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轉(zhuǎn)錄組和m6A分析顯示精子發(fā)生相關(guān)基因的表達(dá)和選擇性剪接發(fā)生了改變[19]。YTHDC2可促進(jìn)靶基因的翻譯效率,并降低其mRNA的豐度,在精子發(fā)生過(guò)程中起關(guān)鍵作用。當(dāng)減數(shù)分裂開(kāi)始時(shí)YTHDC2表達(dá)上調(diào),YTHDC2敲除小鼠的生殖細(xì)胞沒(méi)有經(jīng)過(guò)偶線期的發(fā)育導(dǎo)致小鼠不育[20]。在DNA損傷反應(yīng)中,METTL3可促進(jìn)DNA聚合酶κ(Polκ)與核酸剪切修復(fù)途徑快速定位到UV引起的DNA損傷位點(diǎn),當(dāng)缺失METTL3時(shí),細(xì)胞無(wú)法迅速修復(fù)UV照射引起的突變,并且對(duì)UV照射更加敏感[25]。在淋巴細(xì)胞性小鼠過(guò)繼轉(zhuǎn)移模型中,Mettl3缺陷通過(guò)影響mRNAm6A修飾,降低SOCS家族mRNA衰減,增加mRNA和蛋白表達(dá)水平,從而抑制IL-7介導(dǎo)的STAT5活性和T細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)增殖和分化,進(jìn)而抑制腸炎的發(fā)生[21]。在肝中,METTL14通過(guò)調(diào)控pri-miRNA的m6A修飾,影響MiR-126的生成加工,從而抑制肝的轉(zhuǎn)移[22]。在乳腺細(xì)胞中,低氧刺激能促進(jìn)依賴(lài)低氧誘導(dǎo)因子HIF的ALKBH5的表達(dá),而ALKBH5過(guò)表達(dá)降低了NANOGmRNA的m6A修飾,從而穩(wěn)定mRNA提高NANOG的表達(dá)水平,終增加乳腺干細(xì)胞所占的比例[23]。此外,低氧誘導(dǎo)乳腺細(xì)胞中依賴(lài)ZNF217的NANOG和KLF4的mRNAm6A甲基化抑制,且ALKBH5敲除降低免疫缺陷小鼠乳腺的肺轉(zhuǎn)移[24]。在肺中。細(xì)胞的功能也是細(xì)胞生物學(xué)的研究重點(diǎn)之一。湖南裸鼠科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)
外泌體的功能外泌體可能作為細(xì)胞之間物質(zhì)和信號(hào)通訊的途徑,不同的細(xì)胞通過(guò)分泌攜帶不同組分的外泌體實(shí)現(xiàn)細(xì)胞間通訊,這些外泌體被受體細(xì)胞吸收,通過(guò)物質(zhì)交換或釋放內(nèi)含物實(shí)現(xiàn)物質(zhì)和信號(hào)的交流。外泌體與受體細(xì)胞的信息交流可能通過(guò)以下4種途徑實(shí)現(xiàn):外泌體表面膜蛋白質(zhì)被目的細(xì)胞表面的受體識(shí)別,從而靶細(xì)胞;外泌體在蛋白酶作用下產(chǎn)生的表面膜蛋白質(zhì)碎片可作為目的細(xì)胞表面受體的配體;外泌體脂膜可以與目的細(xì)胞膜融合,將蛋白質(zhì)和RNA等內(nèi)容物釋放進(jìn)去,此類(lèi)膜融合可能改變靶細(xì)胞的一些膜特性,例如脂質(zhì)和膜蛋白質(zhì)的密度及種類(lèi);目的細(xì)胞通過(guò)胞吞的形式攝入外泌體經(jīng)由以上幾種途徑,外泌體將其攜帶的生物信息運(yùn)輸?shù)街苓叞屑?xì)胞或經(jīng)血液等體液運(yùn)輸而被遠(yuǎn)處組織細(xì)胞攝取,進(jìn)而影響目的細(xì)胞的基本功能和基因表達(dá)。幾乎所有的細(xì)胞都可以在自發(fā)或在一定刺激條件下產(chǎn)生外泌體,不同的細(xì)胞產(chǎn)生的外泌體具有不同的功能,這些外泌體參與了一系列生理和病理過(guò)程,如發(fā)生與發(fā)展、抗原呈遞、免疫調(diào)節(jié)、組織愈合等。此外,外泌體與疾病的研究表明:外泌體可能在代謝性疾病的出現(xiàn)以及心血管健康中發(fā)揮作用。浙江裸鼠科研技術(shù)服務(wù)購(gòu)買(mǎi)實(shí)驗(yàn)干貨 | 分子克隆實(shí)驗(yàn)——無(wú)縫克隆。
