圖2MAZTER-Seq實(shí)驗(yàn)流程圖圖3MAZTER-MINE分析m6A示意圖接下來(lái)作者便是要驗(yàn)證這一新方法的可行性了。在酵母中敲除IME4的情況下,檢測(cè)到的剪切效率高于野生型(剪切效率高低m6A水平),m6A抗體富集后的樣品剪切效率也低于未富集的Input組。整體水平可靠,那檢測(cè)的特異性位點(diǎn)是否準(zhǔn)確呢?作者也將該方法檢測(cè)到的新甲基化位點(diǎn)使用放射標(biāo)記層析檢測(cè),發(fā)現(xiàn)預(yù)測(cè)的位點(diǎn)準(zhǔn)確存在而且與剪切效率相符合。如圖5所示。而圖6中,作者則是與m6A抗體IP的方法進(jìn)行了比較,也證實(shí)了這一方法的可行性。圖5MAZTER-Seq檢測(cè)結(jié)果驗(yàn)證圖6MAZTER-Seq與m6A-Seq比較分析此外,后文中作者也在大規(guī)模的CRISPR-Cas9改變m6A狀態(tài)和酵母減數(shù)分裂模型中檢測(cè)了MAZTER-Seq這一系統(tǒng);并進(jìn)一步通過這一方法檢測(cè)了哺乳動(dòng)物不同細(xì)胞間m6A水平的保守性;也探究了去甲基化酶FTO對(duì)整體m6A甲基化水平的影響等。這里小編主要給大家分享這一新技術(shù),其他部分暫不過多分析了。新的技術(shù)能拓展我們的研究?jī)?nèi)容;對(duì)于這一技術(shù)。慢病毒載體包含了包裝、轉(zhuǎn)染、穩(wěn)定整合所需要的遺傳信息。大鼠科研技術(shù)服務(wù)
用途基因功能研究、免/殺傷/增殖等、抗體活性篩選(細(xì)胞水平的結(jié)合和阻斷)、CAR分子的殺傷活性評(píng)價(jià)。材料與儀器(以慢pMSCV載體為例)包含目的基因和eGFP-Tag的pMSCV質(zhì)粒、帶有eGFP-Tag的pMSCV空載質(zhì)粒、GAG質(zhì)粒、VSV質(zhì)粒、Puromycin、Polybrene、Lipo3000、HEK293T細(xì)胞、opti-MEM、DMEM、FBS、雙抗、μm的濾膜、熒光顯微鏡等。步驟1、基因的構(gòu)建1)根據(jù)目的基因mRNA編碼區(qū)設(shè)計(jì)引物,分別在引物兩端加入酶切位點(diǎn)EcoRI和BglII。2)從細(xì)胞中提取目的基因mRNA,然后逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,然后從cDNA里面用引物把目的基因的CDS區(qū)擴(kuò)增出來(lái)。PCR擴(kuò)增出帶有酶切位點(diǎn)的目的基因編碼區(qū)序列,連接至pMD19-T載體后轉(zhuǎn)化至感受態(tài)DH5α,分別進(jìn)行菌落PCR鑒定和酶切鑒定。3)使用EcoRI和BglII雙酶切下目的基因序列,電泳割膠回收純化,連接到pMSCV-eGFP載體。再次轉(zhuǎn)化到感受態(tài)DH5α,菌落PCR鑒定和酶切鑒定成功后,送至公司測(cè)序、鑒定。4)鑒定成功后,將質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至感受態(tài)DH5α中,并進(jìn)行無(wú)內(nèi)質(zhì)粒抽提。GAG質(zhì)粒和VSV質(zhì)粒同樣可以轉(zhuǎn)化至感受態(tài)DH5α中,并進(jìn)行無(wú)內(nèi)質(zhì)粒抽提。質(zhì)粒抽提后冷凍于-20℃保存。2、慢包裝1)使用DMEM完全培養(yǎng)基培養(yǎng)6cm皿HEK293T至匯合度為70~80%。云南動(dòng)物科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建飼養(yǎng)動(dòng)物及干預(yù) 動(dòng)物購(gòu)買后需要將時(shí)間節(jié)點(diǎn)提前規(guī)劃好。
