山東磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法

蛋白質(zhì)磷酸化修飾類型：根據(jù)磷酸氨基酸殘基的不同，可將磷酸化蛋白質(zhì)分為4類，即O-磷酸鹽蛋白質(zhì)、N-磷酸鹽蛋白質(zhì)、?；姿猁}蛋白質(zhì)和S-磷酸鹽蛋白質(zhì)。1、O-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過羥氨基酸（如絲氨酸、蘇氨酸或酪氨酸）的磷酸化形成。2、 N-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過精氨酸、賴氨酸或組氨酸的磷酸化形成。3、 酰基磷酸鹽蛋白質(zhì)通過天冬氨酸或谷氨酸的磷酸化形成。4、 S-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過半胱氨酸磷酸化形成。蛋白質(zhì)磷酸化修飾鑒定方法：免疫印跡技術(shù)是在凝膠電泳和固相免疫測定技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來的、根據(jù)特定抗原-抗體的特異性反應(yīng)來檢測復(fù)雜樣品中的某種蛋白質(zhì)的免疫生化分析方法。蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)中磷酸化位點(diǎn)分析時(shí)應(yīng)該注意些什么問題？山東磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法

蛋白翻譯后修飾：蛋白質(zhì)氨基酸序列的特定位置可以與化學(xué)基團(tuán)或者小分子量的蛋白共價(jià)結(jié)合從而發(fā)生蛋白質(zhì)翻譯后修飾（post-translational modifications，PTMs）。翻譯后修飾是蛋白質(zhì)生物合成的一個(gè)步驟，翻譯后多肽鏈在成為成熟的蛋白質(zhì)產(chǎn)品之前要經(jīng)過修飾，PTMs的類型包括磷酸化、乙?；?、糖基化、泛素化和二硫鍵等等，它導(dǎo)致蛋白質(zhì)組復(fù)雜性的大幅增加。對于任何給定的蛋白質(zhì)，各種各樣的PTMs提供了一種通過改變蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能來促進(jìn)細(xì)胞快速變化的方法。PTMs在信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性和周轉(zhuǎn)率、蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)識(shí)別和相互作用以及空間定位中起著至關(guān)重要的作用。江蘇蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)類型蛋白質(zhì)翻譯后修飾可以改變蛋白質(zhì)的物理、化學(xué)性質(zhì)。

翻譯后修飾蛋白組學(xué)分析：蛋白質(zhì)組學(xué)的研究的工作不只聚焦于細(xì)胞不同生長時(shí)期或是疾病條件下的蛋白質(zhì)表達(dá)水平變化，許多至關(guān)重要的生命進(jìn)程不只由蛋白質(zhì)相對豐度控制，更重要的是被時(shí)空特異分布的、可逆的翻譯后修飾所調(diào)控，因而揭示翻譯后修飾發(fā)生規(guī)律是解析蛋白質(zhì)復(fù)雜多樣的生物功能的一個(gè)重要前提。蛋白質(zhì)發(fā)生翻譯后修飾時(shí)其分子質(zhì)量會(huì)發(fā)生響應(yīng)的改變，通過質(zhì)譜能夠精確測定蛋白質(zhì)或多肽的分子質(zhì)量。同時(shí)，發(fā)生翻譯后修飾的蛋白質(zhì)再樣本中含量低且動(dòng)態(tài)范圍廣，所以在質(zhì)譜檢測前需要對發(fā)生修飾的蛋白質(zhì)或肽段進(jìn)行富集。

蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾分析自中而下分析策略：自中而下的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)可用于組蛋白修飾的分析。樣品制備與普遍使用的自下而上的分析策略相同，直到得到純化的組蛋白。提取組蛋白后，用GluC進(jìn)行消化。然后用弱陽離子交換/親水相互作用色譜（WCX-HILIC）與配備電子轉(zhuǎn)移解離（ETD）的高分辨率質(zhì)譜聯(lián)機(jī)聯(lián)用，對樣品進(jìn)行理想的分離。譜識(shí)別可以用傳統(tǒng)的軟件進(jìn)行，但是由于估計(jì)適當(dāng)?shù)腻e(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率的問題，需要對結(jié)果進(jìn)行過濾。自上而下的技術(shù)可以直接引入完整的蛋白質(zhì)并在串聯(lián)質(zhì)譜儀上對其進(jìn)行片段化，不需要蛋白質(zhì)水解消化。目前，有兩種完全分離蛋白質(zhì)的方法：離線和在線。前者用四維分離法，后者用WCX-HILIC。在早期的研究中，乙?；揎椧恢北徽J(rèn)為是真核細(xì)胞所特有的一種翻譯后修飾。

質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾原理：相較于沒有發(fā)生翻譯后修飾的蛋白，翻譯后修飾蛋白會(huì)在特定肽段序列有分子量的增加。在蛋白翻譯后修飾方式的質(zhì)譜分析過程中，蛋白會(huì)首先被酶切成肽段，然后進(jìn)入質(zhì)譜進(jìn)行分析；通過質(zhì)譜分析，得到的是一系列肽段的相對分子質(zhì)量信息。對于某一個(gè)特定的肽段而言，在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下其序列信息和分子量是確定的，當(dāng)它發(fā)生了某種翻譯后修飾之后，例如磷酸化修飾，因?yàn)榱姿岣姆肿恿恳彩谴_定的，所以在質(zhì)譜檢測過程中如果發(fā)現(xiàn)部分肽段的分子量剛好增加了一個(gè)磷酸根的分子量，則可以假設(shè)這個(gè)肽段發(fā)生了磷酸化修飾，再通過二級(jí)或多級(jí)質(zhì)譜的譜圖進(jìn)行二次確認(rèn)即可實(shí)現(xiàn)翻譯后修飾類型鑒定及修飾位點(diǎn)分析等。蛋白質(zhì)乙?；揎椊M學(xué)技術(shù)對細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著重要的作用。湖北蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)分析研究

自中而下的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)可用于組蛋白修飾的分析。山東磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法

蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)：磷酸化蛋白質(zhì)是由蛋白激酶將ATP或GTP分子上的磷酸基團(tuán)轉(zhuǎn)移到底物蛋白特定的氨基酸側(cè)鏈上形成的。蛋白質(zhì)磷酸化是一種可逆的蛋白質(zhì)翻譯后修飾。在哺乳動(dòng)物的細(xì)胞生命周期中，至少有三分之一的蛋白質(zhì)發(fā)生磷酸化修飾。磷酸化修飾參與許多信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑和細(xì)胞代謝過程，且許多已知的疾病也與蛋白質(zhì)的異常磷酸化有關(guān)。因此，對磷酸化蛋白質(zhì)組進(jìn)行定量研究，尋找差異表達(dá)的磷酸化蛋白質(zhì)，有助于發(fā)現(xiàn)疾病的生物標(biāo)志物和尋找新的具有診療潛力的藥物靶標(biāo)。山東磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法