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來源: 發(fā)布時間:2022-05-26

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學是什么?蛋白質(zhì)翻譯后修飾是指蛋白質(zhì)在翻譯中或翻譯后經(jīng)歷的一個共價加工過程,即通過1個或幾個氨基酸殘基加上修飾基團或通過蛋白質(zhì)水解剪去基團而改變蛋白質(zhì)的性質(zhì)。蛋白質(zhì)氨基酸序列的特定位置可以與化學基團或者小分子量的蛋白共價結(jié)合從而發(fā)生蛋白質(zhì)翻譯后修飾(post-translational modifications,PTMs),相較于沒有發(fā)生修飾的蛋白,PTMs會導致特定序列分子量的增加。在蛋白翻譯后修飾方式的鑒定過程中,蛋白會首先被酶切成肽段,然后進入質(zhì)譜進行分析;通過質(zhì)譜分析,得到的是一系列肽段的分子質(zhì)量信息。對于某一個特定肽段而言,在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下,其序列信息和分子量是確定的。蛋白質(zhì)磷酸化對于許多生物現(xiàn)象的引發(fā)是很必要的。北京丙二?;揎椀鞍踪|(zhì)組學服務

乙?;揎椀鞍捉M學介紹:蛋白質(zhì)乙?;?Acetylation)是蛋白在乙?;D(zhuǎn)移酶(或非酶)的催化下,將乙?;鶊F轉(zhuǎn)移并添加在蛋白賴氨酸殘基或蛋白N端上的過程,在調(diào)控蛋白質(zhì)功能、染色質(zhì)結(jié)構和基因表達中起重要作用。乙酰化修飾主要分為兩類:蛋白N端的乙?;揎椇偷鞍踪嚢彼嵘系囊阴;揎棥端乙?;揎棿蟛糠职l(fā)生在真核生物的蛋白上,由N乙酰轉(zhuǎn)移酶(NATs)催化;賴氨酸上的乙?;揎検且粋€可逆的過程,主要由賴氨酸乙酰化酶(KATs)和賴氨酸去乙?;?KDACs)催化。濟南蛋白質(zhì)甲基化修飾組學價錢蛋白質(zhì)翻譯后修飾 (PTMs) 進一步促進了從基因組水平到蛋白質(zhì)組復雜性的增加。

磷酸化修飾蛋白組學應用:蛋白質(zhì)組(Proteome)泛指一個生命體內(nèi)所有蛋白質(zhì),蛋白質(zhì)組學(Proteomics)是以蛋白質(zhì)組為研究對象,研究細胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學,是對蛋白質(zhì)進行定性、定量及功能的分析。定性分析包括鑒定蛋白質(zhì)的序列、PTM及蛋白之間的相互作用,對比來看,磷酸化蛋白質(zhì)組(Phosphoproteome)就是蛋白質(zhì)組中全部的磷酸化蛋白質(zhì),而磷酸化蛋白質(zhì)組學(Phosphoproteomics,下文簡稱PP)就是針對磷酸化蛋白質(zhì)的全方面的分析,包括對磷酸化的鑒定、定位和定量。本來屬于蛋白質(zhì)組學的一個分支,但隨著研究的深入,人們在各個領域關于PP都有重大發(fā)現(xiàn),基于PP的研究也越來越多。

泛素化修飾蛋白質(zhì)組學技術原理:盡管質(zhì)譜儀器的分析能力近年來有了長足的發(fā)展,但是由于蛋白翻譯后修飾化學計量值低、復雜性大,直接將蛋白組(如全細胞裂解產(chǎn)物,組織勻漿產(chǎn)物或全血清蛋白)的酶解肽段送入質(zhì)譜鑒定和定量PTM是非常困難的。因此,很多翻譯后修飾的富集方法會被采用,來提高樣品中PTM肽段的豐度和相對比例,從而提高了質(zhì)譜對翻譯后修飾位點的鑒定效率。研究發(fā)現(xiàn)在泛素化修飾的蛋白在tyrpsin的作用下都會產(chǎn)生diGly位點。基于這一特異性,利用針對蛋白質(zhì)翻譯后修飾(PTM)基序(motif)抗體,在肽段水平上免疫親和富集帶有泛素化修飾的肽段,利用液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS/MS)進行定量分析,能夠快速、準確、高通量地分析多種疾病相關信號通路關鍵節(jié)點蛋白修飾的變化,滿足創(chuàng)新性研究、生物標志物鑒定、藥物靶點篩選和評價的需求。目前,發(fā)現(xiàn)的比較常見的修飾類型是糖基化、泛素化和磷酸化。

泛素化修飾蛋白質(zhì)組學的作用:泛素化、心血管等疾病的發(fā)病密切相關。因此,作為近年來生物化學研究的一個重大成果,它已然成為研究、開發(fā)新藥物的新靶點。技術原理是首先將蛋白樣本酶解成肽段混合物,然后使用液相色譜對酶解后的肽段混合物進行組分分離以降低樣本復雜程度,然后通過高質(zhì)量的泛素化修飾抗體和生物材料對修飾肽段進行富集,之后上樣至液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜中進行分析定量。技術優(yōu)勢:高特異性的修飾抗體;高分辨率、高靈敏度質(zhì)譜儀;鑒定通量高;可與代謝組學等進行多組學聯(lián)合分析。蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。江蘇蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學質(zhì)譜鑒定

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學自中而下的蛋白質(zhì)組學技術可用于組蛋白修飾的分析。北京丙二酰化修飾蛋白質(zhì)組學服務

琥珀?;揎椀鞍踪|(zhì)組技術特點:采用主流抗體親和富集方法,特異性高,富集效率好;通過高分辨率、高掃描速度的質(zhì)譜,對富集的琥珀酰化肽段進行大規(guī)模鑒定;結(jié)合常用的定量技術可對不同樣品間的琥珀酰化水平差異進行定量比較。適用范圍:藥物作用靶點研究;疾病標志物篩選;植物脅迫/抗逆研究;作用機制研究;要求物種具有蛋白質(zhì)參考數(shù)據(jù)庫、EST序列(轉(zhuǎn)錄組)或基因組注釋信息。應用方向:線粒體代謝、生物合成與代謝、中心代謝途徑、炎癥與疾病。北京丙二?;揎椀鞍踪|(zhì)組學服務