科手術(shù)設(shè)備|細(xì)胞/組織支持系統(tǒng)|膜片鉗|輔助設(shè)備|其它常用耗材燒杯|漏斗|量筒|廣口罐|研缽和研杵|手套|移液管|移液器(Pipette)單道手動(dòng)移液器|單道電動(dòng)移液器|多道手動(dòng)移液器多道電動(dòng)移液器|正置換移液器|瓶口分液器吸頭(Tips)濾芯吸頭(滅菌)|濾芯吸頭(未滅菌)|普通吸頭(滅菌)普通吸頭(未滅菌)|多道移液器吸頭液體工作站吸頭|其它瓶(Bottle)離心瓶|稱量瓶|存儲(chǔ)瓶|比重瓶|血清瓶|滴瓶吸氣瓶|細(xì)胞培養(yǎng)瓶|培養(yǎng)基瓶|其它瓶(Flask)藍(lán)蓋瓶|燒瓶|平底燒瓶|克氏(長(zhǎng)頸)燒瓶|碘測(cè)定燒瓶|蒸餾燒瓶|容量瓶|過濾瓶|其它管(Tube&Vial)離心管|微離心管|樣品儲(chǔ)存管|凍存管|反應(yīng)管聚乙烯保存管|細(xì)胞培養(yǎng)管|自動(dòng)上樣管|其它PCR耗材PCR管|PCR條板|PCR板|實(shí)時(shí)定量PCR毛細(xì)管其它微孔板微孔板(96孔)|微孔板(384孔)|微孔板。
采用opti-MEM和Lipo3000分別轉(zhuǎn)染含有目的基因的pMSCV-eGFP、VSV、GAG質(zhì)粒及對(duì)照載體,每皿加入脂質(zhì)體-質(zhì)粒轉(zhuǎn)染混懸液按購(gòu)買脂質(zhì)體相關(guān)說明書操作定量。繼續(xù)培養(yǎng)24h。2)24小時(shí)后,將培養(yǎng)基更換為新鮮的DMEM完全培養(yǎng)基,放進(jìn)細(xì)胞培養(yǎng)箱繼續(xù)培養(yǎng)48~72h。3)48~72h后收集上層培養(yǎng)液,并過μm濾膜,采用ELISA法對(duì)所獲得的慢載體進(jìn)行滴度測(cè)定。如不及時(shí)使用可以凍存于-80℃。3、慢轉(zhuǎn)染1)轉(zhuǎn)染前1天將細(xì)胞接種6孔培養(yǎng)板,時(shí)細(xì)胞的融合率約為50%,前需換液,加入1mLDMEM完全培養(yǎng)基。2)冰浴融化后加入相應(yīng)體積的液及聚凝胺(Polybrene),混勻后放入37℃孵箱中繼續(xù)培養(yǎng)3)4h后補(bǔ)充1mL培養(yǎng)基,14h后換液(24h內(nèi)換液即可)。4)72h后用倒置顯微鏡觀察熒光,監(jiān)測(cè)效率,出現(xiàn)較多熒光時(shí)將等量的轉(zhuǎn)染細(xì)胞和未轉(zhuǎn)染細(xì)胞分別加入等濃度Puromycin(Puromycin或其他篩選濃度需要事先摸索)。5)待未轉(zhuǎn)染細(xì)胞全部死亡并且可觀察到滿意熒光量時(shí),降低Puromycin濃度培養(yǎng)。也可以挑去單克隆細(xì)胞株進(jìn)行進(jìn)一步培養(yǎng),以得到滿意的穩(wěn)定表達(dá)目的基因的細(xì)胞株。6)使用qRT-PCR和Westernblot的方法檢測(cè)目的基因的表達(dá)量和蛋白水平是否顯著提高。7)由此可得三組細(xì)胞株:a.正常細(xì)胞株;b.空載載體的細(xì)胞株。細(xì)胞核是細(xì)胞的控制中心,它包含了遺傳物質(zhì)DNA,控制著細(xì)胞的生長(zhǎng)和分裂。
