湖北定量N糖基化蛋白質組學一般流程

來源: 發(fā)布時間:2022-05-11

蛋白質組研究:蛋白質組研究是指系統(tǒng)研究在某一特定時間、特定條件下,某一種特定組織中的所有蛋白質。對蛋白質的研究也不只是局限于蛋白質的氨基酸序列,而是包括了蛋白質的表達量,蛋白質活性,被修飾的狀況以及和其他蛋白質或分子的相互作用情況、亞細胞定位和三維結構。這些信息對于全方面了解復雜的生物系統(tǒng)有著重要的意義。因此,蛋白質組學研究目標是大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究蛋白質的特性,以期望在蛋白質水平上解釋控制復雜的生命活動的分子網絡。蛋白質組學將成為尋找疾病分子標記和藥物靶標比較有效的方法之一。湖北定量N糖基化蛋白質組學一般流程

蛋白質組結果一般需要做哪些方面的生物信息學分析?目前一般文獻中的分析主要為維恩圖分析、熱圖分析、火山圖分析、層次聚類分析、蛋白質功能分析(GO分類為主)、蛋白質所屬代謝通路富集分析(基于KEGG的pathway)、差異蛋白互作網絡構建、轉錄因子預測等方面。其它一些比較特異的高級分析包括多組數據關聯分析、多pathway延伸分析、磷酸蛋白激酶預測分析、互作網絡及生物調控模型構建分析。定量蛋白質組學技術主要分為標記(label)和非標記(labelfree)定量策略,標記策略又分為體內標記和體外標記兩種。細胞內蛋白質組豐度的動態(tài)變化對各種生命過程有重要影響。例如在許多疾病的發(fā)生和發(fā)展進程中,常常伴隨著某些蛋白質的表達異常。定量蛋白質組學就是把一個基因組表達的全部蛋白質或一個復雜的混合體系中所有的蛋白質進行精確的定量和鑒定。北京TMT/iTRAQ標記定量蛋白質組學分析研究蛋白質組學在醫(yī)療和健康方面有什么應用呢?

蛋白質組學技術:蛋白質組學技術的發(fā)展已經成為現代的生物技術快速發(fā)展的重要支撐,并將帶領生物技術取得關鍵性的突破。為幫助生命科學領域的工作者全方面掌握蛋白質組學的技術與方法、實驗難點與關鍵點、研究前沿與熱點,包括雙向凝膠電泳、等電聚焦、生物質譜分析及非凝膠技術。雙向凝膠電泳:雙向凝膠電泳的原理是第1向基于蛋白質的等電點不同用等電聚焦分離,第二向則按分子量的不同用SDS-PAGE分離,把復雜蛋白混合物中的蛋白質在二維平面上分開。由于雙向電泳技術在蛋白質組與醫(yī)學研究中所處的重要位置,它可用于蛋白質轉錄及轉錄后修飾研究,蛋白質組的比較和蛋白質間的相互作用,細胞分化凋亡研究,致病機制及耐藥機制的研究,療效監(jiān)測,新藥開發(fā),病癥研究,蛋白純度檢查,小量蛋白純化,新替代疫苗的研制等許多方面。近年來經過多方面改進已成為研究蛋白質組的比較有使用價值的關鍵方法。

定量蛋白質組學技術:定量蛋白質組學是蛋白質組研究的重要內容,通過對基因表達產物——蛋白質的定量分析,以了解基因在不同的生理、病理和逆境條件下的表達情況。近年來,隨著非凝膠技術的發(fā)展,蛋白質組學(“Shotgun”proteomics)技術,特別是多維蛋白質鑒定(MultidimensionalProteinIdentification,MudPIT)已成為研究復雜生物樣本中大規(guī)模蛋白質表達和定性和定量分析的強有力工具。蛋白質組學在醫(yī)學的研究應用:蛋白質組學是研究細胞、組織或生物體中蛋白質組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學。蛋白質組學技術的本質(從分析化學角度來看),就是對蛋白質的定性定量分析。

iTRAQ/TMT 標記定量蛋白質組學:iTRAQ 和 TMT 技術采用多種同位素標記,可與氨基反應實現連接,實現多個樣本蛋白組的定性與定量。技術優(yōu)點:適用范圍廣、高通量、結果可靠。靈敏度高,分離能力強,自動化程度高。 Label Free 非標記定量蛋白質組學:Label Free 技術不依賴同位素標記,可通過液質聯用對蛋白質酶解肽段進行分析,分析大規(guī)模鑒定蛋白質時所產生的質譜數據,對被檢測到的離子峰強度進行積分,以積分面積進行相對定量。蛋白質組學,指對某一基因組所表達的所有蛋白質及其特征進行大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究,以期望在蛋白質水平上解釋控制復雜的生命活動的分子網絡。蛋白質組學的研究是生命科學進入后基因時代的特征。廣東蛋白質定量組學價錢

蛋白質組學研究是生命科學進入后基因時代的特征。湖北定量N糖基化蛋白質組學一般流程

蛋白質組學技術:生物質譜:生物質譜技術是蛋白質組學研究中比較重要的鑒定技術,其基本原理是樣品分子離子化后,根據不同離子之間的荷質比(M/E)的差異來分離并確定分子量。對于經過雙向電泳分離的目標蛋白質用胰蛋白酶酶解(水解Lys或Arg的-C端形成的肽鍵)成肽段,對這些肽段用質譜進行鑒定與分析。目前常用的質譜包括兩種:基質輔助激光解吸電離-飛行時間質譜(MALDI-TOF-MS)和電噴霧質譜(ESI-MS)。蛋白質組的研究不但能為生命活動規(guī)律提供物質基礎,也能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據和解決途徑。湖北定量N糖基化蛋白質組學一般流程