轉(zhuǎn)錄組及轉(zhuǎn)錄組測序（RNA-seq）：轉(zhuǎn)錄組即特定細胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA。轉(zhuǎn)錄組測序（RNA-seq）主要通過高通量測序研究特定組織或細胞在某個時期轉(zhuǎn)錄出來的mRNA的表達量，進而對相關(guān)基因和表型的關(guān)系進行分析。本質(zhì)上講RNA-seq就是在用一種新的方法實現(xiàn)“基因決定性狀”的經(jīng)典思路。在RNA-seq之前用于研究基因組表達分析的主要技術(shù)是基因芯片，不過由于高通量測序成本的下降，RNA-seq的運用愈來愈普遍。狹義上轉(zhuǎn)錄組學的指所有mRNA的組合。單細胞轉(zhuǎn)錄組學研究內(nèi)容
轉(zhuǎn)錄組學的概念：轉(zhuǎn)錄組是指特定組織或細胞在某一發(fā)育階段或功能狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的匯合，包括蛋白質(zhì)編碼的信使RNA和非編碼RNA（rRNA、tRNA和其他ncRNAs），高通量測序技術(shù)也被稱為下一代測序（NGS）技術(shù)，推進了基因組學的研究進展。該項新技術(shù)除了研究靜態(tài)基因組，近年來也開始應用于動態(tài)轉(zhuǎn)錄分析，由此衍生的技術(shù)稱為RNA序列分析（RNA-seq）隨著DNA基因芯片技術(shù)的快速發(fā)展，開創(chuàng)了這個病癥近十年的高通量轉(zhuǎn)錄組研究。RNA-Seq技術(shù)可以從轉(zhuǎn)錄水平檢測瘤中的改變基因。通過相關(guān)軟件分析，鑒定相關(guān)改變基因在瘤發(fā)生的發(fā)展中所起的作用。然后經(jīng)過刷選，進一步挑選出相關(guān)靶基因進行實驗研究，有望為瘤的基因醫(yī)治提供新的靶點。浙江SmalIRNA轉(zhuǎn)錄組學技術(shù)基于高通量測序平臺的轉(zhuǎn)錄組學測序技術(shù)能夠全方面獲得物種特定組織的轉(zhuǎn)錄本信息。
宏轉(zhuǎn)錄組學適用范圍包括人體微生態(tài)、環(huán)境、工業(yè)、農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域。宏轉(zhuǎn)錄組學以生態(tài)環(huán)境中的全部RNA為研究對象，避開了微生物分離培養(yǎng)困難的問題，能有效的擴展微生物資源的利用空間。應用領(lǐng)域：包括腸道微生物、口腔微生物、糞便微生物、人體組織微生物。宏轉(zhuǎn)錄學組的概念：宏轉(zhuǎn)錄組是特定時期、環(huán)境樣本、組織樣本中所有的微生物的RNA（轉(zhuǎn)錄本）的匯合。通過對這些轉(zhuǎn)錄本進行大規(guī)模高通量測序，可以直接獲得環(huán)境中可培養(yǎng)和不可培養(yǎng)的微生物轉(zhuǎn)錄組信息。
轉(zhuǎn)錄組分析是目前應用比較廣的高通量測序分析技術(shù)之一。常見設(shè)計是不同樣品之間比較，尋找差異基因、標志基因、協(xié)同變化基因、差異剪接和新轉(zhuǎn)錄本，并進行結(jié)果可視化、功能注釋和網(wǎng)絡(luò)分析等。轉(zhuǎn)錄組的測序分析也相對成熟，從RNA提取、構(gòu)建文庫、上機測序再到結(jié)果解析既可以自己完成，又可以在專業(yè)公司進行。概括來看轉(zhuǎn)錄組的分析流程比較簡單，序列比對-轉(zhuǎn)錄本拼接(可選)-表達定量-差異基因-功能富集-定制分析。整個環(huán)節(jié)清晰流暢，可以作為剛開始接觸高通量測序?qū)W習比較合適的技術(shù)之一。轉(zhuǎn)錄組學可以在單核苷酸水平對任意物種的整體轉(zhuǎn)錄活動進行檢測。
轉(zhuǎn)錄組學測序比其他研究方法有哪些優(yōu)勢?轉(zhuǎn)錄組學測序具有以下優(yōu)勢：（1）可以直接測定每個轉(zhuǎn)錄本片段序列、單核苷酸分辨率的準確度，同時不存在傳統(tǒng)微陣列雜交的熒光模擬信號帶來的交叉反應和背景噪音問題；（2）靈敏度高，可以檢測細胞中少至幾個拷貝的稀有轉(zhuǎn)錄本；（3）可以對任意物種進行全基因組分析，無需預先設(shè)計特異性探針，因此無需了解物種基因信息，能夠直接對任何物種進行轉(zhuǎn)錄組分析，同時能夠檢測未知基因，發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本，并準確地識別可變剪切位點及cSNP，UTR區(qū)域。（4）檢測范圍廣，高于6個數(shù)量級的動態(tài)檢測范圍，能夠同時鑒定和定量稀有轉(zhuǎn)錄本和正常轉(zhuǎn)錄本。轉(zhuǎn)錄組廣義上指在某一生理條件下，細胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄組產(chǎn)物的組合。單細胞轉(zhuǎn)錄組學研究內(nèi)容
轉(zhuǎn)錄組學能夠檢測未知基因，發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本。單細胞轉(zhuǎn)錄組學研究內(nèi)容
轉(zhuǎn)錄組學應用領(lǐng)域：海洋水產(chǎn)：生長發(fā)育機制，漁業(yè)資源，漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等；微生物：致病機理，耐藥機制，病原體-宿主相互作用研究等；生物醫(yī)藥：生物標志物，疾病機理機制，疾病分型，藥物開發(fā)，個性化醫(yī)治等；環(huán)境科學：發(fā)酵過程優(yōu)化，生物燃料生產(chǎn)，環(huán)境危害風險評估研究等；食品科學：食品儲藏及加工條件優(yōu)化，食品組分及品質(zhì)鑒定，功能性食品開發(fā)，食品安全監(jiān)檢測等。轉(zhuǎn)錄組是特定發(fā)育階段或生理條件下細胞內(nèi)的完整轉(zhuǎn)錄信息的匯合，表示了基因表達的中間狀態(tài)。單細胞轉(zhuǎn)錄組學研究內(nèi)容