膿毒癥動(dòng)物模型必須具備以下基本要素:有膿毒癥典型的高排低阻血流動(dòng)力學(xué)表現(xiàn)和高代謝狀態(tài);伴發(fā)多個(gè)功能障礙;有較高的自然死亡率,根據(jù)膿毒癥的轉(zhuǎn)歸,要求動(dòng)物模型的自然死亡率達(dá)到50%~70%;膿毒癥是嚴(yán)重引起機(jī)體的炎癥反應(yīng)過度造成的自身?yè)p傷,不是細(xì)菌和內(nèi)對(duì)機(jī)體的直接損傷,故出現(xiàn)功能障礙及動(dòng)物死亡距膿毒癥模型制備應(yīng)有一定的時(shí)間間距。一般在制模后6~12h后發(fā)生的功能障礙或死亡屬全身炎癥反應(yīng)所致。實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的選擇在制作動(dòng)物模型時(shí)多選用雄性小鼠,因?yàn)榇菩孕∈筝^雄性小鼠更能耐受膿毒癥和失血性休克,且進(jìn)入發(fā)期的雌性小鼠性水平變化很大,而雄性小鼠在膿毒癥時(shí)更易于發(fā)生免疫抑制。為什么選擇CLP模型?盲腸結(jié)扎穿孔模型(CLP)模型是接近于人類膿毒癥機(jī)制的模型,被稱為膿毒癥模型的“金標(biāo)準(zhǔn)”。CLP技術(shù)在20世紀(jì)70年代被建立。CLP模型非常適宜用于防治膿毒癥或膿毒性休克新藥的臨床前觀察造模方法CLP膿毒癥模型的建立主要分為兩個(gè)階段:盲腸遠(yuǎn)端結(jié)扎和盲腸穿刺。首先是手術(shù)引發(fā)的結(jié)扎部位組織變性壞死引起局部炎癥反應(yīng),其次是穿孔后使糞便內(nèi)容物漏入腹膜引起多菌性細(xì)菌性腹膜炎,進(jìn)而誘發(fā)全身性炎癥反應(yīng)。純干貨Western blot (WB)條帶灰度統(tǒng)計(jì)與GraphPad作圖.寧夏模式科研技術(shù)服務(wù)技術(shù)
ELISA試劑盒在國(guó)內(nèi)有許多種叫法,例如:ELISA檢測(cè)試劑盒、ELISAKit。大鼠科研技術(shù)服務(wù)
首先,預(yù)實(shí)驗(yàn)必須要當(dāng)做正式實(shí)驗(yàn)來(lái)對(duì)待(態(tài)度要放端正,這是必須的)。預(yù)實(shí)驗(yàn)的每一步都需要詳細(xì)規(guī)劃,多方籌謀。不論是實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的選擇,還是檢測(cè)試劑的購(gòu)買,都盡量和正式實(shí)驗(yàn)統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)。建議大家先把所有試劑和購(gòu)買完畢后,再去購(gòu)買實(shí)驗(yàn)動(dòng)物。因?yàn)閯?dòng)物會(huì)長(zhǎng)胖,長(zhǎng)胖后給劑量就要增加,不僅多花錢,并且還容易影響實(shí)驗(yàn)效果。筆者曾經(jīng)提前將實(shí)驗(yàn)動(dòng)物買回,但因?yàn)樘厥庠驔]能購(gòu)買到造模,終只能忍痛割愛將動(dòng)物贈(zèng)送他人,白白虧了一筆血汗錢(那批老鼠在我這兒白吃白喝長(zhǎng)得太胖,沒辦法用作造模)。動(dòng)物及試劑購(gòu)買首先需要考慮:實(shí)驗(yàn)動(dòng)物品種、體重、性別、周齡(通常根據(jù)既往文獻(xiàn)報(bào)道可以獲得答案)、數(shù)量(需要考慮到實(shí)驗(yàn)有一定動(dòng)物死亡率或者動(dòng)物本身會(huì)打架互毆,因此需要提前購(gòu)買足夠的動(dòng)物)。動(dòng)物購(gòu)買的途徑、安置的地點(diǎn),飲食管理(一般實(shí)驗(yàn)室會(huì)有動(dòng)物房,也可以從其他地方購(gòu)買),動(dòng)物免證明、倫理證明需要提前準(zhǔn)備好。實(shí)驗(yàn)相關(guān)的試劑和:比如造模和,動(dòng)物干預(yù)所需,陽(yáng)性選擇及購(gòu)買(有些購(gòu)買很困難,必須通過特殊程序才能買到)。如果涉及到有創(chuàng)操作,要提前準(zhǔn)備好(建議提前購(gòu)買),手術(shù)。需要了解自身實(shí)驗(yàn)平臺(tái)能完成哪些技術(shù)。大鼠科研技術(shù)服務(wù)