蛋白質(zhì)組學(xué)的分析介紹:蛋白質(zhì)組學(xué)的分析主要指蛋白的生信分析,依賴于數(shù)據(jù)庫(kù)的建立?,F(xiàn)在常用的蛋白質(zhì)組學(xué)生信分析有GO功能分析和KEGG通路分析。GO(gene ontology)是基因本體聯(lián)合會(huì)(Gene Onotology Consortium)所建立的數(shù)據(jù)庫(kù)。根據(jù)基因產(chǎn)物的相關(guān)分子功能、生物學(xué)途徑、細(xì)胞組分而給予定義,無(wú)物種相關(guān)性。是系統(tǒng)分析基因功能,它將基因組的信息與基因功能聯(lián)系起來(lái),旨在揭示生命現(xiàn)象的遺傳與化學(xué)藍(lán)圖。旨在借助計(jì)算機(jī)全方面地展示細(xì)胞和生物所包含的生物學(xué)信息;根據(jù)基因組中的信息,用計(jì)算機(jī)計(jì)算或者預(yù)測(cè)出比較復(fù)雜的細(xì)胞中的通路或者生物的復(fù)雜行為。樣本測(cè)到的蛋白種類跟數(shù)據(jù)庫(kù)和樣本本身蛋白濃度有關(guān),一般數(shù)據(jù)庫(kù)越大,可以鑒定到的蛋白質(zhì)數(shù)量越多。貴州常規(guī)蛋白質(zhì)組學(xué)研究
蛋白質(zhì)組學(xué)在農(nóng)業(yè)生物科研領(lǐng)域的應(yīng)用:蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在農(nóng)業(yè)生物科研領(lǐng)域的應(yīng)用為作物生長(zhǎng)發(fā)育、病蟲(chóng)害防治、遺傳育種、畜牧獸醫(yī)學(xué)疾病診斷等方面發(fā)揮重要的作用,為現(xiàn)代農(nóng)業(yè)發(fā)展開(kāi)辟新途徑。蛋白質(zhì)組學(xué)在農(nóng)作物研究中的應(yīng)用:農(nóng)業(yè)是我國(guó)人口賴以生存的基礎(chǔ),而提高糧食產(chǎn)量和品質(zhì)則是農(nóng)業(yè)發(fā)展的關(guān)鍵。蛋白質(zhì)組學(xué)關(guān)鍵技術(shù)在作物遺傳育種、品系鑒定、品質(zhì)改良、逆境脅迫應(yīng)答等關(guān)鍵環(huán)節(jié)的應(yīng)用,為農(nóng)業(yè)作物的進(jìn)一步開(kāi)發(fā)利用提供巨大的參考價(jià)值。蛋白質(zhì)組學(xué)可系統(tǒng)研究農(nóng)作物在特定環(huán)境或某個(gè)發(fā)育階段的組織中蛋白質(zhì)的表達(dá)變化,有助于作物發(fā)育過(guò)程機(jī)制的理解。貴州常規(guī)蛋白質(zhì)組學(xué)研究蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的本質(zhì)(從分析化學(xué)角度來(lái)看),就是對(duì)蛋白質(zhì)的定性定量分析。
蛋白質(zhì)組學(xué)我的介紹:蛋白質(zhì)組學(xué)(proteomics)采用高通量和大規(guī)模的研究手段,從整體的角度分析細(xì)胞內(nèi)動(dòng)態(tài)變化的蛋白質(zhì)組成成份、表達(dá)水平與修飾狀態(tài),了解蛋白質(zhì)之間的相互作用與聯(lián)系,揭示蛋白質(zhì)功能與細(xì)胞生命活動(dòng)規(guī)律,之后達(dá)到構(gòu)建出細(xì)胞的“功能圖”的目的。蛋白質(zhì)作為生命活動(dòng)的物質(zhì)承擔(dān)者、生理功能的執(zhí)行者和生命現(xiàn)象的直接體現(xiàn)者,研究蛋白質(zhì)對(duì)闡明生命體的變化機(jī)制具有重要作用。蛋白質(zhì)組研究不只可以實(shí)現(xiàn)與基因組的關(guān)聯(lián),揭示生命活動(dòng)的發(fā)生規(guī)律。同樣對(duì)人類重大疾病的發(fā)生與發(fā)展的病理機(jī)制研究也具有重要作用。生命體的生理、病理過(guò)程,藥物和環(huán)境因子的作用都依賴于蛋白質(zhì),并引起蛋白質(zhì)的變化。蛋白質(zhì)組學(xué)研究對(duì)提高我國(guó)生物醫(yī)學(xué)原始創(chuàng)新能力、重大疾病防診治能力和國(guó)民健康水平以及新藥研發(fā)能力、生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)的發(fā)展具有重大的戰(zhàn)略意義。
