北京蛋白質丙二酰化修飾組學有哪些

來源: 發(fā)布時間:2022-05-10

泛素化修飾蛋白質組學技術原理:盡管質譜儀器的分析能力近年來有了長足的發(fā)展,但是由于蛋白翻譯后修飾化學計量值低、復雜性大,直接將蛋白組(如全細胞裂解產物,組織勻漿產物或全血清蛋白)的酶解肽段送入質譜鑒定和定量PTM是非常困難的。因此,很多翻譯后修飾的富集方法會被采用,來提高樣品中PTM肽段的豐度和相對比例,從而提高了質譜對翻譯后修飾位點的鑒定效率。研究發(fā)現(xiàn)在泛素化修飾的蛋白在tyrpsin的作用下都會產生diGly位點?;谶@一特異性,利用針對蛋白質翻譯后修飾(PTM)基序(motif)抗體,在肽段水平上免疫親和富集帶有泛素化修飾的肽段,利用液相色譜-串聯(lián)質譜(LC-MS/MS)進行定量分析,能夠快速、準確、高通量地分析多種疾病相關信號通路關鍵節(jié)點蛋白修飾的變化,滿足創(chuàng)新性研究、生物標志物鑒定、藥物靶點篩選和評價的需求。常見的蛋白質翻譯后修飾包括糖基化。北京蛋白質丙二?;揎椊M學有哪些

乙?;揎椀鞍捉M學應用方向:1、乙?;揎椗c細胞基因表達調控、表觀調控、細胞凋亡、細胞代謝、信號轉導、蛋白質穩(wěn)定性等生理過程研究。2、乙酰化引起的代謝疾病、代謝紊亂發(fā)生等疾病機理研究。乙?;飳W意義:1、調節(jié)DNA-蛋白、蛋白-蛋白相互作用;2、與其他PTMs發(fā)生crosstalk;3、調節(jié)酶活性;4、調控蛋白亞細胞定位。生物領域各個研究方面,如:1、農林領域:抗逆脅迫機制,生長發(fā)育機制,育種保護研究等;2、 畜牧業(yè):肉類及乳品質研究,致病機理研究等。江蘇蛋白質丙?;揎椊M學質譜分析蛋白質翻譯后修飾在蛋白質中磷酸化位點分析時應該注意些什么問題?

蛋白質的甲基化修飾 :蛋白質的甲基化(methylation)是指將甲基酶促轉移到蛋白質的某個殘基上,通常是賴氨酸或精氨酸,也包括組氨酸、半胱氨酸和天冬酰胺等。蛋白質的甲基化是一種普遍的修飾,在大鼠肝細胞核的總蛋白提取物中,大約2%的精氨酸殘基是二甲基化的。蛋白質甲基化經(jīng)常與乙?;⒘校驗樗鼈兌际浅R姷谋碛^遺傳修飾,經(jīng)常發(fā)生在組蛋白上。不過從化學反應的角度來看,乙酰化可以算作一種短鏈脂?;揎棧@里主要討論甲基化方面的問題。

翻譯后修飾蛋白組分析:蛋白質翻譯后修飾(PTMs)是指蛋白質在翻譯中或翻譯后的化學修飾過程。蛋白質翻譯后修飾(PTMs)通過給蛋白質添加磷酸酯、乙酸酯、酰胺基或甲基等官能團增加蛋白質組的功能多樣性,并影響正常細胞生物學和發(fā)病機理的幾乎所有方面。蛋白質翻譯后修飾在許多細胞過程中起著關鍵作用,如細胞分化、蛋白質降解、信號傳導和調節(jié)過程、基因表達調節(jié)以及蛋白質相互作用。蛋白質翻譯后修飾PTMs通常包括磷酸化、糖基化、泛素化、亞硝基化、甲基化、乙?;?、脂質化和蛋白水解。因此,PTM的特征(包括修飾類別和修飾位點)在細胞生物學以及疾病診斷和預防研究中至關重要。蛋白質翻譯后修飾(PTMs)是指蛋白質在翻譯中或翻譯后的化學修飾過程。

甲基化修飾蛋白質組學技術應用領域:基礎醫(yī)學、臨床診斷:生物標志物,疾病機理機制,疾病分型,個性化治理等;生物醫(yī)藥:藥物作用機理,藥效評價,藥物開發(fā)等;農林領域:抗逆脅迫機制,生長發(fā)育機制,育種保護研究等;畜牧業(yè):肉類及乳品質研究,致病機理研究等;微生物領域:致病機理,耐藥機制,病原體-宿主相互作用研究等;海洋水產:漁業(yè)資源,海水養(yǎng)殖,漁業(yè)環(huán)境與水產品安全等。技術優(yōu)勢:采用抗體,特異性高;鑒定通量高, 一次可檢測高可達上千個甲基化修飾位點。蛋白質磷酸化修飾鑒定方法有免疫印跡技術。北京蛋白質丙二?;揎椊M學有哪些

磷酸化修飾蛋白質組學是原核生物和真核生物中比較重要的調控修飾形式。北京蛋白質丙二?;揎椊M學有哪些

蛋白質翻譯后修飾:蛋白質翻譯后修飾 (Protein translational modifications,PTMs) 通過功能基團或蛋白質的共價添加、調節(jié)亞基的蛋白水解切割或整個蛋白質的降解來增加蛋白質組的功能多樣性。這些修飾包括磷酸化、糖基化、泛素化、亞硝基化、甲基化、乙酰化、脂質化和蛋白水解,幾乎影響正常細胞生物學和發(fā)病機制的所有方面。因此,識別和理解 PTM 在細胞生物學和疾病療理和預防的研究中至關重要。蛋白質翻譯后修飾 (PTMs) 進一步促進了從基因組水平到蛋白質組復雜性的增加。PTMs 是一種化學修飾,在功能蛋白質組中發(fā)揮關鍵作用,因為它們調節(jié)活性、定位以及與其他細胞分子(如蛋白質、核酸、脂質和輔助因子)的相互作用。北京蛋白質丙二酰化修飾組學有哪些