建議按照2×106每孔的數(shù)量將293T細(xì)胞均勻鋪入。(2)第二天:在24小時(shí)之內(nèi),觀察293T細(xì)胞的匯合度在90%~95%之間時(shí),向其中加入DNA-脂質(zhì)體復(fù)合體,DNA-脂質(zhì)體復(fù)合體制備方法如下:a)輕輕混勻LipoMax,根據(jù)說(shuō)明書(shū)加入相應(yīng)量于500μlOpti-MEM無(wú)血清培養(yǎng)基中,混合均勻并置于室溫5分鐘。b)在500μlOpti-MEM無(wú)血清培養(yǎng)基中稀釋DNA,總質(zhì)量為15μg按照載體質(zhì)粒:psPAX2:=4:3:1的比例加入DNA。c)將稀釋后的LipoMax和稀釋后的DNA輕輕混勻,常溫靜置20分鐘,形成DNA-LipoMax復(fù)合體。(3)將DNA-LipoMax復(fù)合體輕柔地滴加至細(xì)胞培養(yǎng)皿中,輕輕搖晃培養(yǎng)皿混勻,放入細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。(4)病毒收集濃縮病毒:加入DNA-LipoMax復(fù)合體48小時(shí)后,收集病毒上清,同時(shí)加入10ml預(yù)溫的293T培養(yǎng)基到細(xì)胞培養(yǎng)皿中。將收集到的病毒上清存在4℃冰箱中;收集72小時(shí)病毒上清,與48小時(shí)病毒上清混在一起。將離心機(jī)溫度降溫到4℃,600g,離心5分鐘,去除其中的細(xì)胞碎片,上清液經(jīng)μm濾頭過(guò)濾,加入病毒濃縮液,配制濃縮病毒液。將濃縮后的病毒放于4℃冰箱搖床上,旋轉(zhuǎn)過(guò)夜。第二天,4度離心機(jī),3000~4000g離心15分鐘。棄掉上清液,加入1Xpbs或培養(yǎng)基重懸。
用途基因功能研究、免/殺傷/增殖等、抗體活性篩選(細(xì)胞水平的結(jié)合和阻斷)、CAR分子的殺傷活性評(píng)價(jià)。材料與儀器(以慢pMSCV載體為例)包含目的基因和eGFP-Tag的pMSCV質(zhì)粒、帶有eGFP-Tag的pMSCV空載質(zhì)粒、GAG質(zhì)粒、VSV質(zhì)粒、Puromycin、Polybrene、Lipo3000、HEK293T細(xì)胞、opti-MEM、DMEM、FBS、雙抗、μm的濾膜、熒光顯微鏡等。步驟1、基因的構(gòu)建1)根據(jù)目的基因mRNA編碼區(qū)設(shè)計(jì)引物,分別在引物兩端加入酶切位點(diǎn)EcoRI和BglII。2)從細(xì)胞中提取目的基因mRNA,然后逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,然后從cDNA里面用引物把目的基因的CDS區(qū)擴(kuò)增出來(lái)。PCR擴(kuò)增出帶有酶切位點(diǎn)的目的基因編碼區(qū)序列,連接至pMD19-T載體后轉(zhuǎn)化至感受態(tài)DH5α,分別進(jìn)行菌落PCR鑒定和酶切鑒定。3)使用EcoRI和BglII雙酶切下目的基因序列,電泳割膠回收純化,連接到pMSCV-eGFP載體。再次轉(zhuǎn)化到感受態(tài)DH5α,菌落PCR鑒定和酶切鑒定成功后,送至公司測(cè)序、鑒定。4)鑒定成功后,將質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至感受態(tài)DH5α中,并進(jìn)行無(wú)內(nèi)質(zhì)粒抽提。GAG質(zhì)粒和VSV質(zhì)粒同樣可以轉(zhuǎn)化至感受態(tài)DH5α中,并進(jìn)行無(wú)內(nèi)質(zhì)粒抽提。質(zhì)粒抽提后冷凍于-20℃保存。2、慢包裝1)使用DMEM完全培養(yǎng)基培養(yǎng)6cm皿HEK293T至匯合度為70~80%。動(dòng)物造模 | 膿毒癥造模方法之CLP造模法。
