在分解細菌的作用下，再進一步轉(zhuǎn)化成了氨。被魚類吃掉的一部分經(jīng)過魚類的消化，也轉(zhuǎn)變成氨。殊途同歸的氨在分子態(tài)時是一種劇毒物質(zhì)。在硝化細菌的作用下，它會被轉(zhuǎn)化成亞鹽。亞鹽是一種不太穩(wěn)定的物質(zhì)。在高氧化還原電位的情況下，會被氧化成亞鹽。此時如果有反硝化細菌，鹽就會被轉(zhuǎn)化成N2從水中溢出。這樣，水體中的氮元素就完成了一個完整的轉(zhuǎn)化分離過程。 在實踐中，生物過濾的細菌需要適宜的條件才能起到相應的作用。如水體的溫度、PH、溶氧量、合適的碳氧化、殺菌劑等。因此，不僅要求其他系統(tǒng)設備與生物過濾器配套，更對操作者有一定的技術要求。
循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)作為一種新型養(yǎng)殖模式，通過一系列水處理單元將養(yǎng)殖池中產(chǎn)生的殘餌糞便、氨氮（TAN）、亞硝(xiao)酸鹽氮（NO2–N）等有害污染物加以去除,凈化養(yǎng)殖水體環(huán)境為目的，利用物理過濾、生物過濾、去除CO2、消毒、增氧、調(diào)溫等處理將凈化后的水體重新輸入養(yǎng)殖池的過程。其不僅可以解決水資源利用率低的問題，還可以為養(yǎng)殖生物提供穩(wěn)定可靠、舒適優(yōu)質(zhì)的生活環(huán)境，為高密度養(yǎng)殖提供了有利條件。
對于所有養(yǎng)殖石斑魚的養(yǎng)殖戶來說，能夠一下解決以上所有問題的方法就是采用室內(nèi)循環(huán)水養(yǎng)殖設備養(yǎng)殖石斑魚，室內(nèi)循環(huán)水養(yǎng)殖也稱工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖，能夠很好的避免低溫對養(yǎng)殖石斑魚的影響。循環(huán)水養(yǎng)殖設備能夠*大化改善養(yǎng)殖水的水質(zhì)問題，避免水體環(huán)境的惡化，降低有害病菌的滋生，保證石斑魚健康成長。