定量蛋白質(zhì)組學技術：定量蛋白質(zhì)組學是蛋白質(zhì)組研究的重要內(nèi)容，通過對基因表達產(chǎn)物——蛋白質(zhì)的定量分析，以了解基因在不同的生理、病理和逆境條件下的表達情況。近年來，隨著非凝膠技術的發(fā)展，蛋白質(zhì)組學（“Shotgun”proteomics）技術，特別是多維蛋白質(zhì)鑒定（MultidimensionalProteinIdentification，MudPIT）已成為研究復雜生物樣本中大規(guī)模蛋白質(zhì)表達和定性和定量分析的強有力工具。蛋白質(zhì)組學在醫(yī)學的研究應用：蛋白質(zhì)組學是研究細胞、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學。蛋白質(zhì)組的概念指由一個基因組，或一個細胞、組織表達的所有蛋白質(zhì)。南京修飾蛋白組學質(zhì)譜分析
蛋白組學技術：質(zhì)譜技術相較于傳統(tǒng)蛋白質(zhì)鑒定技術而言，擁有靈敏、準確、高通量、自動化等特點。質(zhì)譜鑒定蛋白質(zhì)的基本原理是先將樣品分子離子化，然后根據(jù)不同離子之間的質(zhì)荷比差異來分離并確定蛋白質(zhì)的相對分子質(zhì)量。根據(jù)蛋白質(zhì)酶解后所得到的肽質(zhì)量指紋圖譜、肽序列標簽、和肽階梯序列去檢索蛋白質(zhì)或核酸序列數(shù)據(jù)庫，質(zhì)譜技術可達到對蛋白質(zhì)的快速鑒定和高通量篩選。因產(chǎn)生離子的方法不同而發(fā)展起來的質(zhì)譜包括基質(zhì)輔助激光解吸離子化質(zhì)譜、電噴霧離子化質(zhì)譜、表面增強激光解吸離子化質(zhì)譜等。湖北定量蛋白組學質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)組學技術有生物質(zhì)譜。
蛋白組學研究怎么做？PRM:平行反應監(jiān)測(ParallelReactionMonitoring)是一種基于高分辨、高精度質(zhì)譜的離子監(jiān)視技術，能夠?qū)δ繕说鞍踪|(zhì)、目標肽段（如發(fā)生翻譯后修飾的肽段）進行選擇性檢測，從而實現(xiàn)對目標蛋白質(zhì)/肽段進行一定定量，因此也被稱之為基于液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術的WesternBlot（LC-MSMSbasedWesternBlot,L-WB）。PRM技術基于Q-Orbitrap為表示的高分辨、高精度質(zhì)譜平臺，首先利用四級桿質(zhì)量分析器的選擇能力，用Q1選擇目標肽段的母離子，隨后在Collisioncell中對母離子進行碎裂，之后利用Orbitrap分析器在二級質(zhì)譜中檢測所選擇的母離子窗口內(nèi)的所有碎片信息。這樣即可對復雜樣本中的目標蛋白質(zhì)/肽段進行準確地特異性分析。
蛋白質(zhì)組學研究這樣做：蛋白質(zhì)組與基因組相對應，也是一個整體的概念，隨著基因組學研究的不斷深入，蛋白質(zhì)組學已逐漸成為研究熱點，對蛋白組學的研究可以使我們更容易接近生命的機理本質(zhì)，但探究成千上萬的蛋白質(zhì)特性也是一個重大的技術挑戰(zhàn)。蛋白質(zhì)組（Proteome）指的是某一時刻或某一狀態(tài)基因組表達的所有相應的蛋白，即細胞、組織或機體全部蛋白質(zhì)的存在及活動形式，其是一個動態(tài)概念，它是在組織、細胞的整體蛋白質(zhì)水平上，探索蛋白質(zhì)作用模式、功能機理、調(diào)節(jié)控制以及蛋白質(zhì)群體內(nèi)的相互關系、從而獲得生命活動調(diào)控網(wǎng)絡的全方面而深入的認識，以揭示生命活動的基本規(guī)律。定量蛋白質(zhì)組學通過對蛋白質(zhì)的定量分析，以了解基因在不同的生理、病理和逆境條件下的表達情況。
蛋白組學樣本寄送前是否需要精確計數(shù)或是稱量？不同樣本寄送會有不同的送樣要求，按照收集方法提供可以保證實驗用量充足。不需要精確計數(shù)或是稱量，項目開展前會進行蛋白濃度的測定，后續(xù)也是不同樣本等蛋白量處理、上機檢測，但是要保證每個樣本的寄樣量達到實驗要求。常規(guī)定量蛋白組實驗的主要步驟有哪些，數(shù)據(jù)分析內(nèi)容包含哪些？實驗步驟：首先獲得生物學樣本，然后進行蛋白提取，定量，SDS-PAGE跑膠質(zhì)控，還原烷基化，酶解，獲得肽段，（標記+分組分），上機檢測，搜庫軟件搜庫，數(shù)據(jù)分析；數(shù)據(jù)分析：主要分為基礎數(shù)據(jù)分析、?級數(shù)據(jù)分析和個性化數(shù)據(jù)分析三個部分?；A分析主要包括差異表達蛋白篩選、層次聚類分析分析、COG注釋分析、亞細胞定位分析、GO注釋富集分析、KEGG注釋分析、PPI分析等。蛋白質(zhì)組研究技術在研究對象上，覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍。南京常規(guī)蛋白質(zhì)組學項目
蛋白質(zhì)組可以隨著組織、甚至環(huán)境狀態(tài)的不同而改變。南京修飾蛋白組學質(zhì)譜分析
定量蛋白質(zhì)組學分析（QuantitativeProteomics）是對一個基因組表達的全部蛋白質(zhì)或一個復雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進行精確鑒定和定量?？捎糜诤Y選和尋找任何因素引起的樣本之間的差異表達蛋白，結合生物信息學揭示細胞生理病理等功能，同時也可對某些關鍵蛋白進行定性和定量分析。目前定量蛋白質(zhì)組學技術常見標記（Label）和非標記的（LabelFree）定量策略。定量蛋白質(zhì)組學技術常見的幾類主要包括：LabelFree定量蛋白組分析、SILAC與免疫共沉淀蛋白互作分析、MRM/PRM定量蛋白組學分析、SILAC/Dimethyl標記定量蛋白組分析、SWATH定量蛋白組學、TMT/iTRAQ/multinotch定量蛋白組學分析。南京修飾蛋白組學質(zhì)譜分析
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