轉錄組學:轉錄組學是研究特定的細胞、組織或個體在特定時間和狀態(tài)下所轉錄出所有RNA的學科,轉錄組測序是指利用高通量測序方法,研究特定的細胞、組織或個體在特定時間和狀態(tài)下所轉錄出的所有mRNA,用于揭示不同功能狀態(tài)下的基因表達、結構的差異,闡明分子機制。應用領域:醫(yī)學研究:疾病標志物篩查、疾病的診斷和分型、疾病復發(fā)診斷、病因與病理機制探究、臨床療效評價、藥物毒理學評價。生命科學研究:非生物環(huán)境關系研究、植物與微生物、在表型鑒定中的應用、代謝途徑及功能基因組研究、藥用植物研究中的應用。轉錄組學包括:mRNA、ncRNA、rRNA等。廣州circ RNA轉錄組學服務
全長轉錄組測序的優(yōu)勢:1、全方面鑒定可變剪切;2、發(fā)現(xiàn)更多新基因;3、有效改善基因組注釋;4、鑒定更多的LncRNA;5、準確定位融合基因。研究思路:由于全長轉錄組測序是基于第三代測序技術,因而其成本依然較高,如果全部研究項目均基于全長轉錄組,通常來說很難承擔,因此,全長轉錄組測序一般與普通轉錄組測序相結合。宏轉錄組學是什么?宏轉錄組學也稱為環(huán)境轉錄組學,指從整體水平上研究某一特定環(huán)境、特定時期菌群群體全部基因轉錄情況以及轉錄調控規(guī)律,以揭示微生物在不同環(huán)境壓力下的適應機制,探索環(huán)境與微生物之間的相互作用機理。武漢宏轉錄學組分析研究circRNA主要存在于細胞質或外泌體中,具有組織特異性、疾病特異性、時序特異性及高穩(wěn)定性等特征。
轉錄組是特定發(fā)育階段或生理條件下細胞內的完整轉錄信息的匯合,表示了基因表達的中間狀態(tài)。轉錄組測序可以對所有轉錄物進行分類、確定基因的轉錄結構、量化轉錄物的表達水平。蛋白質是生命功能的直接執(zhí)行者,蛋白組是一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質。整合轉錄組學和蛋白質組學的表達數(shù)據(jù)對生物樣本進行研究,可以從整體上解釋生物學問題,探究生物體生理和疾病機理等。轉錄組學應用于胃腸瘤發(fā)生機制研究:利用轉錄組學可檢測瘤細胞惡化過程中的RNA(編碼RNA及非編碼RNA)的變化,有助于更好地理解胃腸瘤的發(fā)生機制。
circRNA轉錄組學生物學功能:circRNA主要存在于細胞質或外泌體中,具有組織特異性、疾病特異性、時序特異性及高穩(wěn)定性等特征。近幾年,大量的研究表明circRNA在生物的生長發(fā)育、脅迫應答、疾病發(fā)生和發(fā)展等方面密切相關,并預測其在疾病診斷標記物等方面的應用前景,但其生物學功能在很大程度上仍然未知。目前認可度比較高的circRNA生物學功能。circRNA轉錄組學成環(huán)機制:circRNA環(huán)化方式分為內含子環(huán)化和外顯子環(huán)化。目前主流的成環(huán)機制可歸類為:依賴于剪切體的索尾插接環(huán)化。在mRNA前體上,通過連續(xù)的組裝小核核糖體蛋白從而催化外顯子下游的5′ 供體的位點連接到上游的3′ 受體的位點,索尾插接形成環(huán)化,然后通過剪切形成circRNA。順式作用元件促進circRNA形成。轉錄組是干什么用的,和表達譜有什么區(qū)別?
轉錄組學:隨著越來越多的基因組序列相繼被測定,生命科學的研究進入了后基因組時代,各類組學技術得到迅速地發(fā)展與普遍地應用包括以基因為研究對象的基因組學(Genomics)、以轉錄過程為研究對象的轉錄組學(Transcriptomics)。意義:1.轉錄組譜可以提供特定條件下某些基因表達的信息,并據(jù)此推斷相應未知基因的功能,揭示特定調節(jié)基因的作用機制.2.通過基于基因表達譜的分子標簽,不只可以辨別細胞的表型歸屬,還可以用于疾病的診斷.3.轉錄組的研究應用于臨床的另一個例子是可以將表面上看似相同的病癥分為多個亞型,尤其是對原發(fā)性惡性瘤,通過轉錄組差異表達譜的建立,可以詳細描繪出患者的生存期以及對藥物的反應等。轉錄組學可應用于炎癥發(fā)生機制的發(fā)現(xiàn)及干預。廣州circ RNA轉錄組學服務
轉錄組學測序必須做生物學重復么?廣州circ RNA轉錄組學服務
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