二甲苯Ⅰ、Ⅱ各15min至透明。(2)放入二甲苯和石蠟等量混合液處理15min,再放入石蠟Ⅰ、Ⅱ透蠟各50~60min。透蠟在恒溫箱內(nèi)進(jìn)行,箱內(nèi)溫度保持在55~60℃左右。4、包埋(1)用鑷子夾取蠟?zāi)T诰凭珶羯仙约訜?,并倒入少許從溫箱中取出的純石蠟。(2)再將鑷子在酒精燈上稍加熱,夾取材料將切面朝下放入蠟?zāi)V?,排列整齊,再放上包埋盒,輕輕倒入熔蠟。5、切片、展片、貼片(1)將包埋好的石蠟塊固定在切片機(jī)上,調(diào)整厚度調(diào)節(jié)器到所需的切片厚度,一般為4~6μm。(2)切下的組織薄片要放到加熱的水中燙平,再貼到載玻片上,放45℃恒溫箱中烘干。二、HE染色1、脫蠟、復(fù)水(1)保持水浴鍋溫度為60℃,將切片放入干燥的染色缸內(nèi),放入水浴鍋中,30min至蠟熔化。(2)石蠟切片經(jīng)二甲苯Ⅰ、Ⅱ脫蠟各5min,然后放入100%、95%、90%、80%、70%各級(jí)酒精溶液中各3~5min,再放入蒸餾水中3min,以便染料可以進(jìn)入組織。2、染色、脫水(1)切片放入蘇木精中染色約10~30min,用流水沖洗約15min,使切片顏色變藍(lán)。(2)將切片放入1%鹽酸乙醇液中褪色,幾秒后見(jiàn)切片變紅、顏色較淺即可,后將切片再放入流水中使其恢復(fù)藍(lán)色。(3)切片放入50%、70%、80%乙醇中各3~5min。健康的HEK 293T細(xì)胞,一般使用復(fù)蘇后10代以?xún)?nèi)的細(xì)胞進(jìn)行慢病毒的生產(chǎn),要求無(wú)菌以及支原體污染;廣西實(shí)驗(yàn)科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建
可以幫助科研人員深入理解疾病的共同性,即不同物種之間存在的共有病理變化過(guò)程。湖南裸鼠科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)
3)基因/蛋白質(zhì)表達(dá)定性或定量檢測(cè)在進(jìn)行分子檢測(cè)的過(guò)程中,保持核酸和蛋白質(zhì)的完整性至關(guān)重要,因此在取樣過(guò)程中,應(yīng)盡量避免核酸及蛋白質(zhì)的降解。如不注意采樣過(guò)程,將會(huì)導(dǎo)致樣本中的核酸及蛋白質(zhì)的無(wú)差別降解,嚴(yán)重影響后續(xù)分子檢測(cè)結(jié)果。在條件允許的情況下,樣本在離體后應(yīng)立刻裝入凍存管內(nèi),并立即放入液氮中進(jìn)行冷凍。在RNA提取樣本的保存過(guò)程中,可以選擇非冷凍型RNA保存液或Trizol試劑進(jìn)行RNA酶的。針對(duì)蛋白質(zhì)提取樣本的保存,我們同樣可以使用商品化的蛋白酶劑進(jìn)行短期處理。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PolymeraseChnReaction,PCR)及免印跡(Westernblotting,WB),這兩種實(shí)驗(yàn)手段是分子學(xué)檢測(cè)中不可或缺的一部分,也是發(fā)表至關(guān)重要的分子檢測(cè)數(shù)據(jù)。PCR主要用來(lái)對(duì)基因在基因組層面或轉(zhuǎn)錄層面的變化進(jìn)行定性或定量檢測(cè),而WB則主要用來(lái)對(duì)某一蛋白質(zhì)的表達(dá)進(jìn)行定量檢測(cè)。(4)轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)及代謝組學(xué)檢測(cè)隨著檢測(cè)水平及相關(guān)產(chǎn)業(yè)的不斷發(fā)展,各類(lèi)組學(xué)檢測(cè)的價(jià)格降低,實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中也常常運(yùn)用組學(xué)檢測(cè)來(lái)提升實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的檔次。在我們進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組學(xué)及蛋白質(zhì)組學(xué)的檢測(cè)過(guò)程中,同樣是要首先確保目標(biāo)RNA或蛋白質(zhì)的片段完整性。湖南裸鼠科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)