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外泌體的抑制作用外泌體水平升高通常與不同類型的惡化相關(guān),一些研究人員希望能通過(guò)降低外泌體到正常水平來(lái)防止不良預(yù)后。從這個(gè)角度出發(fā),許多正在進(jìn)行的研究旨在通過(guò)調(diào)節(jié)外泌體生成分泌的過(guò)程或通過(guò)特異性靶向其成分抑制其與靶細(xì)胞的相互作用來(lái)調(diào)節(jié)外泌體的產(chǎn)生。如今我們對(duì)外泌體機(jī)制和不同生理和病理?xiàng)l件下的功能的理解呈指數(shù)級(jí)增長(zhǎng),雖然目前其生物學(xué)功能還未完全解析清楚,但研究者們?cè)谠S多領(lǐng)域均已對(duì)其進(jìn)行了深入探索。外泌體不是廢物顆粒,而是細(xì)胞間通訊的關(guān)鍵介質(zhì),作為宿主細(xì)胞的衛(wèi)星,外泌體包含大量的生物信息,其功能超出了初的預(yù)期,宿主細(xì)胞控制著外泌體的內(nèi)容物,從而改變了自己或其他細(xì)胞的命運(yùn)。其次,外泌體對(duì)的進(jìn)展和轉(zhuǎn)移有著強(qiáng)烈的影響,可以通過(guò)外泌體預(yù)測(cè)轉(zhuǎn)移的部位并建立轉(zhuǎn)移前的生態(tài)位。參考文獻(xiàn):[1]高方園,焦豐龍,張養(yǎng)軍,秦偉捷,錢小紅.外泌體分離技術(shù)及其臨床應(yīng)用研究進(jìn)展[J].色譜,2019,37。腫瘤細(xì)胞具有極強(qiáng)的增殖能力,在一個(gè)適宜,裸鼠成瘤是常見(jiàn)的驗(yàn)證腫瘤細(xì)胞體內(nèi)增殖模型。江蘇兔科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)
制作該模型的方法為大鼠腹腔麻醉消毒后選取腹部正中切口打開(kāi)腹腔長(zhǎng)約2cm,尋找盲腸,小心分離其遠(yuǎn)端與大腸的系膜,在盲腸遠(yuǎn)端1/2處用無(wú)菌4號(hào)絲線緊緊結(jié)扎,并用無(wú)菌7號(hào)針頭在已結(jié)扎盲腸遠(yuǎn)端處貫通穿刺,然后把盲腸推回腹腔,關(guān)閉腹腔。影響因素多數(shù)研究一致認(rèn)為盲腸結(jié)扎位置是CLP模型中死亡率和疾病嚴(yán)重程度的主要決定因素。結(jié)論為:①結(jié)扎25%或以下的盲腸死亡率幾乎為零,為輕度膿毒癥;②結(jié)扎50%~60%的盲腸導(dǎo)致術(shù)后死亡率為60%,為中度膿毒癥;③結(jié)扎75%或以上的盲腸導(dǎo)致小鼠在術(shù)后2~3d內(nèi)全部死亡,為重度膿毒癥。而在不同程度膿毒癥中,死亡主要集中在初的48h內(nèi)。有研究通過(guò)改變盲腸結(jié)扎位置和穿刺針直徑來(lái)調(diào)節(jié)膿毒癥的嚴(yán)重程度,其中提到與結(jié)扎長(zhǎng)度小于1cm的小鼠相比,結(jié)扎長(zhǎng)度超過(guò)1cm的小鼠死亡率增加至100%;增加穿刺針的直徑也使得存活率從100%(22G針)降低至55%(19G針)。結(jié)論為:在上述兩個(gè)因素中,盲腸結(jié)扎位置比針頭大小影響更為。CLP誘導(dǎo)的膿毒癥術(shù)后6h即可出現(xiàn)菌血癥,術(shù)后約12h出現(xiàn)膿毒癥相關(guān)臨床癥狀,包括發(fā)熱、寒戰(zhàn)、毛發(fā)豎立、全身無(wú)力和活動(dòng)減少等,術(shù)后18h開(kāi)始死亡??傊?,在制作CLP模型時(shí)。湖北疾病科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室在藥物研發(fā)過(guò)程中,科研人員可以通過(guò)對(duì)動(dòng)物模型進(jìn)行藥物處理,觀察其療效和副作用,為新藥的試驗(yàn)提供依據(jù)。
