深圳氧化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析

蛋白質(zhì)翻譯后修飾：蛋白質(zhì)的翻譯后修飾通過(guò)可逆的共價(jià)鍵將小分子或蛋白質(zhì)與底物蛋白質(zhì)上特定的氨基酸結(jié)合，調(diào)控著底物的酶活性、功能以及三級(jí)結(jié)構(gòu)的變化。各種蛋白質(zhì)翻譯后修飾在信號(hào)通路和網(wǎng)絡(luò)中發(fā)揮著重要的作用，翻譯后修飾系統(tǒng)的紊亂將導(dǎo)致一系列疾病的發(fā)生。通過(guò)實(shí)驗(yàn)的方法鑒定蛋白質(zhì)翻譯后修飾的位點(diǎn)需要耗費(fèi)大量的資金和時(shí)間，并且酶反應(yīng)的優(yōu)化常常難以實(shí)現(xiàn)。而計(jì)算的方法則能夠快速、準(zhǔn)確的預(yù)測(cè)酶特異性的底物蛋白質(zhì)及其修飾位點(diǎn)。蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)磷酸化修飾具有簡(jiǎn)單的特性。深圳氧化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析

蛋白磷酸化修飾過(guò)程：蛋白磷酸化修飾這一過(guò)程是通過(guò)蛋白激酶催化，將磷酸基團(tuán)從ATP轉(zhuǎn)移到多肽底物的絲氨酸、蘇氨酸，或酪氨酸殘基上。并且磷酸化修飾的過(guò)程是可逆的，去磷酸化反應(yīng)由蛋白磷酸酶催化完成。蛋白磷酸化檢測(cè)方法：Western Blot檢測(cè)方法：Western Blot是檢測(cè)蛋白磷酸化水平的常用方法，主要過(guò)程為先利用SDS-PAGE分離蛋白質(zhì)，隨后將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到PVDF膜上，然后使用特異性識(shí)別磷酸化蛋白的抗體來(lái)鑒定目標(biāo)蛋白的磷酸化水平。只有被磷酸化修飾的蛋白才會(huì)在相應(yīng)分子質(zhì)量的地方顯現(xiàn)特異性蛋白條帶。貴陽(yáng)蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)研究蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)具有全方面性。

乙?；揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)分析：乙?；揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)分析是指從蛋白質(zhì)組學(xué)的水平分析蛋白質(zhì)乙酰化修飾，包括乙酰化蛋白質(zhì)的鑒定和定量。提供基于質(zhì)譜的乙酰化蛋白組研究服務(wù)。蛋白質(zhì)乙?；ńM蛋白乙?；头墙M蛋白乙酰化。組蛋白乙酰化主要是賴氨酸乙?；言诨蜣D(zhuǎn)錄調(diào)控作用方面被普遍的研究。非組蛋白乙酰化構(gòu)成了哺乳動(dòng)物細(xì)胞中乙?；鞍椎闹饕糠?，參與了所有主要生物過(guò)程，包括蛋白質(zhì)的定位、轉(zhuǎn)移、功能和降解，遺傳物質(zhì)的轉(zhuǎn)錄和復(fù)制等。除了重要的生物學(xué)功能以外，乙?；鞍踪|(zhì)及其調(diào)控酶還與衰老和多種疾病（如神經(jīng)變形紊亂、心血管疾病等）緊密相關(guān)。因此，對(duì)乙酰化修飾蛋白質(zhì)組進(jìn)行研究有助于進(jìn)一步探索細(xì)胞的生命活動(dòng)與了解相關(guān)疾病的發(fā)病機(jī)制。

蛋白質(zhì)修飾位點(diǎn)分析：基于LC-MS/MS分析能夠精確測(cè)定蛋白質(zhì)或多肽分子質(zhì)量這一特性，從而檢測(cè)蛋白質(zhì)或者多肽上位點(diǎn)發(fā)生何種修飾?？蓹z測(cè)修飾類型如下： 磷酸化、糖基化、乙?；⒎核鼗?、丙?；?、丁?；⒈；?、戊二?；㈢牾；?、單甲基化、二甲基化、三甲基化。1、磷酸化：信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞周期、生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)理等；2、糖基化：蛋白質(zhì)折疊、更新以及免疫應(yīng)答等；3、乙?；夯虮磉_(dá)調(diào)控、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞代謝、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性以及神經(jīng)退行性的病變等；4、泛素化：細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA修復(fù)以及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等；5、甲基化：染色質(zhì)結(jié)構(gòu)及轉(zhuǎn)錄調(diào)控等；6、丙?；?/ 丙二酰化 / 戊二?；?/ 琥珀酰化：主要存在于線粒體和細(xì)菌中，與代謝過(guò)程密切相關(guān)。蛋白質(zhì)翻譯后修飾有什么生物學(xué)意義？

蛋白質(zhì)乙?；揎椊M學(xué)技術(shù)：乙?；揎検求w內(nèi)保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾，對(duì)細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著重要的作用。此外，還存在的非組蛋白乙?；揎梾⑴c了代謝通路及代謝酶活性的調(diào)節(jié)。采用肽段預(yù)分離降低高豐度組蛋白對(duì)蛋白乙?；b定的影響，再結(jié)合免疫共沉淀通過(guò)抗體富集乙?；碾亩?，從而實(shí)現(xiàn)乙酰化的鑒定及定量。樣品要求：1、SDS-PAGE條帶：5個(gè)以上可見考染條帶。2、溶液（目標(biāo)蛋白質(zhì)）：目標(biāo)蛋白總量>50μg，目標(biāo)蛋白濃度>80%。3、溶液（大規(guī)?；旌系鞍踪|(zhì)）：蛋白總量>1mg，蛋白濃度>1μg/μl。蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)磷酸化修飾具有可逆的特性。貴陽(yáng)蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)研究

蛋白質(zhì)翻譯后修飾可以改變蛋白質(zhì)的物理、化學(xué)性質(zhì)。深圳氧化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析

蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)中磷酸化位點(diǎn)分析時(shí)應(yīng)該注意些什么問(wèn)題？覆蓋率：覆蓋率越高，檢測(cè)和鑒定含有修飾基團(tuán)的肽幾率就越大。修飾位點(diǎn)的占有率：被修飾的蛋白質(zhì)的百分比低，則檢測(cè)到修飾肽的機(jī)會(huì)會(huì)隨之減少。如果百分比較高（> 30％），則有助于識(shí)別修飾位點(diǎn)。棕櫚?；鞍仔揎椯|(zhì)譜鑒定方法：S-棕櫚?；闹饕δ苁谴龠M(jìn)蛋白質(zhì)與細(xì)胞膜的結(jié)合。蛋白質(zhì)可以由一個(gè)棕櫚?；M成，也可以與更多棕櫚基或與其他脂質(zhì)，如豆蔻?；?。由于對(duì)S-棕櫚?；鞍追治鋈匀痪哂刑魬?zhàn)性，由于S-棕櫚?；揎椀鞍讈喫揭约笆杷院蜐撛诓环€(wěn)定的硫代質(zhì)鏈的S-脂酰化肽?，F(xiàn)在常用的幾種方法可以捕獲S-脂酰化蛋白以及對(duì)目標(biāo)修飾蛋白進(jìn)行捕獲。深圳氧化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析

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