貴陽(yáng)代謝組學(xué)分析

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-04-18

代謝組學(xué)樣品收集方法及所需樣本量是什么?根據(jù)不同的檢測(cè)要求,需要配合不同的樣本量和樣本采集方法,常規(guī)的方法和單個(gè)樣本量如下:(1) 微生物和細(xì)胞樣本:細(xì)胞迅速猝滅細(xì)胞并冷凍保存;單個(gè)樣本細(xì)胞數(shù)量要求10^6。(2) 動(dòng)物體液(如尿、血、組織、唾液):采樣后要迅速預(yù)處理,如加入抗凝血?jiǎng)?、防腐劑,并立即冷凍處理?80 ℃);單個(gè)樣本要求體積為10μL。(3) 植物樣本:采集后迅速冷凍(液氮),然后轉(zhuǎn)入-80℃保存,單個(gè)樣本要求質(zhì)量為50mg。代謝組學(xué)樣品主要是血漿或血清,尿液,唾液,以及細(xì)胞和組織的提取液。貴陽(yáng)代謝組學(xué)分析

靶向代謝組學(xué)的一般分析流程為:1. 數(shù)據(jù)采集 第1步是得到標(biāo)準(zhǔn)品。如果無(wú)法從市場(chǎng)上買到,就必須定制合成。然后通過(guò)優(yōu)化產(chǎn)物離子碰撞能量以得到的信號(hào),再通過(guò)測(cè)定三重串聯(lián)四極桿測(cè)定代謝物的 MRM 躍遷值。2. 定量 接下來(lái)用定量分析軟件對(duì) MRM 數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,得到報(bào)告。3. 統(tǒng)計(jì)分析和解釋 將定量報(bào)告輸入統(tǒng)計(jì)分析軟件包,用統(tǒng)計(jì)工具,如ANOVA,對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理。靶向分析:在基于質(zhì)譜的代謝組學(xué)分析中,要意識(shí)到離子強(qiáng)度和色譜保留時(shí)間都會(huì)隨著時(shí)間的推移而產(chǎn)生漂移,所以在實(shí)驗(yàn)中,要按隨機(jī)順序?qū)颖具M(jìn)行檢測(cè),且數(shù)據(jù)需要在同天同一批次進(jìn)行采集,以減少誤差。南京農(nóng)學(xué)靶向代謝組學(xué)費(fèi)用代謝組學(xué)是一個(gè)相當(dāng)有效率的研究工具。

代謝組學(xué)是研究關(guān)于生物體被擾動(dòng)后(如基因的改變或環(huán)境變化后)其代謝產(chǎn)物(內(nèi)源性代謝物質(zhì))種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學(xué)。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體、組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時(shí)間變化的規(guī)律。代謝組學(xué)通過(guò)揭示內(nèi)在和外在因素影響下代謝整體的變化軌跡來(lái)反映某種病理生理過(guò)程中所發(fā)生的一系列生物事件。代謝組學(xué)在系統(tǒng)生物學(xué)的末端。以人體為例,對(duì)基因序列信息研究是基因組學(xué)的范疇。轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究基因在外在或內(nèi)在環(huán)境刺激下不同的表達(dá)。基因信息翻譯成蛋白質(zhì)后,各種蛋白的形狀、功能、相互關(guān)系是蛋白組學(xué)的研究范疇。各種營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)經(jīng)過(guò)人體的消化、代謝后的代謝物,就是代謝組學(xué)的研究范圍。

非靶向代謝組學(xué):非靶向代謝組學(xué)是將生物體所有內(nèi)源性代謝物作為研究目標(biāo)(廣篩),重點(diǎn)在于比較實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組,發(fā)現(xiàn)尋找其種具有明顯的變化的代謝物質(zhì)(差異代謝物),并構(gòu)建代謝通路以解釋代謝物于該生命體的關(guān)聯(lián)。LC-MS非靶向代謝組的優(yōu)勢(shì):1、分析范圍廣,MS幾乎可以檢測(cè)所有的化合物,更加容易地解決了分析熱不穩(wěn)定化合物的難題;2、分離能力強(qiáng),即使被分析混合物在色譜上沒有完全分離開,但通過(guò)MS的特征離子質(zhì)量色譜圖也能分別給出它們各自的色譜圖來(lái)進(jìn)行定性定量。非靶向代謝組學(xué)(Untargeted metabolomics)即非目標(biāo)代謝組學(xué)或發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué)。

選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段的優(yōu)勢(shì)有哪些?1、代謝組學(xué)的研究處于生物信息流的中游,介于基因、蛋白質(zhì)和細(xì)胞、組織之間,在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。2、小分子的產(chǎn)生和代謝是基因表達(dá)的下游產(chǎn)物,生物體液的代謝產(chǎn)物分析能夠更直接,更準(zhǔn)確的反映生物體的病理生理狀態(tài)。3、代謝物的種類少,大約在103個(gè)數(shù)量級(jí),要遠(yuǎn)小于基因和蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù),物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)要簡(jiǎn)單得多,分析起來(lái)更簡(jiǎn)單明了。4、代謝組學(xué)的代謝物信息庫(kù)簡(jiǎn)單,它遠(yuǎn)沒有全基因組測(cè)序及大量表達(dá)序列標(biāo)簽的數(shù)據(jù)庫(kù)那么復(fù)雜。5、基因和蛋白質(zhì)表達(dá)的有效微小變化會(huì)在代謝物上得到放大,從而使檢測(cè)更容易。6、代謝產(chǎn)物在各個(gè)生物體系中都是類似的,所以代謝組學(xué)研究中采用的技術(shù)更容易在各個(gè)領(lǐng)域中通用,也更容易被人接受。代謝組學(xué)研究對(duì)象大是相對(duì)分子質(zhì)量1000以內(nèi)的小分子物質(zhì)。南京常規(guī)靶向代謝組學(xué)研究?jī)?nèi)容

代謝組學(xué)在食品安全領(lǐng)域,利用代謝組學(xué)工具發(fā)現(xiàn)農(nóng)獸藥等在動(dòng)植物體內(nèi)的相關(guān)生物標(biāo)志物也是一個(gè)熱點(diǎn)領(lǐng)域。貴陽(yáng)代謝組學(xué)分析

代謝組學(xué)究竟是一門什么樣的研究方向?首先定義什么是代謝組學(xué)。簡(jiǎn)單的說(shuō)就是研究生物體對(duì)內(nèi)外刺激的整體代謝應(yīng)答規(guī)律。那么為什么代謝組學(xué)是基因組,轉(zhuǎn)錄組,蛋白質(zhì)組的下游。我們研究它到底有什么意義。中心法則告訴我們了遺傳信息的流向,的執(zhí)行者蛋白質(zhì)中很多酶參與了體內(nèi)的代謝過(guò)程。基因測(cè)序數(shù)量太大,而且基因水平解釋問(wèn)題往往很吃力。因?yàn)榛虻恼{(diào)控和生物學(xué)事件之間隔了一個(gè)很漫長(zhǎng)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程。蛋白同理,一是蛋白種類巨大,二是蛋白組學(xué)發(fā)展進(jìn)入瓶頸;發(fā)展代謝組是因?yàn)榇x物種類只有不到1w種,建立它的差異分析更加簡(jiǎn)單,同時(shí)在價(jià)格等方面更有推廣的意義。貴陽(yáng)代謝組學(xué)分析