首先,預(yù)實(shí)驗(yàn)必須要當(dāng)做正式實(shí)驗(yàn)來(lái)對(duì)待(態(tài)度要放端正,這是必須的)。預(yù)實(shí)驗(yàn)的每一步都需要詳細(xì)規(guī)劃,多方籌謀。不論是實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的選擇,還是檢測(cè)試劑的購(gòu)買,都盡量和正式實(shí)驗(yàn)統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)。建議大家先把所有試劑和購(gòu)買完畢后,再去購(gòu)買實(shí)驗(yàn)動(dòng)物。因?yàn)閯?dòng)物會(huì)長(zhǎng)胖,長(zhǎng)胖后給劑量就要增加,不僅多花錢,并且還容易影響實(shí)驗(yàn)效果。筆者曾經(jīng)提前將實(shí)驗(yàn)動(dòng)物買回,但因?yàn)樘厥庠驔](méi)能購(gòu)買到造模,終只能忍痛割愛(ài)將動(dòng)物贈(zèng)送他人,白白虧了一筆血汗錢(那批老鼠在我這兒白吃白喝長(zhǎng)得太胖,沒(méi)辦法用作造模)。動(dòng)物及試劑購(gòu)買首先需要考慮:實(shí)驗(yàn)動(dòng)物品種、體重、性別、周齡(通常根據(jù)既往文獻(xiàn)報(bào)道可以獲得答案)、數(shù)量(需要考慮到實(shí)驗(yàn)有一定動(dòng)物死亡率或者動(dòng)物本身會(huì)打架互毆,因此需要提前購(gòu)買足夠的動(dòng)物)。動(dòng)物購(gòu)買的途徑、安置的地點(diǎn),飲食管理(一般實(shí)驗(yàn)室會(huì)有動(dòng)物房,也可以從其他地方購(gòu)買),動(dòng)物免證明、倫理證明需要提前準(zhǔn)備好。實(shí)驗(yàn)相關(guān)的試劑和:比如造模和,動(dòng)物干預(yù)所需,陽(yáng)性選擇及購(gòu)買(有些購(gòu)買很困難,必須通過(guò)特殊程序才能買到)。如果涉及到有創(chuàng)操作,要提前準(zhǔn)備好(建議提前購(gòu)買),手術(shù)。需要了解自身實(shí)驗(yàn)平臺(tái)能完成哪些技術(shù)。
圖2MAZTER-Seq實(shí)驗(yàn)流程圖圖3MAZTER-MINE分析m6A示意圖接下來(lái)作者便是要驗(yàn)證這一新方法的可行性了。在酵母中敲除IME4的情況下,檢測(cè)到的剪切效率高于野生型(剪切效率高低m6A水平),m6A抗體富集后的樣品剪切效率也低于未富集的Input組。整體水平可靠,那檢測(cè)的特異性位點(diǎn)是否準(zhǔn)確呢?作者也將該方法檢測(cè)到的新甲基化位點(diǎn)使用放射標(biāo)記層析檢測(cè),發(fā)現(xiàn)預(yù)測(cè)的位點(diǎn)準(zhǔn)確存在而且與剪切效率相符合。如圖5所示。而圖6中,作者則是與m6A抗體IP的方法進(jìn)行了比較,也證實(shí)了這一方法的可行性。圖5MAZTER-Seq檢測(cè)結(jié)果驗(yàn)證圖6MAZTER-Seq與m6A-Seq比較分析此外,后文中作者也在大規(guī)模的CRISPR-Cas9改變m6A狀態(tài)和酵母減數(shù)分裂模型中檢測(cè)了MAZTER-Seq這一系統(tǒng);并進(jìn)一步通過(guò)這一方法檢測(cè)了哺乳動(dòng)物不同細(xì)胞間m6A水平的保守性;也探究了去甲基化酶FTO對(duì)整體m6A甲基化水平的影響等。這里小編主要給大家分享這一新技術(shù),其他部分暫不過(guò)多分析了。新的技術(shù)能拓展我們的研究?jī)?nèi)容;對(duì)于這一技術(shù)。免疫沉淀技術(shù)是一種研究蛋白質(zhì)間交互作用的生物技術(shù)。
m6A修飾圖譜構(gòu)建及作用機(jī)制:通過(guò)m6A甲基化測(cè)序(MeRIP-Seq,miCLIP)構(gòu)建疾病細(xì)胞模型或者發(fā)病組織的m6A修飾譜,分析m6A的motif,peaks數(shù)量及分布,Peak關(guān)聯(lián)基因的特征,聯(lián)合RNA-seq研究m6A甲基化與表達(dá)的關(guān)系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機(jī)制,作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質(zhì)瘤增殖相關(guān)的FOXM1,通過(guò)qPCR、WB、免疫熒光、核質(zhì)分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實(shí)驗(yàn)證明ALKBH5通過(guò)去甲基化調(diào)節(jié)FOXM1在GSCs中的表達(dá)。