質(zhì)鑒定,功能性食品開發(fā),食品安全監(jiān)檢測等。轉(zhuǎn)錄組學測序有什么樣的樣品要求?

轉(zhuǎn)錄組學和基因組學目前有實用價值嗎?二者實用價值非常大,尤其是對有瘤的患者的醫(yī)治,簡直顛覆了傳統(tǒng)醫(yī)治的模式。轉(zhuǎn)錄組和基因組月在生物學研究中有著重要價值。例如研究某個基因功能的時候,可以構(gòu)建該基因的敲除或者過表達生物,然后對比野生型進行轉(zhuǎn)錄組分析看看該基因涉及什么表達網(wǎng)絡(luò)。此外在醫(yī)學方面的應(yīng)用也很大,例如在有的瘤病人中進行基因組學測序和分析能夠了解其中的發(fā)生的發(fā)展的驅(qū)動基因,然后能根據(jù)發(fā)展的驅(qū)動基因研究靶向藥物,從而推動瘤的藥物研發(fā)和醫(yī)治!轉(zhuǎn)錄組學分析轉(zhuǎn)錄本的結(jié)構(gòu)和表達水平的同時,還能發(fā)現(xiàn)未知轉(zhuǎn)錄本和稀有轉(zhuǎn)錄本。武漢單細胞轉(zhuǎn)錄組學技術(shù)分析

轉(zhuǎn)錄組學有高通量、更精確的數(shù)字信號。廣州高通量轉(zhuǎn)錄組學應(yīng)用

宏轉(zhuǎn)錄組學也稱為環(huán)境轉(zhuǎn)錄組學,指從整體水平上研究某一特定環(huán)境、特定時期菌群群體全部基因轉(zhuǎn)錄情況以及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律,以揭示微生物在不同環(huán)境壓力下的適應(yīng)機制,探索環(huán)境與微生物之間的相互作用機理。其適用范圍包括人體微生態(tài)、環(huán)境、工業(yè)、農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域。宏轉(zhuǎn)錄組學以生態(tài)環(huán)境中的全部RNA為研究對象,避開了微生物分離培養(yǎng)困難的問題,能有效的擴展微生物資源的利用空間。應(yīng)用領(lǐng)域:包括腸道微生物、口腔微生物、糞便微生物、人體組織微生物。廣州高通量轉(zhuǎn)錄組學應(yīng)用

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