宏轉(zhuǎn)錄學組概念：宏轉(zhuǎn)錄組測序是對某一特定時期、特定環(huán)境樣品中的全部微生物的RNA進行高通量測序，直接獲得該環(huán)境中所有微生物轉(zhuǎn)錄組信息的一種測序技術的新應用。宏轉(zhuǎn)錄組中不只包含有微生物的物種信息，還有微生物的基因表達信息。如果說宏基因組能告訴我們微生物群，那么宏轉(zhuǎn)錄組則能告訴我們這些微生物，這有助于挖掘微生物功能基因和探索微生物與環(huán)境、疾病、動植物等關系的機制。宏轉(zhuǎn)錄組分析：從以G為單位的高通量測序數(shù)據(jù)中獲取研究所需的微生物種類、基因、通路等信息是進行宏轉(zhuǎn)錄組研究必須經(jīng)歷的一步。現(xiàn)在網(wǎng)絡上分析組學數(shù)據(jù)的工具五花八門。能否從眾多組學工具中選擇出適合分析宏轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的軟件，能否搭建一套完整、快速、高效、靈敏、高精確的宏轉(zhuǎn)錄組分析pipline，直接關乎到后期數(shù)據(jù)分析的進行。轉(zhuǎn)錄組具有組織特異性的特點。深圳circ RNA轉(zhuǎn)錄組學
轉(zhuǎn)錄組學(Transcriptomics)，是一門在真整體水平上研究細胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學科，從RNA水平研究基因的表達情況。轉(zhuǎn)錄組測序是通過二代測序平臺快速全方面地獲得某一物種特定細胞或組織在某一狀態(tài)下的幾乎所有的轉(zhuǎn)錄本及基因序列，可以用來研究基因表達量、基因功能、結構、可變剪接和預測新的轉(zhuǎn)錄本等等。轉(zhuǎn)錄組（transcriptome），是指特定生長階段某組織或細胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的匯合，狹義上指所有mRNA的匯合。轉(zhuǎn)錄組學即特定細胞在某一功能狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA。湖北高通量轉(zhuǎn)錄組學研究內(nèi)容轉(zhuǎn)錄組學測序必須做生物學重復么？
轉(zhuǎn)錄組學應用領域：海洋水產(chǎn)：生長發(fā)育機制，漁業(yè)資源，漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等；微生物：致病機理，耐藥機制，病原體-宿主相互作用研究等；生物醫(yī)藥：生物標志物，疾病機理機制，疾病分型，藥物開發(fā)，個性化醫(yī)治等；環(huán)境科學：發(fā)酵過程優(yōu)化，生物燃料生產(chǎn)，環(huán)境危害風險評估研究等；食品科學：食品儲藏及加工條件優(yōu)化，食品組分及品質(zhì)鑒定，功能性食品開發(fā)，食品安全監(jiān)檢測等。轉(zhuǎn)錄組是特定發(fā)育階段或生理條件下細胞內(nèi)的完整轉(zhuǎn)錄信息的匯合，表示了基因表達的中間狀態(tài)。
轉(zhuǎn)錄組學測序結果的影響因素？RNA的降解嚴重影響測序的質(zhì)量，RNA降解后，加入poly-A后無法捕獲純化mRNA，因此，隨機引物反轉(zhuǎn)錄無法得到全部的cDNA，導致測序結果出現(xiàn)明顯的3‘-和5’-偏向。文庫中的poly-A多聚物的存在會對測序信號產(chǎn)生干擾，影響測序結果的準確性；同時由于轉(zhuǎn)錄組中轉(zhuǎn)錄本的豐度不一致，實驗前需要對樣本進行均一化處理，否則高豐度的表達基因會掩蓋低豐度表達基因，導致尋找新基因失敗或者是獲得大量無意義的重復序列。RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學有著巨大的應用前景。
轉(zhuǎn)錄組學：轉(zhuǎn)錄組學是研究特定的細胞、組織或個體在特定時間和狀態(tài)下所轉(zhuǎn)錄出所有RNA的學科，轉(zhuǎn)錄組測序是指利用高通量測序方法，研究特定的細胞、組織或個體在特定時間和狀態(tài)下所轉(zhuǎn)錄出的所有mRNA，用于揭示不同功能狀態(tài)下的基因表達、結構的差異，闡明分子機制。應用領域：醫(yī)學研究：疾病標志物篩查、疾病的診斷和分型、疾病復發(fā)診斷、病因與病理機制探究、臨床療效評價、藥物毒理學評價。生命科學研究：非生物環(huán)境關系研究、植物與微生物、在表型鑒定中的應用、代謝途徑及功能基因組研究、藥用植物研究中的應用。轉(zhuǎn)錄組學可應用于基因點突變及多態(tài)性檢測。湖北高通量轉(zhuǎn)錄組學研究內(nèi)容
轉(zhuǎn)錄學組測序是目前深入研究轉(zhuǎn)錄組復雜性的強大工具。深圳circ RNA轉(zhuǎn)錄組學
轉(zhuǎn)錄組學研究的方法：轉(zhuǎn)錄組學是一門在整體水平上研究細胞中所有基因轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學科。在早期，由于測序價格昂貴、基因序列數(shù)目有限，轉(zhuǎn)錄組學研究者只能進行極少數(shù)特定基因的結構功能分析和表達研究。近十幾年，分子生物學技術的快速發(fā)展使高通量分析成為可能，這為真正意義上的轉(zhuǎn)錄組學的研究奠定了基礎。這些高通量研究方法主要可以分為兩類：一類是基于這類方法包括表達序列標簽技術、基因表達系列分析技術、大規(guī)模平行測序技術、RNA測序技術其中。深圳circ RNA轉(zhuǎn)錄組學