我國(guó)科學(xué)家已經(jīng)在重大疾病如肝病、維甲酸誘導(dǎo)白血病細(xì)胞凋亡啟動(dòng)模型及維甲酸定向誘導(dǎo)胚胎干細(xì)胞向神經(jīng)系統(tǒng)分化的模型等比較蛋白質(zhì)組研究以及一些重要生理和病理體系的蛋白質(zhì)組成分研究方面獲得了重要成就。蛋白質(zhì)組學(xué)的重要應(yīng)用領(lǐng)域有:在臨床疾病中的應(yīng)用、在微生物蛋白質(zhì)組學(xué)中的應(yīng)用、在植物研究中的應(yīng)用、在腎臟病學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用。我們通過(guò)研究蛋白質(zhì)組,可以為患者提供有用的疾病診斷、診療、預(yù)后評(píng)估信息;可以早期更為準(zhǔn)確的診斷出胰腺??;也可以為AD的診斷、診療藥物的設(shè)計(jì)和篩選奠定基礎(chǔ)。這項(xiàng)研究技術(shù)其實(shí)離我們生活非常近,對(duì)我們生命而言尤為重要。近年來(lái),高通量蛋白質(zhì)分離與鑒定技術(shù),如雙向電泳、生物質(zhì)譜、蛋白質(zhì)芯片、酵母雙雜交系統(tǒng)、生物信息學(xué)等相繼建立并日趨完善,加速了蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展。蛋白質(zhì)組與基因組相對(duì)應(yīng),也是一個(gè)整體的概念。
什么樣本能做蛋白組學(xué)檢測(cè)?大概可以測(cè)到多少的蛋白種類?原則上只要能提取到蛋白,就可以做蛋白組檢測(cè)。樣本測(cè)到的蛋白種類跟數(shù)據(jù)庫(kù)和樣本本身蛋白濃度有關(guān),一般數(shù)據(jù)庫(kù)越大,可以鑒定到的蛋白質(zhì)數(shù)量越多。也與樣本的類型有關(guān),通常,組織細(xì)胞相比于體液樣本,能夠鑒定到更多的蛋白。蛋白組學(xué)樣本寄送前是否需要精確計(jì)數(shù)或是稱量?不同樣本寄送會(huì)有不同的送樣要求,按照收集方法提供可以保證實(shí)驗(yàn)用量充足。不需要精確計(jì)數(shù)或是稱量,項(xiàng)目開(kāi)展前會(huì)進(jìn)行蛋白濃度的測(cè)定,后續(xù)也是不同樣本等蛋白量處理、上機(jī)檢測(cè),但是要保證每個(gè)樣本的寄樣量達(dá)到實(shí)驗(yàn)要求。Label Free 非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)處理步驟簡(jiǎn)單,成本低。上海修飾蛋白組學(xué)價(jià)錢
蛋白質(zhì)組的研究能為生命活動(dòng)規(guī)律提供物質(zhì)基礎(chǔ)。貴州常規(guī)蛋白質(zhì)組學(xué)研究
蛋白質(zhì)組學(xué)研究應(yīng)用:近年來(lái)蛋白質(zhì)組研究技術(shù)已被應(yīng)用到各種生命科學(xué)領(lǐng)域,覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動(dòng)物等范圍,涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象,如信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞分化、蛋白質(zhì)折疊等。生物信息學(xué)的發(fā)展已給蛋白質(zhì)組研究提供了更方便、有效的計(jì)算機(jī)分析軟件,隨著基因組學(xué)的迅速推進(jìn),會(huì)給蛋白質(zhì)組研究提供更多更全的數(shù)據(jù)庫(kù)。另外,蛋白質(zhì)組學(xué)與其它學(xué)科的交叉也將推動(dòng)新技術(shù)、新方法的發(fā)展。特別是蛋白質(zhì)組學(xué)與其它大規(guī)??茖W(xué)如基因組學(xué),生物信息學(xué)領(lǐng)域的交叉,所呈現(xiàn)出的系統(tǒng)生物學(xué)研究模式,將成為未來(lái)的生命科學(xué)新前沿。貴州常規(guī)蛋白質(zhì)組學(xué)研究