河南動物靶向代謝組學技術(shù)

代謝組學概念：代謝組學主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物（MW<1000）。 在食品安全領(lǐng)域，利用代謝組學工具發(fā)現(xiàn)農(nóng)獸藥等在動植物體內(nèi)的相關(guān)生物標志物也是一個熱點領(lǐng)域。其樣品主要是動植物的細胞和組織的提取液。主要技術(shù)手段是核磁共振（NMR），質(zhì)譜（MS），色譜（HPLC，GC），其中以NMR為主。通過檢測一系列樣品的NMR 譜圖，再結(jié)合模式識別方法，可以判斷出生物體的病理生理狀態(tài)，并有可能找出與之相關(guān)的生物標志物（biomarker）。代謝組學主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物（分子量<1000）。河南動物靶向代謝組學技術(shù)

選擇代謝組學作為科研技術(shù)手段的優(yōu)勢有哪些？代謝組學的研究處于生物信息流的中游，介于基因、蛋白質(zhì)和細胞、組織之間，在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。小分子的產(chǎn)生和代謝是基因表達的下游產(chǎn)物，生物體液的代謝產(chǎn)物分析能夠更直接，更準確的反映生物體的病理生理狀態(tài)。代謝物的種類少，大約在103個數(shù)量級，要遠小于基因和蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù)，物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)要簡單得多，分析起來更簡單明了。代謝組學的代謝物信息庫簡單，它遠沒有全基因組測序及大量表達序列標簽的數(shù)據(jù)庫那么復雜。基因和蛋白質(zhì)表達的有效微小變化會在代謝物上得到放大，從而使檢測更容易。代謝產(chǎn)物在各個生物體系中都是類似的，所以代謝組學研究中采用的技術(shù)更容易在各個領(lǐng)域中通用，也更容易被人接受。河南GC-MS非靶向代謝組學定量分析代謝組學作為系統(tǒng)生物學的重要組成部分，在臨床醫(yī)學領(lǐng)域具有普遍的應(yīng)用前景。

代謝組學的研究分為靶向和非靶向。通俗說就是你有沒有目標分子。傳統(tǒng)代謝組學研究利用的是GC-MS，因為代謝物大多數(shù)都不是高沸點的，而且GC-MS有龐大的數(shù)據(jù)庫檢索。然后發(fā)展的LC-MS差不多，就是克服了一些高沸點物質(zhì)難以檢測的弊端。NMR用于代謝組學不是很多，一方面是NMR這個東西入行起點有點高，另一方面是樣品太復雜而且靈敏度不高。但是NMR樣品處理簡單，無損。不需要各種衍生化。而且NMR對于物質(zhì)結(jié)構(gòu)的指認要比MS更精確（比如異構(gòu)體）因此對定性非常有用，成為非靶向代謝組學的重要方法。

GC-MS非靶向代謝組學能檢測到哪些類別的代謝物？衍生化極大地拓展了GC/MS的檢測分析范圍。GC/MS能檢測到有機酸、氨基酸、單糖、糖醇、胺類、脂肪酸、吲哚、單甘油酯、核苷、二糖、生育酚、甾醇和膽汁酸等代謝物。如何提高定性準確度？GC/MS的定性有雙重標準，一是保留指數(shù)，二是質(zhì)譜信息的相似度（similarity）。不同于LC/MS的軟電離源，GC/MS使用的EI源屬于硬電離，能量較強且穩(wěn)定，在將代謝物分子電離后，分子離子峰進一步碎裂產(chǎn)生豐富的碎片離子。因此，我們很難在GC/MS上看到分子離子峰。GC/MS提供的是代謝物的“指紋圖譜”，將儀器得到的實際指紋圖譜和質(zhì)譜庫（如NIST庫）進行比對后，我們將會得到一個叫相似度的指標。保留指數(shù)和相似度都必須滿足設(shè)定的閾值，軟件才會給出色譜峰的定性結(jié)果。然后采用標準品質(zhì)譜信息進行完全比對定性，也就是說只有經(jīng)過標準品比對，代謝物才是被100%定性。代謝組學是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規(guī)律。

代謝組學可以檢測的樣品種類有哪些？代謝組學主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物（分子量<1000）。其樣品主要是血漿或血清，尿液，唾液，以及細胞和組織的提取液。我們也和一些公司或單位（如茶葉公司、制酒公司、酸奶公司、醫(yī)院等）合作，做過植物，微生物提取物，腦脊液，昆蟲血淋巴，羊水，卵泡液，膝蓋滑液，眼淚，胎盤，糞便及腸道內(nèi)容物提取液等。一般代謝組學能檢測出多少物質(zhì)？同的質(zhì)譜平臺靈敏度及偏向性都不一樣，而且不同平臺之間具有互補性。一般來說GC/MS檢測血清樣品能準確定性的物質(zhì)約200個左右，檢測尿液樣品定性的物質(zhì)約200個左右，其他樣品（如肝臟，糞便，腸道內(nèi)容物）也在幾百這個數(shù)量級。如果采用全二維GC/MS，物質(zhì)的數(shù)量要更多，可達1千以上。LC/MS檢測物質(zhì)的數(shù)量要遠比GC/MS多，但能準確定性和定量的不多，視不同的平臺(TQ、QTOF等)能達到幾十至2-3百個物質(zhì)。非靶向代謝組學無偏向性地對所有小分子代謝物（一般相對分子量小于1000）。哈爾濱LC-MS／MS非靶向脂質(zhì)組學分析價格

代謝組學作為系統(tǒng)生物學的一個重要的分支，與其他組學相比有著其特有的優(yōu)勢。河南動物靶向代謝組學技術(shù)

代謝組學樣本收集植物組織：葉片、莖、花：1）取整片葉片/一段莖/一朵花，放入離心管或錫箔紙中并標記，迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2）將裝有樣本的離心管迅速放入自封袋中（每組一袋），在自封袋中放入標簽紙注明樣本信息。3）迅速放入-80 ℃冰箱凍存。足量干冰寄送。注意：（1）采集葉片樣本時，在中午光照好的時間收集。（2）采集樣本時保持樣本一致性，尤其是同一組樣本（顏色、衰老程度、葉脈占比、光照、位置等）。根：1）取整株植物的根部，迅速用PBS緩沖液或者超純水漂洗掉根上的泥土、培養(yǎng)基或營養(yǎng)液等；2）吸水紙吸干水分后，分裝為500 mg/管；3）標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min，-80 ℃凍存，干冰寄送。河南動物靶向代謝組學技術(shù)

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