為研究ALKBH5對(duì)FOXM1的作用是否受其他因子的調(diào)節(jié),作者研究了FOXM1的鄰近基因,發(fā)現(xiàn)lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補(bǔ),且共表達(dá)、共定位,進(jìn)一步通過(guò)RIP,RNApulldown等實(shí)驗(yàn)證明lncRNAFOXM1-AS促進(jìn)ALKBH5和FOXM1初級(jí)轉(zhuǎn)錄本的相互作用。通過(guò)細(xì)胞實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達(dá)和細(xì)胞增殖,從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細(xì)胞中m6A修飾的特征和基因表達(dá)的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進(jìn)了人類癥的發(fā)生。傳統(tǒng)的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化,組蛋白修飾和染色質(zhì)重構(gòu)。近。免疫系統(tǒng),人體的免疫系統(tǒng)由免疫細(xì)胞、免疫分子構(gòu)成。湖北疾病科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室
動(dòng)物疾病模型還為新藥研發(fā)和疫苗測(cè)試提供了有效的平臺(tái)。江蘇兔科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)
轉(zhuǎn)錄組和m6A分析顯示精子發(fā)生相關(guān)基因的表達(dá)和選擇性剪接發(fā)生了改變[19]。YTHDC2可促進(jìn)靶基因的翻譯效率,并降低其mRNA的豐度,在精子發(fā)生過(guò)程中起關(guān)鍵作用。當(dāng)減數(shù)分裂開(kāi)始時(shí)YTHDC2表達(dá)上調(diào),YTHDC2敲除小鼠的生殖細(xì)胞沒(méi)有經(jīng)過(guò)偶線期的發(fā)育導(dǎo)致小鼠不育[20]。在DNA損傷反應(yīng)中,METTL3可促進(jìn)DNA聚合酶κ(Polκ)與核酸剪切修復(fù)途徑快速定位到UV引起的DNA損傷位點(diǎn),當(dāng)缺失METTL3時(shí),細(xì)胞無(wú)法迅速修復(fù)UV照射引起的突變,并且對(duì)UV照射更加敏感[25]。在淋巴細(xì)胞性小鼠過(guò)繼轉(zhuǎn)移模型中,Mettl3缺陷通過(guò)影響mRNAm6A修飾,降低SOCS家族mRNA衰減,增加mRNA和蛋白表達(dá)水平,從而抑制IL-7介導(dǎo)的STAT5活性和T細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)增殖和分化,進(jìn)而抑制腸炎的發(fā)生[21]。在肝中,METTL14通過(guò)調(diào)控pri-miRNA的m6A修飾,影響MiR-126的生成加工,從而抑制肝的轉(zhuǎn)移[22]。在乳腺細(xì)胞中,低氧刺激能促進(jìn)依賴低氧誘導(dǎo)因子HIF的ALKBH5的表達(dá),而ALKBH5過(guò)表達(dá)降低了NANOGmRNA的m6A修飾,從而穩(wěn)定mRNA提高NANOG的表達(dá)水平,終增加乳腺干細(xì)胞所占的比例[23]。此外,低氧誘導(dǎo)乳腺細(xì)胞中依賴ZNF217的NANOG和KLF4的mRNAm6A甲基化抑制,且ALKBH5敲除降低免疫缺陷小鼠乳腺的肺轉(zhuǎn)移[24]。在肺中。江蘇兔科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)