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什么是非靶向代謝組學(xué)、靶向代謝組學(xué)?(1) 非靶向代謝組學(xué)(Untargeted metabolomics)即非目標(biāo)代謝組學(xué)或發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué),無(wú)偏向性地對(duì)所有小分子代謝物(一般相對(duì)分子量小于1000)同時(shí)進(jìn)行檢測(cè)分析的代謝組學(xué)。(2) 靶向代謝組學(xué)(Trgeted metabolomics)則為目標(biāo)性代謝組學(xué),著重對(duì)于設(shè)定好的目標(biāo)代謝物進(jìn)行定性、量檢測(cè)分析和研究。相比于其他組學(xué),代謝組學(xué)有哪些特殊的優(yōu)勢(shì)?系統(tǒng)生物學(xué)有基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)。代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的一個(gè)重要的分支,與其他組學(xué)相比有著其特有的優(yōu)勢(shì),主要體現(xiàn)在以下幾點(diǎn):(1) 基因與蛋白質(zhì)表達(dá)的微小變化會(huì)在相應(yīng)代謝物水平上得到放大,更容易被檢測(cè)。(2) 代謝物的種類(lèi)要遠(yuǎn)小于基因和蛋白的數(shù)目。(3) 可與生物表型變化建立直接相關(guān)性。代謝組學(xué)主要研究的是產(chǎn)物的小分子代謝物(MW<1000)。河南植物靶向代謝組學(xué)分析鑒定
代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用:與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,是要涉及研究每一個(gè)代謝組分的共性、特性和規(guī)律,目前據(jù)此目標(biāo)相距甚遠(yuǎn)。盡管充滿了挑戰(zhàn),研究人員仍然堅(jiān)信,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密。疾病導(dǎo)致機(jī)體病理生理過(guò)程變化,引起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應(yīng)的改變,通過(guò)對(duì)某些代謝產(chǎn)物進(jìn)行分析,并與正常人的代謝產(chǎn)物比較,尋找疾病的生物標(biāo)記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。廣州LC-MS/MS非靶向代謝組學(xué)費(fèi)用代謝組學(xué)是一個(gè)相當(dāng)有效率的研究工具。
代謝組學(xué)概念:代謝組學(xué)(metabonomics/metabolomics)是效仿基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究思想,對(duì)生物體內(nèi)所有代謝物進(jìn)行定量分析,并尋找代謝物與生理病理變化的相對(duì)關(guān)系的研究方式,是系統(tǒng)生物學(xué)的組成部分。其研究對(duì)象大都是相對(duì)分子質(zhì)量1000以?xún)?nèi)的小分子物質(zhì)。先進(jìn)分析檢測(cè)技術(shù)結(jié)合模式識(shí)別和專(zhuān)家系統(tǒng)等計(jì)算分析方法是代謝組學(xué)研究的基本方法。 代謝組學(xué)是繼基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)之后新近發(fā)展起來(lái)的一門(mén)學(xué)科,是系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分?;蚪M學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分別從基因和蛋白質(zhì)層面探尋生命的活動(dòng),而實(shí)際上細(xì)胞內(nèi)許多生命活動(dòng)是發(fā)生在代謝物層面的,如細(xì)胞信號(hào)釋放(cell signaling),能量傳遞,細(xì)胞間通信等都是受代謝物調(diào)控的。代謝組學(xué)正是研究代謝組(metabolome)——在某一時(shí)刻細(xì)胞內(nèi)所有代謝物的組合——的一門(mén)學(xué)科。
代謝組學(xué)(英語(yǔ):metabolomics)是對(duì)細(xì)胞,生物流體,組織或生物體內(nèi)的小分子(通常稱(chēng)為代謝物,metabolites)的大規(guī)模研究。 這些小分子及其在生物系統(tǒng)中的相互作用統(tǒng)稱(chēng)為代謝組。能夠?qū)ι飿颖局械拇x物進(jìn)行全方面分析的一項(xiàng)新興技術(shù),被定義為代謝組學(xué)技術(shù)。代謝組學(xué)是在后基因組學(xué)時(shí)代興起的一門(mén)跨領(lǐng)域?qū)W科,其主要目標(biāo)是定量的研究生命體對(duì)外界刺激、病理生理變化、以及本身基因突變而產(chǎn)生的其體內(nèi)代謝物水平的多元?jiǎng)討B(tài)反應(yīng)。之后得到迅速發(fā)展并滲透到多項(xiàng)領(lǐng)域,比如疾病診斷、醫(yī)藥研制開(kāi)發(fā)、營(yíng)養(yǎng)食品科學(xué)、毒理學(xué)、環(huán)境學(xué),植物學(xué)等與人類(lèi)健康護(hù)理密切相關(guān)的領(lǐng)域。靶向代謝組學(xué)(Trgeted metabolomics)則為目標(biāo)性代謝組學(xué)。
非靶向代謝組學(xué):新陳代謝網(wǎng)絡(luò)是復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò),特別是人體的代謝網(wǎng)絡(luò),一直被認(rèn)為是相對(duì)復(fù)雜的代謝網(wǎng)絡(luò)?,F(xiàn)在多數(shù)信號(hào)通路的研究是集中在代謝網(wǎng)絡(luò)的一個(gè)很小的領(lǐng)域?;蚪M學(xué)、蛋白組學(xué)研究已經(jīng)揭示了部分調(diào)節(jié)通路,但是和代謝網(wǎng)絡(luò)直接相關(guān)的是代謝產(chǎn)物。從多種代謝產(chǎn)物中選取研究對(duì)象,無(wú)疑是困難的。非靶向代謝組學(xué)又稱(chēng)為發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué),主要是將對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組的代謝組(某一生物體的全部代謝物)進(jìn)行比對(duì),以找出其代謝物的差異。代謝組學(xué)研究通過(guò)一定的手段能夠幫助研究員從代謝產(chǎn)物海中跳出來(lái),提供一個(gè)“航拍”的視角,從而發(fā)現(xiàn)差異性代謝產(chǎn)物。然后通過(guò)已知的代謝通路逆推找出調(diào)節(jié)酶和基因,完成疾病發(fā)病機(jī)制、藥物療理機(jī)制等方面的研究。代謝組學(xué)是研究關(guān)于生物體被擾動(dòng)后其代謝產(chǎn)物種類(lèi)、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學(xué)。南京GC-MS非靶向代謝組學(xué)技術(shù)服務(wù)
與其他“組學(xué)”研究相比,代謝組學(xué)的費(fèi)用更低。河南植物靶向代謝組學(xué)分析鑒定
代謝組學(xué)樣本收集植物組織:葉片、莖、花:1)取整片葉片/一段莖/一朵花,放入離心管或錫箔紙中并標(biāo)記,迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2)將裝有樣本的離心管迅速放入自封袋中(每組一袋),在自封袋中放入標(biāo)簽紙注明樣本信息。3)迅速放入-80 ℃冰箱凍存。足量干冰寄送。注意:(1)采集葉片樣本時(shí),在中午光照好的時(shí)間收集。(2)采集樣本時(shí)保持樣本一致性,尤其是同一組樣本(顏色、衰老程度、葉脈占比、光照、位置等)。根:1)取整株植物的根部,迅速用PBS緩沖液或者超純水漂洗掉根上的泥土、培養(yǎng)基或營(yíng)養(yǎng)液等;2)吸水紙吸干水分后,分裝為500 mg/管;3)標(biāo)號(hào)后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min,-80 ℃凍存,干冰寄送。河南植物靶向代謝組學(xué)分析鑒定