廣州棕櫚?；揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)分析研究

蛋白質(zhì)磷酸化修飾定義？在哺乳動物細(xì)胞生命周期中，大約有1/3的蛋白質(zhì)發(fā)生過磷酸化修飾，在脊椎動物基因中，約有5%的基因編碼的蛋白質(zhì)是參與磷酸化和去磷酸化過程的蛋白激酶和磷酸酶。它可以通過激發(fā)、調(diào)節(jié)諸多信號通路進而參與調(diào)控生物體的生長、發(fā)育、逆境應(yīng)激、疾病發(fā)生等多種生命過程，一直是生物學(xué)研究的重點與熱點。蛋白磷酸化是指在激酶催化作用下把ATP或者GTP的磷酸基團（P04）轉(zhuǎn)移到不同種類的氨基酸上（主要包括絲氨酸S、蘇氨酸T、酪氨酸Y），從而使蛋白質(zhì)發(fā)生翻譯后修飾的過程。蛋白質(zhì)糖基化指碳水化合物通過共翻譯或翻譯后修飾的方式附著到蛋白質(zhì)上的過程。廣州棕櫚?；揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)分析研究

蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾自下而上分析策略：常用的糖蛋白分離和富集技術(shù)有：a. 凝集素親和技術(shù)；b. 肼化學(xué)富集；c. 親水性相互作用色譜法；d. β-消除/邁克爾加成反應(yīng)。基于質(zhì)譜的糖蛋白鑒定和糖基化位點測定方法有：a. PNGase F酶法；b. Endo H酶法；c. 三氟甲烷磺酸(TFMS)法。泛素化：泛素是一種由76個氨基酸組成的多肽，在真核生物中高度保守，可通過異肽鍵與目標(biāo)蛋白賴氨酸殘基的氨基進行共價連接。泛素化蛋白的富集主要基于標(biāo)記，泛素用親和標(biāo)簽（通常為6xHis）進行標(biāo)記，并通過鎳螯合色譜親和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端為Arg-Gly-Gly結(jié)構(gòu)，經(jīng)胰蛋白酶水解后，Gly-Gly保留在修飾蛋白的肽鏈上，使肽的質(zhì)量增加114，因此可作為泛素定位位點的質(zhì)量標(biāo)記。用HPLC對樣品進行預(yù)分離，使用針對特定殘留結(jié)構(gòu)的抗體富集泛素化肽，可很大程度上提高泛素化蛋白的濃度。串聯(lián)質(zhì)譜可以鑒定泛素化位點。河南乙?；揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)乙?；揎検求w內(nèi)高度保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾。

翻譯后修飾蛋白組：翻譯后修飾蛋白組分析是指在組學(xué)水平上對存在翻譯后修飾的蛋白質(zhì)進行分析。翻譯后修飾蛋白組是指細(xì)胞或組織等整體水平上的翻譯后修飾蛋白。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾（Post Translational Modifications, PTMs）是蛋白質(zhì)在翻譯中或翻譯后經(jīng)歷的一個共價加工過程。蛋白翻譯后修飾通過在一個或多個氨基酸殘基上加修飾基團或通過蛋白質(zhì)水解去基團而改變蛋白質(zhì)的性質(zhì)，調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的功能。經(jīng)過翻譯后修飾的蛋白質(zhì)稱為翻譯后修飾蛋白。目前，已知的蛋白質(zhì)翻譯后修飾主要包括糖基化、磷酸化、乙?；?、泛素化、二硫鍵配對、甲基化和亞硝基化等等。

蛋白質(zhì)乙?；揎椀墓δ埽耗壳皩σ阴；揎椀墓δ苎芯恐饕性趯?xì)胞轉(zhuǎn)錄調(diào)控，以及對代謝通路的調(diào)控這兩個方面。在眾多乙酰化修飾的蛋白質(zhì)中，研究較多的要數(shù)細(xì)胞核中包圍DNA的組蛋白了。組蛋白和DNA纏繞構(gòu)成核小體，組蛋白的甲基化、乙?；揎椖軌蛘{(diào)節(jié)DNA纏繞的松緊度，從而對基因表達進行調(diào)控，因此，組蛋白的翻譯后修飾是表觀遺傳學(xué)研究中的重要一環(huán)。另外，研究也發(fā)現(xiàn)乙?；揎椘毡榇嬖谟谌说亩喾N代謝酶之中，并且參與調(diào)控代謝通路以及代謝酶的活性。其中在肝臟這樣的代謝中就存在著多種代謝酶被高度乙酰化。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質(zhì)的活性。

蛋白質(zhì)乙?；揎椊M學(xué)技術(shù)：乙酰化修飾是體內(nèi)保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾，對細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著重要的作用。此外，還存在的非組蛋白乙?；揎梾⑴c了代謝通路及代謝酶活性的調(diào)節(jié)。采用肽段預(yù)分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙酰化鑒定的影響，再結(jié)合免疫共沉淀通過抗體富集乙?；碾亩?，從而實現(xiàn)乙酰化的鑒定及定量。樣品要求：1、SDS-PAGE條帶：5個以上可見考染條帶。2、溶液（目標(biāo)蛋白質(zhì)）：目標(biāo)蛋白總量>50μg，目標(biāo)蛋白濃度>80%。3、溶液（大規(guī)模混合蛋白質(zhì)）：蛋白總量>1mg，蛋白濃度>1μg/μl。蛋白質(zhì)糖基化是一種常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾。廣州棕櫚?；揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)分析研究

蛋白質(zhì)的翻譯后修飾調(diào)控著底物的酶活性、功能以及三級結(jié)構(gòu)的變化。廣州棕櫚?；揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)分析研究

翻譯后修飾蛋白組分析：蛋白質(zhì)翻譯后修飾是影響蛋白質(zhì)功能并調(diào)節(jié)整個細(xì)胞過程的重要方式，幾乎在每個細(xì)胞過程中都是不可或缺的。分析和鑒定翻譯后修飾蛋白質(zhì)對揭示蛋白質(zhì)的功能和深入了解各種生理現(xiàn)象具有重要意義。大多數(shù)翻譯后修飾蛋白以低化學(xué)計量和豐度存在，這限制了在分析全細(xì)胞裂解液時對其的檢測。因此，要在蛋白質(zhì)組學(xué)的范圍內(nèi)表征翻譯后修飾蛋白，純化方法是必要的，以分離修飾蛋白和肽段，然后再進行后續(xù)分析。后續(xù)分析一般采用質(zhì)譜技術(shù)進行，可以對翻譯后修飾蛋白組進行定性和定量研究。廣州棕櫚?；揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)分析研究

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